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検索 (著者・登録者: siksnys & v)の結果63件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-51766:
Cas1-Cas2 CRISPR integrase bound to prespacer DNA, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-51773:
Cas1-Cas2 CRISPR integrase bound to prespacer and target DNA, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-51787:
Cas9 in complex with tracrRNA and crRNA, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-51801:
Cas9:crRNA:tracrRNA in complex with PAM-containing non-cognate DNA, PAM-bound conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-51812:
Cas9:crRNA:tracrRNA in complex with PAM-containing non-cognate DNA, PAM-unbound conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-51900:
Partial Cas1-Cas2 CRISPR integrase complex bound to a half-integration product, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-51909:
Csn2 (point mutations Y212R, I213R and M215R) in complex with Cas1-Cas2 integrase and dsDNA, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52317:
PAM-bound Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex in the docked conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52318:
PAM-bound Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex in the docked conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52319:
PAM-bound Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex in the docked conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52320:
PAM-bound Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex in the docked conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52321:
Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex with dsDNA in PAM-unbound conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52322:
Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex with dsDNA in PAM-unbound conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52323:
Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex with dsDNA in PAM-unbound conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52324:
Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex with dsDNA in PAM-unbound conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52883:
PAM-bound Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex in the locked conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 (consensus map)
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52884:
PAM-bound Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex in the locked conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52885:
PAM-bound Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex in the locked conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52886:
PAM-bound Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex in the locked conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-9h1h:
Cas1-Cas2 CRISPR integrase bound to prespacer DNA, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-9h1v:
Cas1-Cas2 CRISPR integrase bound to prespacer and target DNA, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-9h21:
Cas9 in complex with tracrRNA and crRNA, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-9h2g:
Cas9:crRNA:tracrRNA in complex with PAM-containing non-cognate DNA, PAM-bound conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-9h2m:
Cas9:crRNA:tracrRNA in complex with PAM-containing non-cognate DNA, PAM-unbound conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-9h6t:
Partial Cas1-Cas2 CRISPR integrase complex bound to a half-integration product, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-9h72:
Csn2 (point mutations Y212R, I213R and M215R) in complex with Cas1-Cas2 integrase and dsDNA, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-9hp8:
PAM-bound Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex in the docked conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-9hp9:
Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex with dsDNA in PAM-unbound conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-9q85:
PAM-bound Cas9-Cas1-Cas2-Csn2 supercomplex in the locked conformation, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-52745:
SpCas12Cas12f1 in complex with sgRNA and cognate DNA
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Baltramonaitis M, Karvelis T, Siksnys V

PDB-9i8y:
SpCas12Cas12f1 in complex with sgRNA and cognate DNA
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Baltramonaitis M, Karvelis T, Siksnys V

EMDB-17702:
Cas9 bound to cognate DNA, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

PDB-8pj9:
Cas9 bound to cognate DNA, Streptococcus thermophilus DGCC 7710 CRISPR3 system
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Gaizauskaite U, Tamulaitiene G

EMDB-16233:
Helical structure of BcThsA in complex with 1''-3'gcADPR
手法: らせん対称 / : Tamulaitiene G, Sasnauskas G, Sabonis D

EMDB-16234:
Helical structure of BcThsA in complex with 1''-3'gc(etheno)ADPR
手法: らせん対称 / : Tamulaitiene G, Sasnauskas G, Sabonis D

PDB-8bto:
Helical structure of BcThsA in complex with 1''-3'gcADPR
手法: らせん対称 / : Tamulaitiene G, Sasnauskas G, Sabonis D

PDB-8btp:
Helical structure of BcThsA in complex with 1''-3'gc(etheno)ADPR
手法: らせん対称 / : Tamulaitiene G, Sasnauskas G, Sabonis D

EMDB-17757:
Cryo-EM structure of the Cas12m-crRNA-target DNA complex
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Tamulaitiene G, Karvelis T, Bigelyte G, Siksnys V

