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検索結果

検索 (著者・登録者: onishi & e)の結果全36件を表示しています

EMDB-63767:
Cryo-EM structure of wild-type SaCas9-guide RNA-mismatched target DNA complex
手法: 単粒子 / : Omura SN, Nakagawa R, Yamashita K, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-63768:
Cryo-EM structure of eSaCas9-NNG-guide RNA-mismatched target DNA complex
手法: 単粒子 / : Omura SN, Nakagawa R, Yamashita K, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-66460:
Cryo-EM Structure of human complement C1s CUB domain in complex with RAY121
手法: 単粒子 / : Kawauchi H, Adrian H, Gupta G, Koga H, Fujii T, Fukumura T, Ishino S, Irie M, Torizawa T

PDB-9x1h:
Cryo-EM Structure of human complement C1s CUB domain in complex with RAY121
手法: 単粒子 / : Kawauchi H, Adrian H, Gupta G, Koga H, Fujii T, Fukumura T, Ishino S, Irie M, Torizawa T

EMDB-39941:
Cryo-EM structure of eSaCas9_NNG-guide RNA-target DNA complex in an interrogation state
手法: 単粒子 / : Omura SN, Nakagawa R, Yamashita K, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-39942:
Cryo-EM structure of eSaCas9_NNG-guide RNA-target DNA complex in an intermediate state
手法: 単粒子 / : Omura SN, Nakagawa R, Yamashita K, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-39944:
Cryo-EM structure of eSaCas9_NNG-guide RNA-target DNA complex in a translocation state
手法: 単粒子 / : Omura SN, Nakagawa R, Yamashita K, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-39954:
Cryo-EM structure of eSaCas9_NNG-guide RNA-target DNA complex in a catalytically active state
手法: 単粒子 / : Omura SN, Nakagawa R, Yamashita K, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-61843:
Yeast Mitochondrial PORIN complex
手法: 単粒子 / : Takeda H, Endo T, Kikkawa M, Tsutsumi A

PDB-9jvq:
Yeast Mitochondrial PORIN complex
手法: 単粒子 / : Takeda H, Endo T, Kikkawa M, Tsutsumi A

EMDB-39676:
Cryo-EM structure of cylindrical fiber of MyD88 TIR
手法: 単粒子 / : Kasai K, Imamura K, Narita A, Makino F, Miyata T, Kato T, Namba K, Onishi H, Tochio H

EMDB-43238:
NPM2-H1.8 isolated from Xenopus egg extract
手法: 単粒子 / : Arimura Y, Funabiki H

EMDB-43239:
NPM2-H1.8 isolated from Xenopus egg extract (Bent form)
手法: 単粒子 / : Arimura Y, Funabiki H

EMDB-43240:
NPM2-H1.8 isolated from Xenopus egg extract (Stretched form)
手法: 単粒子 / : Arimura Y, Funabiki H

PDB-8vhi:
NPM2-H1.8 isolated from Xenopus egg extract
手法: 単粒子 / : Arimura Y, Funabiki H

PDB-8vhj:
NPM2-H1.8 isolated from Xenopus egg extract (Bent form)
手法: 単粒子 / : Arimura Y, Funabiki H

PDB-8vhk:
NPM2-H1.8 isolated from Xenopus egg extract (Stretched form)
手法: 単粒子 / : Arimura Y, Funabiki H

EMDB-37355:
Cryo-EM structure of helical filament of MyD88 TIR
手法: 単粒子 / : Kasai K, Imamura K, Narita A, Makino F, Miyata T, Kato T, Namba K, Onishi H, Tochio H

EMDB-34274:
Bre1-nucleosome complex
手法: 単粒子 / : Onishi S, Hamada K, Sato K, Nishizawa T, Nureki O, Ogata K, Sengoku T

EMDB-34275:
Human nucleosome core particle (free form)
手法: 単粒子 / : Onishi S, Sato K, Nishizawa T, Nureki O, Ogata K, Sengoku T

PDB-8gui:
Bre1-nucleosome complex (Model I)
手法: 単粒子 / : Onishi S, Hamada K, Sato K, Nishizawa T, Nureki O, Ogata K, Sengoku T

PDB-8guj:
Bre1-nucleosome complex (Model II)
手法: 単粒子 / : Onishi S, Sato K, Hamada K, Nishizawa T, Nureki O, Ogata K, Sengoku T

PDB-8guk:
Human nucleosome core particle (free form)
手法: 単粒子 / : Onishi S, Sato K, Nishizawa T, Nureki O, Ogata K, Sengoku T

EMDB-34429:
Cryo-EM structure of KpFtsZ-monobody double helical tube
手法: らせん対称 / : Fujita J, Amesaka H, Yoshizawa T, Kuroda N, Kamimura N, Hara M, Inoue T, Namba K, Tanaka S, Matsumura H

EMDB-35344:
Cryo-EM structure of KpFtsZ single filament
手法: らせん対称 / : Fujita J, Amesaka H, Yoshizawa T, Kuroda N, Kamimura N, Hibino K, Konishi T, Kato Y, Hara M, Inoue T, Namba K, Tanaka S, Matsumura H

PDB-8h1o:
Cryo-EM structure of KpFtsZ-monobody double helical tube
手法: らせん対称 / : Fujita J, Amesaka H, Yoshizawa T, Kuroda N, Kamimura N, Hara M, Inoue T, Namba K, Tanaka S, Matsumura H

PDB-8ibn:
Cryo-EM structure of KpFtsZ single filament
手法: らせん対称 / : Fujita J, Amesaka H, Yoshizawa T, Kuroda N, Kamimura N, Hibino K, Konishi T, Kato Y, Hara M, Inoue T, Namba K, Tanaka S, Matsumura H

EMDB-32078:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J

EMDB-32079:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (3-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-32080:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (1-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P17
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-32081:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P17
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

PDB-7vq0:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-30636:
Cryo-EM structure of human XKR8-basigin complex bound to Fab fragment
手法: 単粒子 / : Sakuragi T, Kanai R

PDB-7dce:
Cryo-EM structure of human XKR8-basigin complex bound to Fab fragment
手法: 単粒子 / : Sakuragi T, Kanai R, Tsutsumi A, Narita H, Onishi E, Miyazaki T, Baba T, Nakagawa A, Kikkawa M, Toyoshima C, Nagata S

EMDB-1470:
Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
手法: らせん対称 / : Popp D, Narita A, Oda T, Fujisawa T, Matsuo H, Nitanai Y, Iwasa M, Maeda K, Onishi H, Maeda Y

PDB-2zhc:
ParM filament
手法: らせん対称 / : Popp D, Narita A, Oda T, Fujisawa T, Matsuo H, Nitanai Y, Iwasa M, Maeda K, Onishi H, Maeda Y

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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