登録情報 | データベース: PDB / ID: 3sgx |
---|
タイトル | Crystal Structure of E. coli undecaprenyl pyrophosphate synthase in complex with BPH-1100 |
---|
要素 | Undecaprenyl pyrophosphate synthase |
---|
キーワード | TRANSFERASE/TRANSFERASE Inhibitor / Alpha/beta / TRANSFERASE / TRANSFERASE-TRANSFERASE Inhibitor complex |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
Gram-negative-bacterium-type cell wall biogenesis / ditrans,polycis-undecaprenyl-diphosphate synthase [(2E,6E)-farnesyl-diphosphate specific] / di-trans,poly-cis-undecaprenyl-diphosphate synthase activity / polyprenol biosynthetic process / small molecule binding / peptidoglycan biosynthetic process / cell wall organization / regulation of cell shape / cell division / magnesium ion binding ...Gram-negative-bacterium-type cell wall biogenesis / ditrans,polycis-undecaprenyl-diphosphate synthase [(2E,6E)-farnesyl-diphosphate specific] / di-trans,poly-cis-undecaprenyl-diphosphate synthase activity / polyprenol biosynthetic process / small molecule binding / peptidoglycan biosynthetic process / cell wall organization / regulation of cell shape / cell division / magnesium ion binding / protein homodimerization activity / cytoplasm / cytosol類似検索 - 分子機能 Undecaprenyl pyrophosphate synthetase / Decaprenyl diphosphate synthase-like / Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase-like, conserved site / Undecaprenyl pyrophosphate synthase family signature. / Decaprenyl diphosphate synthase-like / Putative undecaprenyl diphosphate synthase / Decaprenyl diphosphate synthase-like superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-0FW / Ditrans,polycis-undecaprenyl-diphosphate synthase ((2E,6E)-farnesyl-diphosphate specific)類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.45 Å |
---|
データ登録者 | Cao, R. / Liu, Y.-L. / Oldfield, E. |
---|
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2013 タイトル: Antibacterial drug leads targeting isoprenoid biosynthesis. 著者: Zhu, W. / Zhang, Y. / Sinko, W. / Hensler, M.E. / Olson, J. / Molohon, K.J. / Lindert, S. / Cao, R. / Li, K. / Wang, K. / Wang, Y. / Liu, Y.L. / Sankovsky, A. / de Oliveira, C.A. / Mitchell, ...著者: Zhu, W. / Zhang, Y. / Sinko, W. / Hensler, M.E. / Olson, J. / Molohon, K.J. / Lindert, S. / Cao, R. / Li, K. / Wang, K. / Wang, Y. / Liu, Y.L. / Sankovsky, A. / de Oliveira, C.A. / Mitchell, D.A. / Nizet, V. / McCammon, J.A. / Oldfield, E. |
---|
履歴 | 登録 | 2011年6月15日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2012年12月19日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2013年1月16日 | Group: Database references |
---|
改定 1.2 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
|
---|