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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | CryoEM structure of LonC protease S582A open hexamer with lysozyme | |||||||||
![]() | CryoEM map of LonC S582A open hexamer with AGS | |||||||||
![]() |
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![]() | Lon proteases / chaperone / open hexamer / lysozyme | |||||||||
機能・相同性 | ![]() endopeptidase La / ATP-dependent peptidase activity / protein catabolic process / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / ATP binding 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.23 Å | |||||||||
![]() | Li M / Hsieh K / Liu H / Zhang S / Gao Y / Gong Q / Zhang K / Chang C / Li S | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Bifurcated assembly pathway and dual function of a Lon-like protease revealed by cryo-EM Analysis 著者: Li M / Liu H / Hsieh KY / Zhang S / Gao Y / Gong Q / Zhang K / Chang CI / Li S | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 136.5 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 16.8 KB 16.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 46 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.7 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() | 69.3 MB 134 MB 134 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8k93MC ![]() 8k8vC ![]() 8k8wC ![]() 8k8xC ![]() 8k8yC ![]() 8k8zC ![]() 8k90C ![]() 8k91C ![]() 8k92C ![]() 8k94C ![]() 8k95C ![]() 8k96C ![]() 8k97C M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | CryoEM map of LonC S582A open hexamer with AGS | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.82 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-追加マップ: CryoEM map of LonC S582A open hexamer with AGS
ファイル | emd_36973_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | CryoEM map of LonC S582A open hexamer with AGS | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: CryoEM map of LonC S582A open hexamer with AGS
ファイル | emd_36973_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | CryoEM map of LonC S582A open hexamer with AGS | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: CryoEM map of LonC S582A open hexamer with AGS
ファイル | emd_36973_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | CryoEM map of LonC S582A open hexamer with AGS | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : CryoEM structure of LonC protease S582A open hexamer with lysozyme
全体 | 名称: CryoEM structure of LonC protease S582A open hexamer with lysozyme |
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要素 |
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-超分子 #1: CryoEM structure of LonC protease S582A open hexamer with lysozyme
超分子 | 名称: CryoEM structure of LonC protease S582A open hexamer with lysozyme タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 480 KDa |
-分子 #1: Endopeptidase La
分子 | 名称: Endopeptidase La / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO / EC番号: endopeptidase La |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 80.542352 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MRLSYEALEW RTPIENSTEP VSLPPPPPFF GQERAREALE LAIRGGFHAY LVGPPSLGKH EALLAYLSTQ SVETPPDLLY VPLSERKVA VLTLPSGQEI HLAEAVEGLL LEVNRLDELF RQGSFLREKT QLEARFKEAR EQQLEALRRE AQEAGFALST N GERLELTG ...文字列: MRLSYEALEW RTPIENSTEP VSLPPPPPFF GQERAREALE LAIRGGFHAY LVGPPSLGKH EALLAYLSTQ SVETPPDLLY VPLSERKVA VLTLPSGQEI HLAEAVEGLL LEVNRLDELF RQGSFLREKT QLEARFKEAR EQQLEALRRE AQEAGFALST N GERLELTG PGPVPAELSA RLEEVTLGSL AASAELEVAL RRLRRDWALH YLNNRFEPLF QRFPQARAYL EALRARLARY AE TGEPLDP AQWRPNLLTS SSSGTPPPIV YEPYATAPRL FGRLDYLVDR GVWSTNVSLI RPGAVHRAQG GYLILDALSL KRE GTWEAF KRALRNGQVE PVTEPQAPAG LEVEPFPIQM QVILVGTPEA FEGLEEDPAF SELFRIRAEF SPTLPASPEN CTAL GGWLL AQGFQLTQGG LTRLYDEARR MAEQRDRMDA RLVEIRALAE EAAVLGGGLL TAESVEQAIA AREHRSFLSE EEFLR AVQE GVIRLRTTGR AVGEVNSLVV VEAAPYWGRP ARLTARAAPG RDHLISIDRE AGLGGQIFHK AVLTLAGYLR SRYIEH GSL PVTISLAFEQ NYVSIEGDAA GLAELVAALS AIGNLPLRQD LAVTGAVDQT GKVLAVGAIN AKVEGFFRVC KALGLSG TQ GVILPEANLA NLTLRAEVLE AVRAGQFHIY AVETAEQALE ILAGARMEGF RGLQEKIRAG LEAFARLEEG HDKEDREK L AAALEHHHHH H UniProtKB: endopeptidase La |
-分子 #2: Monothiophosphate
分子 | 名称: Monothiophosphate / タイプ: ligand / ID: 2 / コピー数: 4 / 式: TS6 |
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分子量 | 理論値: 114.061 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-TS6: |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 1.0 mg/mL |
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緩衝液 | pH: 7.5 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 60.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.7 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.3 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |