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Yorodumi- PDB-3u8m: Crystal structure of the acetylcholine binding protein (AChBP) fr... -
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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 3u8m | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Crystal structure of the acetylcholine binding protein (AChBP) from Lymnaea stagnalis in complex with NS3920 (1-(6-bromopyridin-3-yl)-1,4-diazepane) | ||||||
Components | Acetylcholine-binding protein | ||||||
Keywords | Acetylcholine-binding protein/agonist / Lymnaea stagnalis / agonist / Ligand-bindig domain / Acetylcholine / Acetylcholine-binding protein / Acetylcholine-binding protein-agonist complex | ||||||
| Function / homology | Function and homology informationsynaptic cleft / extracellular ligand-gated monoatomic ion channel activity / transmembrane signaling receptor activity / synapse / membrane Similarity search - Function | ||||||
| Biological species | ![]() | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.7 Å | ||||||
Authors | Rohde, L.A.H. / Ahring, P.K. / Jensen, M.L. / Nielsen, E.O. / Peters, D. / Helgstrand, C. / Krintel, C. / Harpsoe, K. / Gajhede, M. / Kastrup, J.S. / Balle, T. | ||||||
Citation | Journal: J.Biol.Chem. / Year: 2012Title: Intersubunit bridge formation governs agonist efficacy at nicotinic acetylcholine alpha 4 beta 2 receptors: unique role of halogen bonding revealed. Authors: Rohde, L.A. / Ahring, P.K. / Jensen, M.L. / Nielsen, E. / Peters, D. / Helgstrand, C. / Krintel, C. / Harpse, K. / Gajhede, M. / Kastrup, J.S. / Balle, T. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 3u8m.cif.gz | 1.4 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb3u8m.ent.gz | 1.2 MB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 3u8m.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 3u8m_validation.pdf.gz | 844.4 KB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 3u8m_full_validation.pdf.gz | 902.9 KB | Display | |
| Data in XML | 3u8m_validation.xml.gz | 84.1 KB | Display | |
| Data in CIF | 3u8m_validation.cif.gz | 120.4 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u8/3u8m ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u8/3u8m | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 3u8jC ![]() 3u8kC ![]() 3u8lC ![]() 3u8nC ![]() 1uw6S C: citing same article ( S: Starting model for refinement |
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| Similar structure data |
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Links
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
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X-RAY DIFFRACTION
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