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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bzf | ||||||
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タイトル | NMR SOLUTION STRUCTURE AND DYNAMICS OF THE COMPLEX OF LACTOBACILLUS CASEI DIHYDROFOLATE REDUCTASE WITH THE NEW LIPOPHILIC ANTIFOLATE DRUG TRIMETREXATE, 22 STRUCTURES | ||||||
要素 | DIHYDROFOLATE REDUCTASE | ||||||
キーワード | OXIDOREDUCTASE / INHIBITOR-ENZYME COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 response to methotrexate / dihydrofolate metabolic process / dihydrofolate reductase / dihydrofolate reductase activity / folic acid metabolic process / tetrahydrofolate biosynthetic process / one-carbon metabolic process / NADP binding / response to antibiotic / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Lactobacillus casei (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Polshakov, V.I. / Birdsall, B. / Frenkiel, T.A. / Gargaro, A.R. / Feeney, J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 1999 タイトル: Structure and dynamics in solution of the complex of Lactobacillus casei dihydrofolate reductase with the new lipophilic antifolate drug trimetrexate. 著者: Polshakov, V.I. / Birdsall, B. / Frenkiel, T.A. / Gargaro, A.R. / Feeney, J. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1998 タイトル: The Solution Structure of the Complex of Lactobacillus Casei Dihydrofolate Reductase with Methotrexate 著者: Gargaro, A.R. / Soteriou, A. / Frenkiel, T.A. / Bauer, C.J. / Birdsall, B. / Polshakov, V.I. / Barsukov, I.L. / Roberts, G.C. / Feeney, J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bzf.cif.gz | 1.1 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bzf.ent.gz | 929.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bzf.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bz/1bzf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bz/1bzf | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18331.594 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Lactobacillus casei (バクテリア) プラスミド: PMT702 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): NF1 / 参照: UniProt: P00381, dihydrofolate reductase |
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#2: 化合物 | ChemComp-TMQ / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 90% H2O/10% D2O, 100% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 550 mM / pH: 6.5 / 圧: 1 atm / 温度: 308 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITY / 製造業者: Varian / モデル: UNITY / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: NO NOE VIOLATION MORE THAN 0.1 ANGSTROM; NO DIHEDRAL ANGLE VIOLATION MORE THAN 3 DEGREES 計算したコンフォーマーの数: 22 / 登録したコンフォーマーの数: 22 |