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Structure paper

タイトルStructural basis of odor sensing by insect heteromeric odorant receptors.
ジャーナル・号・ページScience, Vol. 384, Issue 6703, Page 1460-1467, Year 2024
掲載日2024年6月28日
著者Jiawei Zhao / Andy Q Chen / Jaewook Ryu / Josefina Del Mármol /
PubMed 要旨Most insects, including human-targeting mosquitoes, detect odors through odorant-activated ion channel complexes consisting of a divergent odorant-binding subunit (OR) and a conserved co-receptor ...Most insects, including human-targeting mosquitoes, detect odors through odorant-activated ion channel complexes consisting of a divergent odorant-binding subunit (OR) and a conserved co-receptor subunit (Orco). As a basis for understanding how odorants activate these heteromeric receptors, we report here cryo-electron microscopy structures of two different heteromeric odorant receptor complexes containing ORs from disease-vector mosquitos or . These structures reveal an unexpected stoichiometry of one OR to three Orco subunits. Comparison of structures in odorant-bound and unbound states indicates that odorant binding to the sole OR subunit is sufficient to open the channel pore, suggesting a mechanism of OR activation and a conceptual framework for understanding evolution of insect odorant receptor sensitivity.
リンクScience / PubMed:38870275 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.62 - 2.95 Å
構造データ

42848

8v00

EMDB-42848, PDB-8v00:
AaegOR10 apo structure
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.88 Å

42850

8v02

EMDB-42850, PDB-8v02:
AaegOR10 structure bound to o-cresol
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

42945

8v3c

EMDB-42945, PDB-8v3c:
AgamOR28 structure without ligand
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.62 Å

42946

8v3d

EMDB-42946, PDB-8v3d:
AgamOR28 structure bound to 2,4,5-trimethylthiazole
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.95 Å

化合物

ChemComp-JZ0:
o-cresol / o-クレゾ-ル

PDB-1afc:
STRUCTURAL STUDIES OF THE BINDING OF THE ANTI-ULCER DRUG SUCROSE OCTASULFATE TO ACIDIC FIBROBLAST GROWTH FACTOR

由来
  • aedes aegypti (ネッタイシマカ)
  • apocrypta bakeri (昆虫)
  • anopheles gambiae (ガンビエハマダラカ)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / Mosquito olfactory receptor / Mosquito olfactory receptor OR10 / Mosquitoes / Olfaction / Channel / Heterotetramer

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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