PDB-8pm4:
Cryo-EM structure of the Cas12m-crRNA-target DNA complex
手法: 単粒子 / : Sasnauskas G, Tamulaitiene G, Karvelis T, Bigelyte G, Siksnys V

EMDB-17663:
Cami1-ribosome cryoEM-map
手法: 単粒子 / : Tamulaitiene G, Mogila I, Sasnauskas G, Tamulaitis G

EMDB-17664:
Cami1-ribosome local refinement map with mask on Cami1 and L12-Cter
手法: 単粒子 / : Tamulaitiene G, Mogila I, Sasnauskas G, Tamulaitis G

EMDB-17665:
Cami1-ribosome local refinement map with mask on 30S subunit
手法: 単粒子 / : Tamulaitiene G, Mogila I, Sasnauskas G, Tamulaitis G

EMDB-17666:
Cami1-ribosome local refinement map with mask on 50S subunit
手法: 単粒子 / : Tamulaitiene G, Mogila I, Sasnauskas G, Tamulaitis G

EMDB-17667:
cA4-bound Cami1 in complex with 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Tamulaitiene G, Mogila I, Sasnauskas G, Tamulaitis G

PDB-8phj:
cA4-bound Cami1 in complex with 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Tamulaitiene G, Mogila I, Sasnauskas G, Tamulaitis G

EMDB-35912:
Cryo-EM structure of the AsCas12f-sgRNA-target DNA ternary complex
手法: 単粒子 / : Hino T, Omura NS, Nakagawa R, Togashi T, Takeda NS, Hiramoto T, Tasaka S, Hirano H, Tokuyama T, Uosaki H, Ishiguro H, Yamano H, Ozaki Y, Motooka D, Mori H, Kirita Y, Kise Y, Itoh Y, Matoba S, Aburatani H, Yachie N, Siksnys V, Ohmori T, Hoshino A, Nureki O

EMDB-35926:
Cryo-EM structure of the AsCas12f-YHAM-sgRNAS3-5v7-target DNA
手法: 単粒子 / : Hino T, Omura NS, Nakagawa R, Togashi T, Takeda NS, Hiramoto T, Tasaka S, Hirano H, Tokuyama T, Uosaki H, Ishiguro H, Yamano H, Ozaki Y, Motooka D, Mori H, Kirita Y, Kise Y, Itoh Y, Matoba S, Aburatani H, Yachie N, Siksnys V, Ohmori T, Hoshino A, Nureki O

EMDB-35965:
Cryo-EM structure of the AsCas12f-HKRA-sgRNAS3-5v7-target DNA
手法: 単粒子 / : Hino T, Omura NS, Nakagawa R, Togashi T, Takeda NS, Hiramoto T, Tasaka S, Hirano H, Tokuyama T, Uosaki H, Ishiguro H, Yamano H, Ozaki Y, Motooka D, Mori H, Kirita Y, Kise Y, Itoh Y, Matoba S, Aburatani H, Yachie N, Siksnys V, Ohmori T, Hoshino A, Nureki O

PDB-8j12:
Cryo-EM structure of the AsCas12f-sgRNA-target DNA ternary complex
手法: 単粒子 / : Hino T, Omura NS, Nakagawa R, Togashi T, Takeda NS, Hiramoto T, Tasaka S, Hirano H, Tokuyama T, Uosaki H, Ishiguro H, Yamano H, Ozaki Y, Motooka D, Mori H, Kirita Y, Kise Y, Itoh Y, Matoba S, Aburatani H, Yachie N, Siksnys V, Ohmori T, Hoshino A, Nureki O

PDB-8j1j:
Cryo-EM structure of the AsCas12f-YHAM-sgRNAS3-5v7-target DNA
手法: 単粒子 / : Hino T, Omura NS, Nakagawa R, Togashi T, Takeda NS, Hiramoto T, Tasaka S, Hirano H, Tokuyama T, Uosaki H, Ishiguro H, Yamano H, Ozaki Y, Motooka D, Mori H, Kirita Y, Kise Y, Itoh Y, Matoba S, Aburatani H, Yachie N, Siksnys V, Ohmori T, Hoshino A, Nureki O

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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