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万見検索

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検索結果

検索 (著者・登録者: horn-ghetko & d)の結果全42件を表示しています

EMDB-18214:
Structure of CUL9-RBX1 ubiquitin E3 ligase complex - hexameric assembly

EMDB-18216:
Structure of CUL9-RBX1 ubiquitin E3 ligase complex in unneddylated and neddylated conformation - focused cullin dimer

EMDB-18217:
Structure of CUL9-RBX1 ubiquitin E3 ligase complex in unneddylated and neddylated conformation - focused on E2-like density

EMDB-18218:
Structure of CUL9-RBX1 ubiquitin E3 ligase complex in unneddylated and neddylated conformation - focused dimeric core

EMDB-18220:
Structure of the hexameric CUL9-RBX1 complex with deletion of CUL9 CPH domain

EMDB-18221:
Structure of the hexameric CUL9-RBX1 complex with deletion of CUL9 DOC domain

EMDB-18222:
Structure of the hexameric CUL9-RBX1 complex with deletion of CUL9 ARM9 domain

EMDB-18223:
Structure of the hexameric CUL9-RBX1 complex with deletion of CUL9 ARIH-RBR element

EMDB-19179:
Structure of CUL9-RBX1 ubiquitin E3 ligase complex in unneddylated conformation - symmetry expanded unneddylated dimer

PDB-8q7e:
Structure of CUL9-RBX1 ubiquitin E3 ligase complex - hexameric assembly

PDB-8q7h:
Structure of CUL9-RBX1 ubiquitin E3 ligase complex in unneddylated and neddylated conformation - focused cullin dimer

PDB-8rhz:
Structure of CUL9-RBX1 ubiquitin E3 ligase complex in unneddylated conformation - symmetry expanded unneddylated dimer

EMDB-16355:
Structure of Dimeric HECT E3 Ubiquitin Ligase UBR5

EMDB-16356:
Structure of HECT E3 UBR5 forming K48 linked Ubiquitin chains

EMDB-16865:
Tetrameric HECT E3 Ubiquitin Ligase UBR5

EMDB-16866:
Cryo-EM map of ubiquitin-VME bound HECT E3 ligase UBR5

EMDB-16867:
Ubiquitin transfer from E2 to E3: UBE2D2-ubiquitin linked to HECT E3 ligase UBR5

EMDB-17466:
Cryo-EM map of HECT E3 ligase UBR5 forming K48 linked ubiquitin chains

PDB-8c06:
Structure of Dimeric HECT E3 Ubiquitin Ligase UBR5

PDB-8c07:
Structure of HECT E3 UBR5 forming K48 linked Ubiquitin chains

EMDB-12995:
Structure of Neddylated CUL5 C-terminal region-RBX2-ARIH2*

EMDB-12998:
Structure of Neddylated CRL5Vif-CBFbeta-ARIH2*-APOBEC3C (A3C fullcomplex consensus )

EMDB-12999:
Structure of Neddylated CUL5 C-terminal region-RBX2-ARIH2* ( A3G E3-E3 catalytic focused )

EMDB-13000:
Structure of Neddylated CRL5Vif-CBFbeta-ARIH2*-APOBEC3C (A3C consensus )

EMDB-13001:
Structure of Neddylated CRL5Vif-CBFbeta-ARIH2*-APOBEC3G ( A3G consensus )

PDB-7oni:
Structure of Neddylated CUL5 C-terminal region-RBX2-ARIH2*

EMDB-12040:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-p27~Ub~ARIH1. Transition State 2

PDB-7b5m:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-p27~Ub~ARIH1. Transition State 2

EMDB-12004:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 ligase superassembly. NEDD8-CUL1-RBX1-SKP1-FBXW7-Cyclin E-ARIH1-UBE2L3~Ub. Pre-Transition State 1

EMDB-12005:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-SKP1-FBXW7-Cyclin E-ARIH1~Ub. post-Transition State 1

EMDB-12006:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-FBXW7-Cyclin E~Ub~ARIH1. Transition State 2

EMDB-12036:
Ubiquitin ligation to F-box protein targets by SCF-RBR E3-E3 super-assembly

EMDB-12037:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27-UBE2L3~Ub~ARIH1. Transition State 1

EMDB-12038:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27-UBE2L3~Ub~ARIH1. Transition State 1

EMDB-12039:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-SKP1-FBXW7-Cyclin E~Ub~ARIH1. Transition State 2

EMDB-12041:
Focused map-catalytic side. Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-UBE2L3~Ub~ARIH1.

EMDB-12048:
Focused map- CyclinA-CDK2-class. Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27. Transition State 1

EMDB-12050:
Focused map- Cullin scaffold. Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-ARIH1 Ariadne. Transition State 1

PDB-7b5l:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27-UBE2L3~Ub~ARIH1. Transition State 1

PDB-7b5n:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-UBE2L3~Ub~ARIH1.

PDB-7b5r:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27

PDB-7b5s:
Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-ARIH1 Ariadne. Transition State 1

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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