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タイトルBitter taste TAS2R14 activation by intracellular tastants and cholesterol.
ジャーナル・号・ページNature, Year 2024
掲載日2024年5月22日
著者Xiaolong Hu / Weizhen Ao / Mingxin Gao / Lijie Wu / Yuan Pei / Shenhui Liu / Yiran Wu / Fei Zhao / Qianqian Sun / Junlin Liu / Longquan Jiang / Xin Wang / Yan Li / Qiwen Tan / Jie Cheng / Fan Yang / Chi Yang / Jinpeng Sun / Tian Hua / Zhi-Jie Liu /
PubMed 要旨Bitter taste receptors, particularly TAS2R14, play central roles in discerning a wide array of bitter substances, ranging from dietary components to pharmaceutical agents. TAS2R14 is also widely ...Bitter taste receptors, particularly TAS2R14, play central roles in discerning a wide array of bitter substances, ranging from dietary components to pharmaceutical agents. TAS2R14 is also widely expressed in extragustatory tissues, suggesting its extra roles in diverse physiological processes and potential therapeutic applications. Here we present cryogenic electron microscopy structures of TAS2R14 in complex with aristolochic acid, flufenamic acid and compound 28.1, coupling with different G-protein subtypes. Uniquely, a cholesterol molecule is observed occupying what is typically an orthosteric site in class A G-protein-coupled receptors. The three potent agonists bind, individually, to the intracellular pockets, suggesting a distinct activation mechanism for this receptor. Comprehensive structural analysis, combined with mutagenesis and molecular dynamic simulation studies, elucidate the broad-spectrum ligand recognition and activation of the receptor by means of intricate multiple ligand-binding sites. Our study also uncovers the specific coupling modes of TAS2R14 with gustducin and G proteins. These findings should be instrumental in advancing knowledge of bitter taste perception and its broader implications in sensory biology and drug discovery.
リンクNature / PubMed:38776963
手法EM (単粒子)
解像度2.77 - 3.3 Å
構造データ

38580
EMDBエントリ 画像なし

EMDB-38580, PDB-8xql:
Structure of human class T GPCR TAS2R14-miniGs/gust complex with Aristolochic acid A.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.99 Å

38582
EMDBエントリ 画像なし

EMDB-38582, PDB-8xqn:
Structure of human class T GPCR TAS2R14-DNGi complex with Aristolochic acid A.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.05 Å

38583
EMDBエントリ 画像なし

EMDB-38583, PDB-8xqo:
Structure of human class T GPCR TAS2R14-Gi complex with Aristolochic acid A.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.77 Å

38584
EMDBエントリ 画像なし

EMDB-38584, PDB-8xqp:
Structure of human class T GPCR TAS2R14-Gustducin complex with Aristolochic acid A.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.29 Å

38586
EMDBエントリ 画像なし

EMDB-38586, PDB-8xqr:
Structure 2 of human class T GPCR TAS2R14-miniGs/gust complex with Flufenamic acid.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

38587
EMDBエントリ 画像なし

EMDB-38587, PDB-8xqs:
Structure of human class T GPCR TAS2R14-DNGi complex with Flufenamic acid.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

38588
EMDBエントリ 画像なし

EMDB-38588, PDB-8xqt:
Structure of human class T GPCR TAS2R14-Gi complex.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.94 Å

39376
EMDBエントリ 画像なし

EMDB-39376, PDB-8yky:
Structure of human class T GPCR TAS2R14-Ggustducin complex with agonist 28.1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.99 Å

化合物

ChemComp-GOQ:
8-methoxy-6-nitro-naphtho[1,2-e][1,3]benzodioxole-5-carboxylic acid

ChemComp-CLR:
CHOLESTEROL / コレステロ-ル

ChemComp-FLF:
2-[[3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO] BENZOIC ACID / フルフェナム酸 / 抗炎症剤, 阻害剤*YM

PDB-1aei:
CRYSTAL STRUCTURE OF THE ANNEXIN XII HEXAMER

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • synthetic construct (人工物)
  • clostridium perfringens (ウェルシュ菌)
キーワードSIGNALING PROTEIN / GPCR / Tas2R14 / miniGsg / GOQ / DNGi / Bitter receptor / Gi / Bitter Receptor. / Gustducin / GPCR Tas2R14 miniGsg FLF Bitter receptor / FLF / Ggustducin / 28.1 / TASTE RECEPTOR.

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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