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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of intracellular HBMBPP-BTN2A1-BTN3A1 complex | |||||||||
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![]() | complex / immune / IMMUNE SYSTEM | |||||||||
機能・相同性 | ![]() Butyrophilin (BTN) family interactions / activated T cell proliferation / regulation of cytokine production / positive regulation of cytokine production / lipid metabolic process / positive regulation of type II interferon production / T cell receptor signaling pathway / adaptive immune response / external side of plasma membrane / signaling receptor binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.46 Å | |||||||||
![]() | Zheng J / Gao W / Zhu Y / Huang Z | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structure of intracellular HBMBPP-BTN2A1-BTN3A1 complex 著者: Zheng J / Gao W / Zhu Y / Huang Z | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 230 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15.2 KB 15.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 64.2 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 226.2 MB 226.2 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8zaaMC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.0773 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_39876_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_39876_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : BTN2A1-BTN3A1
全体 | 名称: BTN2A1-BTN3A1 |
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要素 |
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-超分子 #1: BTN2A1-BTN3A1
超分子 | 名称: BTN2A1-BTN3A1 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#2 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Butyrophilin subfamily 3 member A1
分子 | 名称: Butyrophilin subfamily 3 member A1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 26.462047 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: EQELREMAWS TMKQEQSTRV KLLEELRWRS IQYASRGERH SAYNEWKKAL FKPADVILDP KTANPILLVS EDQRSVQRAK EPQDLPDNP ERFNWHYCVL GCESFISGRH YWEVEVGDRK EWHIGVCSKN VQRKGWVKMT PENGFWTMGL TDGNKYRTLT E PRTNLKLP ...文字列: EQELREMAWS TMKQEQSTRV KLLEELRWRS IQYASRGERH SAYNEWKKAL FKPADVILDP KTANPILLVS EDQRSVQRAK EPQDLPDNP ERFNWHYCVL GCESFISGRH YWEVEVGDRK EWHIGVCSKN VQRKGWVKMT PENGFWTMGL TDGNKYRTLT E PRTNLKLP KTPKKVGVFL DYETGDISFY NAVDGSHIHT FLDVSFSEAL YPVFRILTLE PTALTICPA UniProtKB: Butyrophilin subfamily 3 member A1 |
-分子 #2: Butyrophilin subfamily 2 member A1
分子 | 名称: Butyrophilin subfamily 2 member A1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 30.227328 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: WINKLQKEKK ILSGEKEFER ETREIALKEL EKERVQKEEE LQVKEKLQEE LRWRRTFLHA VDVVLDPDTA HPDLFLSEDR RSVRRCPFR HLGESVPDNP ERFDSQPCVL GRESFASGKH YWEVEVENVI EWTVGVCRDS VERKGEVLLI PQNGFWTLEM H KGQYRAVS ...文字列: WINKLQKEKK ILSGEKEFER ETREIALKEL EKERVQKEEE LQVKEKLQEE LRWRRTFLHA VDVVLDPDTA HPDLFLSEDR RSVRRCPFR HLGESVPDNP ERFDSQPCVL GRESFASGKH YWEVEVENVI EWTVGVCRDS VERKGEVLLI PQNGFWTLEM H KGQYRAVS SPDRILPLKE SLCRVGVFLD YEAGDVSFYN MRDRSHIYTC PRSAFSVPVR PFFRLGCEDS PIFICPALTG AN GVTVPEE GLTLHRVGTH QSL UniProtKB: Butyrophilin subfamily 2 member A1 |
-分子 #3: 4-HYDROXY-3-METHYL BUTYL DIPHOSPHATE
分子 | 名称: 4-HYDROXY-3-METHYL BUTYL DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 3 / コピー数: 1 / 式: EIP |
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分子量 | 理論値: 264.107 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-EIP: |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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凍結 | 凍結剤: NITROGEN |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 50 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.5 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: NONE |
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最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.46 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 535747 |
初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |