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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1amt | ||||||
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タイトル | Crystal structure of alamethicin at 1.5 angstrom resolution | ||||||
要素 | ALAMETHICIN F30 | ||||||
キーワード | ANTIBIOTIC / ALAMETHICIN / PEPTAIBOL / ANTIBACTERIAL / ANTIFUNGAL | ||||||
機能・相同性 | Alamethicin / ACETONITRILE / METHANOL / : 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | TRICHODERMA VIRIDE (菌類) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.5 Å | ||||||
データ登録者 | Fox, R.O. / Richards, F.M. | ||||||
引用 | ジャーナル: Nature / 年: 1982 タイトル: A Voltage-Gated Ion Channel Model Inferred from the Crystal Structure of Alamethicin at 1.5-A Resolution. 著者: Fox Jr, R.O. / Richards, F.M. #1: ジャーナル: Thesis, Yale タイトル: The Crystal Structure of Alamethicin at 1.5 Angstroms Resolution 著者: Fox, R.O. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1amt.cif.gz | 19.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1amt.ent.gz | 16.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1amt.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1amt_validation.pdf.gz | 404.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1amt_full_validation.pdf.gz | 413.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1amt_validation.xml.gz | 4.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1amt_validation.cif.gz | 5.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/am/1amt ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/am/1amt | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | #2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-MOH / 構成要素の詳細 | ALAMETHICIN F30 IS LINEAR PEPTIDE, A MEMBER OF THE PEPTAIBOL FAMILY OF MEMBRANE CHANNEL FORMING ...ALAMETHICI | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.71 Å3/Da / 溶媒含有率: 28.2 % | |||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: unknown | |||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.5 Å |
-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.5→10 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.5→10 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.5 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. reflection obs: 5458 / Rfactor obs: 0.155 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 15 Å2 |