登録情報 | データベース: PDB / ID: 5v49 |
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タイトル | Trypanosoma brucei methionyl-tRNA synthetase in complex with inhibitor (Chem 1917) |
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要素 | Methionyl-tRNA synthetase, putative |
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キーワード | Ligase/Ligase Inhibitor / synthetase / ligase / methionine / inhibitor / Ligase-Ligase Inhibitor complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
methionine-tRNA ligase / methionine-tRNA ligase activity / methionyl-tRNA aminoacylation / ciliary plasm / chloroplast stroma / mitochondrion / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Methionyl-trna Synthetase; domain 2 / Methionyl-trna Synthetase; domain 2 - #10 / Methionine-tRNA synthetase, type 2 / Anticodon binding domain of methionyl tRNA ligase / Methionyl-tRNA synthetase / Methioninyl-tRNA synthetase core domain / Methionyl-tRNA synthetase, anticodon-binding domain / Isoleucyl-tRNA Synthetase; Domain 1 / Isoleucyl-tRNA Synthetase; Domain 1 / Methionyl/Leucyl tRNA synthetase ...Methionyl-trna Synthetase; domain 2 / Methionyl-trna Synthetase; domain 2 - #10 / Methionine-tRNA synthetase, type 2 / Anticodon binding domain of methionyl tRNA ligase / Methionyl-tRNA synthetase / Methioninyl-tRNA synthetase core domain / Methionyl-tRNA synthetase, anticodon-binding domain / Isoleucyl-tRNA Synthetase; Domain 1 / Isoleucyl-tRNA Synthetase; Domain 1 / Methionyl/Leucyl tRNA synthetase / tRNA synthetases class I (M) / Aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia, anticodon-binding / HUPs / Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold / Beta Complex / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-8WA / METHIONINE / methionine--tRNA ligase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Trypanosoma brucei brucei (トリパノソーマ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.3 Å |
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データ登録者 | Barros-Alvarez, X. / Hol, W.G.J. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) | RO1 AI084004 and RO1 AI097177 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Bioorg. Med. Chem. Lett. / 年: 2017 タイトル: Optimization of a binding fragment targeting the "enlarged methionine pocket" leads to potent Trypanosoma brucei methionyl-tRNA synthetase inhibitors. 著者: Huang, W. / Zhang, Z. / Ranade, R.M. / Gillespie, J.R. / Barros-Alvarez, X. / Creason, S.A. / Shibata, S. / Verlinde, C.L.M.J. / Hol, W.G.J. / Buckner, F.S. / Fan, E. |
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履歴 | 登録 | 2017年3月8日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2017年7月26日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年11月22日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software / Item: _software.classification |
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改定 1.2 | 2019年12月11日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.3 | 2024年3月6日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id |
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