登録情報 | データベース: PDB / ID: 3qt8 |
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タイトル | Crystal structure of mutant S192A Staphylococcus epidermidis mevalonate diphosphate decarboxylase complexed with inhibitor 6-FMVAPP |
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要素 | Mevalonate diphosphate decarboxylase |
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キーワード | LYASE/LYASE INHIBITOR / GHMP kinase family / LYASE-LYASE INHIBITOR complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
diphosphomevalonate decarboxylase / diphosphomevalonate decarboxylase activity / isopentenyl diphosphate biosynthetic process, mevalonate pathway / kinase activity / ATP binding / cytosol類似検索 - 分子機能 : / Diphosphomevalonate decarboxylase-like N-terminal domain / Diphosphomevalonate decarboxylase / Mvd1, C-terminal / Mevalonate 5-diphosphate decarboxylase C-terminal domain / Diphosphomevalonate/phosphomevalonate decarboxylase / GHMP kinase, C-terminal domain / GHMP kinases N terminal domain / GHMP kinase, C-terminal domain superfamily / Ribosomal Protein S5; domain 2 - #10 ...: / Diphosphomevalonate decarboxylase-like N-terminal domain / Diphosphomevalonate decarboxylase / Mvd1, C-terminal / Mevalonate 5-diphosphate decarboxylase C-terminal domain / Diphosphomevalonate/phosphomevalonate decarboxylase / GHMP kinase, C-terminal domain / GHMP kinases N terminal domain / GHMP kinase, C-terminal domain superfamily / Ribosomal Protein S5; domain 2 - #10 / Ribosomal Protein S5; domain 2 / Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup / Ribosomal protein S5 domain 2-type fold / Alpha-Beta Plaits / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-FM0 / diphosphomevalonate decarboxylase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Staphylococcus epidermidis (表皮ブドウ球菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å |
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データ登録者 | Barta, M.L. / Skaff, A.D. / McWhorter, W.J. / Miziorko, H.M. / Geisbrecht, B.V. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2011 タイトル: Crystal structures of Staphylococcus epidermidis mevalonate diphosphate decarboxylase bound to inhibitory analogs reveal new insight into substrate binding and catalysis. 著者: Barta, M.L. / Skaff, D.A. / McWhorter, W.J. / Herdendorf, T.J. / Miziorko, H.M. / Geisbrecht, B.V. |
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履歴 | 登録 | 2011年2月22日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2011年5月11日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年11月23日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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