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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1vot | ||||||
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タイトル | ACETYLCHOLINESTERASE (E.C. 3.1.1.7) COMPLEXED WITH HUPERZINE A | ||||||
![]() | ACETYLCHOLINESTERASE | ||||||
![]() | HYDROLASE / NEUROTRANSMITTER CLEAVAGE | ||||||
機能・相同性 | ![]() acetylcholine catabolic process in synaptic cleft / acetylcholinesterase / acetylcholinesterase activity / choline metabolic process / side of membrane / synaptic cleft / synapse / extracellular space / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Raves, M.L. / Harel, M. / Silman, I. / Sussman, J.L. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of acetylcholinesterase complexed with the nootropic alkaloid, (-)-huperzine A. 著者: Raves, M.L. / Harel, M. / Pang, Y.P. / Silman, I. / Kozikowski, A.P. / Sussman, J.L. #1: ![]() タイトル: Mechanism of Inhibition of Cholinesterases by Huperzine A 著者: Ashani, Y. / Peggins III, J.O. / Doctor, B.P. #2: ![]() タイトル: Huperzine A--A Potent Acetylcholinesterase Inhibitor of Use in the Treatment of Alzheimer'S Disease 著者: Geib, S.J. / Tuckmantel, W. / Kozikowski, A.P. #3: ![]() タイトル: Atomic Structure of Acetylcholinesterase from Torpedo Californica: A Prototypic Acetylcholine-Binding Protein 著者: Sussman, J.L. / Harel, M. / Frolow, F. / Oefner, C. / Goldman, A. / Toker, L. / Silman, I. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 115.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 92.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 446.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 455.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 23.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 33.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 60736.516 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: INTER-MONOMER DISULFIDE BRIDGE / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-HUP / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.11 Å3/Da / 溶媒含有率: 70.07 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 5.8 / 詳細: pH 5.8 | ||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 273 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1993年10月1日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.92 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→40 Å / Num. obs: 44903 / % possible obs: 99.9 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 5.3 % / Rsym value: 0.096 / Net I/σ(I): 23.7 |
反射 シェル | 解像度: 2.3→2.35 Å / 冗長度: 5.4 % / Mean I/σ(I) obs: 3 / Rsym value: 0.575 / % possible all: 99.6 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 334827 / Rmerge(I) obs: 0.096 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 99.6 % / Rmerge(I) obs: 0.575 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1ACE ![]() 1ace 解像度: 2.5→8 Å / Rfactor Rfree error: 0.006 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0
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原子変位パラメータ | Biso mean: 23.62 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→8 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.5→2.61 Å / Rfactor Rfree error: 0.027
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Xplor file |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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LS精密化 シェル | *PLUS Rfactor Rwork: 0.3 |