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タイトルTau filaments from amyotrophic lateral sclerosis/parkinsonism-dementia complex adopt the CTE fold.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 120, Issue 51, Page e2306767120, Year 2023
掲載日2023年12月19日
著者Chao Qi / Bert M Verheijen / Yasumasa Kokubo / Yang Shi / Stephan Tetter / Alexey G Murzin / Asa Nakahara / Satoru Morimoto / Marc Vermulst / Ryogen Sasaki / Eleonora Aronica / Yoshifumi Hirokawa / Kiyomitsu Oyanagi / Akiyoshi Kakita / Benjamin Ryskeldi-Falcon / Mari Yoshida / Masato Hasegawa / Sjors H W Scheres / Michel Goedert /
PubMed 要旨The amyotrophic lateral sclerosis/parkinsonism-dementia complex (ALS/PDC) of the island of Guam and the Kii peninsula of Japan is a fatal neurodegenerative disease of unknown cause that is ...The amyotrophic lateral sclerosis/parkinsonism-dementia complex (ALS/PDC) of the island of Guam and the Kii peninsula of Japan is a fatal neurodegenerative disease of unknown cause that is characterized by the presence of abundant filamentous tau inclusions in brains and spinal cords. Here, we used electron cryo-microscopy to determine the structures of tau filaments from the cerebral cortex of three cases of ALS/PDC from Guam and eight cases from Kii, as well as from the spinal cord of two of the Guam cases. Tau filaments had the chronic traumatic encephalopathy (CTE) fold, with variable amounts of Type I and Type II filaments. Paired helical tau filaments were also found in three Kii cases and tau filaments with the corticobasal degeneration fold in one Kii case. We identified a new Type III CTE tau filament, where protofilaments pack against each other in an antiparallel fashion. ALS/PDC is the third known tauopathy with CTE-type filaments and abundant tau inclusions in cortical layers II/III, the others being CTE and subacute sclerosing panencephalitis. Because these tauopathies are believed to have environmental causes, our findings support the hypothesis that ALS/PDC is caused by exogenous factors.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:38100415 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度2.0 - 3.6 Å
構造データ

EMDB-17171, PDB-8ot6:
CTE typeI tau filament from Guam ALS/PDC
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.0 Å

EMDB-17173, PDB-8ot9:
CTE typeIII tau filament from Guam ALS/PDC
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.4 Å

EMDB-17174, PDB-8otc:
CTE typeII tau filament from Guam ALS/PDC
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-17175, PDB-8otd:
TMEM106B Fold1-s filament from Guam ALS/PDC
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.6 Å

EMDB-17176, PDB-8ote:
TMEM106B Fold I-d filament from Guam ALS/PDC
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-17177, PDB-8otf:
Ab typeII filament from Guam ALS/PDC
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-17178, PDB-8otg:
CTE typeI tau filament from Kii ALS/PDC
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.1 Å

EMDB-17179, PDB-8oth:
TypeII tau filament from Kii ALS/PDC
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.4 Å

EMDB-17180, PDB-8oti:
CTE typeIII tau filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.7 Å

EMDB-17181, PDB-8otj:
PHF tau filament from Kii ALS/PDC
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.3 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / Tau filaments / Guam ALS/PDC / CTE typeI / CTE typeIII / CTE typeII / TMEM106B fold1-single filaments / TMEM106B / Ab typeII filaments / Tau filament / Kii ALS/PDC / TypeII tau filaments / PHF

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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