登録情報 | データベース: PDB / ID: 5mnr |
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タイトル | Thermolysin in complex with inhibitor JC256 |
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要素 | Thermolysin |
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キーワード | HYDROLASE / Inhibitor / Phosphonamidate / Protease |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
thermolysin / metalloendopeptidase activity / proteolysis / extracellular region / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Elastase; domain 1 - #10 / Elastase; domain 1 / : / PepSY domain / Peptidase propeptide and YPEB domain / Peptidase M4, C-terminal / FTP domain / Peptidase M4 domain / Peptidase M4 / Thermolysin metallopeptidase, catalytic domain ...Elastase; domain 1 - #10 / Elastase; domain 1 / : / PepSY domain / Peptidase propeptide and YPEB domain / Peptidase M4, C-terminal / FTP domain / Peptidase M4 domain / Peptidase M4 / Thermolysin metallopeptidase, catalytic domain / Thermolysin metallopeptidase, alpha-helical domain / Fungalysin/Thermolysin Propeptide Motif / Neutral Protease Domain 2 / Neutral Protease; domain 2 / Peptidase M4/M1, CTD superfamily / Neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding region signature. / Roll / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Bacillus thermoproteolyticus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.249 Å |
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データ登録者 | Cramer, J. / Krimmer, S.G. / Heine, A. / Klebe, G. |
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資金援助 | ドイツ, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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European Research Council | 268145-DrugProfilBind | ドイツ |
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引用 | ジャーナル: J. Med. Chem. / 年: 2017 タイトル: Paying the Price of Desolvation in Solvent-Exposed Protein Pockets: Impact of Distal Solubilizing Groups on Affinity and Binding Thermodynamics in a Series of Thermolysin Inhibitors. 著者: Cramer, J. / Krimmer, S.G. / Heine, A. / Klebe, G. |
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履歴 | 登録 | 2016年12月13日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2017年6月21日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年7月26日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.country / _citation.journal_id_ASTM ..._citation.country / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.2 | 2024年1月17日 | Group: Author supporting evidence / Data collection ...Author supporting evidence / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_audit_support / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_special_symmetry / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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