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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1aj1 | |||||||||
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タイトル | NMR STRUCTURE OF THE LANTIBIOTIC ACTAGARDINE | |||||||||
要素 | LANTIBIOTIC ACTAGARDINE | |||||||||
キーワード | ANTIBIOTIC / LANTIBIOTIC / ANTIMICROBIAL / BACTERIOCIN / THIOESTER / TRANSMEMBRANE PORE | |||||||||
機能・相同性 | cytolysis / defense response to bacterium / signaling receptor binding / ACTAGARDINE / Lantibiotic actagardine 機能・相同性情報 | |||||||||
生物種 | Actinoplanes liguriensis (バクテリア) | |||||||||
手法 | 溶液NMR / DISTANCE GEOMETRY, ITERATIVE RELAXATION MATRIX REFINEMENT, RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS | |||||||||
データ登録者 | Zimmermann, N. / Jung, G. | |||||||||
引用 | ジャーナル: Eur.J.Biochem. / 年: 1997 タイトル: The three-dimensional solution structure of the lantibiotic murein-biosynthesis-inhibitor actagardine determined by NMR. 著者: Zimmermann, N. / Jung, G. #1: ジャーナル: Eur.J.Biochem. / 年: 1995 タイトル: The Tetracyclic Lantibiotic Actagardine. 1H-NMR and 13C-NMR Assignments and Revised Primary Structure 著者: Zimmermann, N. / Metzger, J.W. / Jung, G. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1aj1.cif.gz | 71.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1aj1.ent.gz | 48.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1aj1.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1aj1_validation.pdf.gz | 352.5 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1aj1_full_validation.pdf.gz | 411.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1aj1_validation.xml.gz | 6.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1aj1_validation.cif.gz | 9.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/aj/1aj1 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/aj/1aj1 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: NOESY |
-試料調製
試料状態 | pH: 3.0 / 温度: 296 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AMX2 600 / 製造業者: Bruker / モデル: AMX2 600 / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: DISTANCE GEOMETRY, ITERATIVE RELAXATION MATRIX REFINEMENT, RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATIONS, BEST RELAXATION MATRIX R- FACTORS 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |