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検索結果

検索 (著者・登録者: slotboom & dj)の結果全41件を表示しています

EMDB-50995:
Cryo-EM structure of SbmA in the inward-facing-wide conformation bound to 1 sybody
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Ettema TW, Slotboom DJ

EMDB-50997:
Cryo-EM structure of SbmA in the inward-facing-wide conformation
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Ettema TW, Slotboom DJ

EMDB-50994:
Cryo-EM structure of SbmA in the inward-facing-narrow conformation bound to 2 sybodies
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Ettema TW, Slotboom DJ

EMDB-50996:
Cryo-EM structure of SbmA in the inward-facing-wide conformation bound to 2 sybodies
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Ettema TW, Slotboom DJ

EMDB-50998:
Cryo-EM structure of SbmA in the inward-facing-occluded conformation in lipid nanodiscs
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Ettema TW, Slotboom DJ

EMDB-18621:
ASCT2 trimer in lipid nanodiscs with bound glutamine and Na+ ions in the outward-facing state (OFS)
手法: 単粒子 / : Borowska A, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-18622:
ASCT2 protomer in lipid nanodiscs with bound glutamine and Na+ ions in the outward-facing state (OFS.1)
手法: 単粒子 / : Borowska A, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-18623:
ASCT2 protomer in lipid nanodiscs with bound glutamine and Na+ ions in the outward-facing state (OFS.2)
手法: 単粒子 / : Borowska A, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-18624:
ASCT2 protomer in lipid nanodiscs with bound glutamine and Na+ ions in the outward-facing state (OFS.3)
手法: 単粒子 / : Borowska A, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-18625:
ASCT2 protomer in lipid nanodiscs with bound glutamine and Na+ ions in the intermediate outward-facing state (iOFS-up)
手法: 単粒子 / : Borowska A, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-18626:
ASCT2 protomer in lipid nanodiscs with bound glutamine and Na+ ions in the intermediate outward-facing state (iOFS-down)
手法: 単粒子 / : Borowska A, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-18627:
ASCT2 protomer in lipid nanodiscs under low Na+ concentration in the outward-facing state (OFS)
手法: 単粒子 / : Borowska A, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-18628:
ASCT2 protomer in lipid nanodiscs under low Na+ concentration in the intermediate outward-facing state (iOFS-up)
手法: 単粒子 / : Borowska A, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-16120:
Cryo-EM structure of the folate-specific ECF transporter complex in MSP2N2 lipid nanodiscs bound to ATP and ADP
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-16121:
Cryo-EM structure of the folate-specific ECF transporter complex in MSP2N2 lipid nanodiscs bound to AMP-PNP
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-16122:
Cryo-EM structure of the wild-type solitary ECF module in MSP2N2 lipid nanodiscs in the ATPase open and nucleotide-free conformation
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-16123:
Cryo-EM structure of the wild-type solitary ECF module in DDM micelles in the ATPase open and nucleotide-free conformation
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-16124:
Cryo-EM structure of the mutant solitary ECF module 2EQ in MSP2N2 lipid nanodiscs in the ATPase closed and ATP-bound conformation
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Rheinberger J, Paulino C, Slotboom DJ

EMDB-15393:
Cryo-EM structure of a substrate-bound glutamate transporter homologue GltTk encapsulated within a nanodisc
手法: 単粒子 / : Whittaker JJ, Guskov A

EMDB-12142:
ASCT2 in the presence of the inhibitor Lc-BPE in the outward-open conformation.
手法: 単粒子 / : Garibsingh RA, Ndaru E

EMDB-12143:
ASCT2 in the presence of the inhibitor ERA-21 in the outward-open conformation.
手法: 単粒子 / : Garibsingh RA, Ndaru E

EMDB-12314:
Structure of glutamate transporter homologue in complex with Sybody
手法: 単粒子 / : Arkhipova V, Slotboom DJ

EMDB-12483:
Cryo-EM structure of the folate-specific ECF transporter complex in DDM micelles
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Rheinberger J

EMDB-12484:
Cryo-EM structure of the folate-specific ECF transporter complex in MSP2N2 lipid nanodiscs
手法: 単粒子 / : Thangaratnarajah C, Rheinberger J

EMDB-12082:
Cryo-EM map of the SARS-CoV-2 spike protein in complex with sybody#15 and sybody#68 in a 3up conformation.
手法: 単粒子 / : Walter JD, Hutter CAJ, Garaeva AA, Scherer M, Zimmermann I, Wyss M, Rheinberger J, Ruedin Y, Earp JC, Egloff P, Sorgenfrei M, Huerlimann LM, Gonda I, Meier G, Remm S, Thavarasah S, Zimmer G, Slotboom DJ, Paulino C, Plattet P, Seeger MA

EMDB-12083:
Cryo-EM map of the SARS-CoV-2 spike protein in complex with sybody#15 and sybody#68 in a 1up/1up-out/1down conformation.
手法: 単粒子 / : Walter JD, Hutter CAJ, Garaeva AA, Scherer M, Zimmermann I, Wyss M, Rheinberger J, Ruedin Y, Earp JC, Egloff P, Sorgenfrei M, Huerlimann LM, Gonda I, Meier G, Remm S, Thavarasah S, Zimmer G, Slotboom DJ, Paulino C, Plattet P, Seeger MA

EMDB-12084:
Cryo-EM map of the SARS-CoV-2 spike protein in complex with sybody#15 in a 1up/1up-out/1down conformation.
手法: 単粒子 / : Walter JD, Hutter CAJ, Garaeva AA, Scherer M, Zimmermann I, Wyss M, Rheinberger J, Ruedin Y, Earp JC, Egloff P, Sorgenfrei M, Huerlimann LM, Gonda I, Meier G, Remm S, Thavarasah S, Zimmer G, Slotboom DJ, Paulino C, Plattet P, Seeger MA

EMDB-12085:
Cryo-EM map of the SARS-CoV-2 spike protein in complex with sybody#68 in a 2up/1flexible conformation.
手法: 単粒子 / : Walter JD, Hutter CAJ, Garaeva AA, Scherer M, Zimmermann I, Wyss M, Rheinberger J, Ruedin Y, Earp JC, Egloff P, Sorgenfrei M, Huerlimann LM, Gonda I, Meier G, Remm S, Thavarasah S, Zimmer G, Slotboom DJ, Paulino C, Plattet P, Seeger MA

EMDB-12086:
Cryo-EM map of the SARS-CoV-2 spike protein in complex with sybody#68 in a 1up/2down conformation.
手法: 単粒子 / : Walter JD, Hutter CAJ, Garaeva AA, Scherer M, Zimmermann I, Wyss M, Rheinberger J, Ruedin Y, Earp JC, Egloff P, Sorgenfrei M, Huerlimann LM, Gonda I, Meier G, Remm S, Thavarasah S, Zimmer G, Slotboom DJ, Paulino C, Plattet P, Seeger MA

EMDB-10549:
The structure of ABC transporter Rv1819c without addition of substrate
手法: 単粒子 / : Rempel S, Gati C

EMDB-10550:
The structure of ABC transporter Rv1819c in AMP-PNP bound state
手法: 単粒子 / : Rempel S, Gati C

EMDB-10632:
Structure of glutamate transporter homologue GltTk in the presence of TBOA inhibitor
手法: 単粒子 / : Arkhipova V, Slotboom DJ

EMDB-10633:
Structure of glutamate transporter homologue GltTk in the unsaturated conditions - inward-inward-outward configuration
手法: 単粒子 / : Arkhipova V, Slotboom DJ

EMDB-10634:
Structure of glutamate transporter homologue GltTk in unsaturated conditions - outward-outward-inward configuration
手法: 単粒子 / : Arkhipova V, Slotboom DJ

EMDB-10635:
Structure of glutamate transporter homologue GltTk in the saturated conditions
手法: 単粒子 / : Arkhipova V, Slotboom DJ

EMDB-10636:
Structure of glutamate transporter homologue GltTk in sodium only condition
手法: 単粒子 / : Arkhipova V, Slotboom DJ

EMDB-10016:
Inward-open structure of the ASCT2 (SLC1A5) mutant C467R in presence of TBOA
手法: 単粒子 / : Garaeva AA, Guskov A

EMDB-10017:
Inward-open structure of the ASCT2 (SLC1A5) in absence of substrate
手法: 単粒子 / : Garaeva AA, Guskov A, Slotboom DJ, Paulino C

EMDB-10018:
Inward-open structure of the ASCT2 (SLC1A5) mutant C467R in absence of substrate
手法: 単粒子 / : Garaeva AA, Guskov A

EMDB-4386:
cryo-EM structure of the human neutral amino acid transporter ASCT2
手法: 単粒子 / : Garaeva AA, Oostergetel GT

EMDB-3605:
The structure of the full-length ZntB transporter
手法: 単粒子 / : Cornelius G, Stetsenko A, Scheres SHW, Slotboom DJ, Guskov A

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は? / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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