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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1amn | ||||||
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タイトル | TRANSITION STATE ANALOG: ACETYLCHOLINESTERASE COMPLEXED WITH M-(N,N,N-TRIMETHYLAMMONIO)TRIFLUOROACETOPHENONE | ||||||
要素 | ACETYLCHOLINESTERASE | ||||||
キーワード | HYDROLASE (SERINE ESTERASE) / HYDROLASE / SERINE ESTERASE / SYNAPSE / MEMBRANE / NERVE / MUSCLE / NEUROTRANSMITTER DEGRADATION / GLYCOPROTEIN / GPI-ANCHOR / ALTERNATIVE SPLICING | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 acetylcholine catabolic process in synaptic cleft / acetylcholinesterase / choline metabolic process / acetylcholinesterase activity / side of membrane / synaptic cleft / synapse / extracellular space / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Torpedo californica (エイ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.8 Å | ||||||
データ登録者 | Harel, M. / Silman, I. / Sussman, J.L. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 1996 タイトル: The X-ray structure of a transition state analog complex reveals the molecular origins of the catalytic power and substrate specificity of acetylcholinesterase. 著者: Harel, M. / Quinn, D.M. / Nair, H.K. / Silman, I. / Sussman, J.L. #1: ジャーナル: Science / 年: 1991 タイトル: Atomic Structure of Acetylcholinesterase from Torpedo Californica: A Prototypic Acetylcholine Binding Enzyme 著者: Sussman, J.L. / Harel, M. / Frolow, F. / Oefner, C. / Goldman, A. / Toker, L. / Silman, I. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1amn.cif.gz | 135.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1amn.ent.gz | 111 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1amn.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1amn_validation.pdf.gz | 754.5 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1amn_full_validation.pdf.gz | 772.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1amn_validation.xml.gz | 23.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1amn_validation.cif.gz | 32.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/am/1amn ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/am/1amn | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 104 |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 60736.516 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Torpedo californica (エイ) / 器官: ELECTRIC ORGAN / 参照: UniProt: P04058, acetylcholinesterase |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-NAF / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.21 Å3/Da / 溶媒含有率: 70.79 % |
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 Å |
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検出器 | タイプ: XENTRONICS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1993年5月15日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 25272 / % possible obs: 98 % / 冗長度: 3.08 % / Rmerge(I) obs: 0.118 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.8 Å / Rmerge(I) obs: 0.118 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.8→8 Å / σ(F): 0 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 22 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.8→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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