PDBID: | 8rap | ステータス: | AUTH -- 編集処理済、登録者の確認・同意待ち | タイトル: | Structure of Sen1-ADP.BeF3 bound RNA Polymerase II pre-termination complex | 登録者: | Rengachari, S., Lidscreiber, M., Cramer, P. | 登録日: | 2023-12-01 |
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PDBID: | 8v18 | ステータス: | HPUB -- 編集処理完了、論文の公開まで公開待ち | タイトル: | RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoguanine with bound AMPCPP | 登録者: | Oh, J., Wang, D. | 登録日: | 2023-11-20 |
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PDBID: | 8v1a | ステータス: | HPUB -- 編集処理完了、論文の公開まで公開待ち | タイトル: | RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoguanine and ATP in two different conformation: 8OG (syn)-ATP (A site) and 8OG (anti)-ATP (E site) | 登録者: | Oh, J., Wang, D. | 登録日: | 2023-11-20 |
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PDBID: | 8v19 | ステータス: | REPL -- 登録者より新しい座標を受理、再処理が必要 | タイトル: | RNA polymerase II elongation complex with Syn conformation 8-oxoguanine with AMP added | 登録者: | Oh, J., Wang, D. | 登録日: | 2023-11-20 |
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PDBID: | 8uzr | ステータス: | HPUB -- 編集処理完了、論文の公開まで公開待ち | タイトル: | RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoguanine with bound CMPCPP | 登録者: | Oh, J., Wang, D. | 登録日: | 2023-11-16 |
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PDBID: | 8uzs | ステータス: | REPL -- 登録者より新しい座標を受理、再処理が必要 | タイトル: | RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoguanine with 3'' CTP added | 登録者: | Oh, J., Wang, D. | 登録日: | 2023-11-16 |
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PDBID: | 8uzq | ステータス: | HPUB -- 編集処理完了、論文の公開まで公開待ち | タイトル: | RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoguanine in +1 active site | 登録者: | Oh, J., Wang, D. | 登録日: | 2023-11-16 |
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PDBID: | 8qn8 | ステータス: | HPUB -- 編集処理完了、論文の公開まで公開待ち | タイトル: | Mycobacterium smegmatis RNA polymerase in complex with HelD, SigA and RbpA in State II | 登録者: | Koval, T., Krasny, L., Dohnalek, J., Kouba, T. | 登録日: | 2023-09-25 |
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PDBID: | 8u9r | ステータス: | HPUB -- 編集処理完了、論文の公開まで公開待ち | タイトル: | STRUCTURAL BASIS OF TRANSCRIPTION: RNA POLYMERASE II SUBSTRATE BINDING AND METAL COORDINATION USING A FREE-ELECTRON LASER | 登録者: | Arjunan, P., Calero, G., Kaplan, C.D. | 登録日: | 2023-09-20 | Sequence: | >Entity 1 MVGQQYSSAPLRTVKEVQFGLFSPEEVRAISVAKIRFPETMDETQTRAKIGGLNDPRLGSIDRNLKCQTCQEGMNECPGHFGHIDLAKPVFHVGFIAKIKKVCECVCMHCGKLLLDEHNELMRQALAIKDSKKRFAAIWTLCKTKMVCETDVPSEDDPTQLVSRGGCGNTQPTIRKDGLKLVGSWKKDRATGDADEPELRVLSTEEILNIFKHISVKDFTSLGFNEVFSRPEWMILTCLPVPPPPVRPSISFNESQRGEDDLTFKLADILKANISLETLEHNGAPHHAIEEAESLLQFHVATYMDNDIAGQPQALQKSGRPVKSIRARLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLELDQVGVPKSIAKTLTYPEVVTPYNIDRLTQLVRNGPNEHPGAKYVIRDSGDRIDLRYSKRAGDIQLQYGWKVERHIMDNDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVKVIPYSTFRLNLSVTSPYNADFDGDEMNLHVPQSEETRAELSQLCAVPLQIVSPQSNKPCMGIVQDTLCGIRKLTLRDTFIELDQVLNMLYWVPDWDGVIPTPAIIKPKPLWSGKQILSVAIPNGIHLQRFDEGTTLLSPKDNGMLIIDGQIIFGVVEKKTVGSSNGGLIHVVTREKGPQVCAKLFGNIQKVVNFWLLHNGFSTGIGDTIADGPTMREITETIAEAKKKVLDVTKEAQANLLTAKHGMTLRESFEDNVVRFLNEARDKAGRLAEVNLKDLNNVKQMVMAGSKGSFINIAQMSACVGQQSVEGKRIAFGFVDRTLPHFSKDDYSPESKGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKALEDIMVHYDNTTRNSLGNVIQFIYGEDGMDAAHIEKQSLDTIGGSDAAFEKRYRVDLLNTDHTLDPSLLESGSEILGDLKLQVLLDEEYKQLVKDRKFLREVFVDGEANWPLPVNIRRIIQNAQQTFHIDHTKPSDLTIKDIVLGVKDLQENLLVLRGKNEIIQNAQRDAVTLFCCLLRSRLATRRVLQEYRLTKQAFDWVLSNIEAQFLRSVVHPGEMVGVLAAQSIGEPATQMTLNTFHFAGVASKKVTSGVPRLKEILNVAKNMKTPSLTVYLEPGHAADQEQAKLIRSAIEHTTLKSVTIASEIYYDPDPRSTVIPEDEEIIQLHFSLLDEEAEQSFDQQSPWLLRLELDRAAMNDKDLTMGQVGERIKQTFKNDLFVIWSEDNDEKLIIRCRVVRPKSLDAETEAEEDHMLKKIENTMLENITLRGVENIERVVMMKYDRKVPSPTGEYVKEPEWVLETDGVNLSEVMTVPGIDPTRIYTNSFIDIMEVLGIEAGRAALYKEVYNVIASDGSYVNYRHMALLVDVMTTQGGLTSVTRHGFNRSNTGALMRCSFEETVEILFEAGASAELDDCRGVSENVILGQMAPIGTGAFDVMIDEESLVKYMPEQKITEIEDGQDGGVTPYSNESGLVNADLDVKDELMFSPLVDSGSNDAMAGGFTAYGGADYGEATSPFGAYGEAPTSPGFGVSSPGFSPTSPTYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPGYSPGSPAYSPKQDEQKHNENENSR
>Entity 2 MSDLANSEKYYDEDPYGFEDESAPITAEDSWAVISAFFREKGLVSQQLDSFNQFVDYTLQDIICEDSTLILEQLAQHTTESDNISRKYEISFGKIYVTKPMVNESDGVTHALYPQEARLRNLTYSSGLFVDVKKRTYEAIDVPGRELKYELIAEESEDDSESGKVFIGRLPIMLRSKNCYLSEATESDLYKLKECPFDMGGYFIINGSEKVLIAQERSAGNIVQVFKKAAPSPISHVAEIRSALEKGSRFISTLQVKLYGREGSSARTIKATLPYIKQDIPIVIIFRALGIIPDGEILEHICYDVNDWQMLEMLKPCVEDGFVIQDRETALDFIGRRGTALGIKKEKRIQYAKDILQKEFLPHITQLEGFESRKAFFLGYMINRLLLCALDRKDQDDRDHFGKKRLDLAGPLLAQLFKTLFKKLTKDIFRYMQRTVEEAHDFNMKLAINAKTITSGLKYALATGNWGEQKKAMSSRAGVSQVLNRYTYSSTLSHLRRTNTPIGRDGKLAKPRQLHNTHWGLVCPAETPEGQACGLVKNLSLMSCISVGTDPMPIITFLSEWGMEPLEDYVPHQSPDATRVFVNGVWHGVHRNPARLMETLRTLRRKGDINPEVSMIRDIREKELKIFTDAGRVYRPLFIVEDDESLGHKELKVRKGHIAKLMATEYQDIEGGFEDVEEYTWSSLLNEGLVEYIDAEEEESILIAMQPEDLEPAEANEENDLDVDPAKRIRVSHHATTFTHCEIHPSMILGVAASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVFLTNYNVRMDTMANILYYPQKPLGTTRAMEYLKFRELPAGQNAIVAIACYSGYNQEDSMIMNQSSIDRGLFRSLFFRSYMDQEKKYGMSITETFEKPQRTNTLRMKHGTYDKLDDDGLIAPGVRVSGEDVIIGKTTPISPDEEELGQRTAYHSKRDASTPLRSTENGIVDQVLVTTNQDGLKFVKVRVRTTKIPQIGDKFASRHGQKGTIGITYRREDMPFTAEGIVPDLIINPHAIPSRMTVAHLIECLLSKVAALSGNEGDASPFTDITVEGISKLLREHGYQSRGFEVMYNGHTGKKLMAQIFFGPTYYQRLRHMVDDKIHARARGPMQVLTRQPVEGRSRDGGLRFGEMERDCMIAHGAASFLKERLMEASDAFRVHICGICGLMTVIAKLNHNQFECKGCDNKIDIYQIHIPYAAKLLFQELMAMNITPRLYTDRSRDF
>Entity 3 MSEEGPQVKIREASKDNVDFILSNVDLAMANSLRRVMIAEIPTLAIDSVEVETNTTVLADEFIAHRLGLIPLQSMDIEQLEYSRDCFCEDHCDKCSVVLTLQAFGESESTTNVYSKDLVIVSNLMGRNIGHPIIQDKEGNGVLICKLRKGQELKLTCVAKKGIAKEHAKWGPAAAIEFEYDPWNKLKHTDYWYEQDSAKEWPQSKNCEYEDPPNEGDPFDYKAQADTFYMNVESVGSIPVDQVVVRGIDTLQKKVASILLALTQMDQDKVNFASGDNNTASNMLGSNEDVMMTGAEQDPYSNASQMGNTGSGGYDNAW
>Entity 4 MNVSTSTFQTRRRRLKKVEEEENAATLQLGQEFQLKQINHQGEEEELIALNLSEARLVIKEALVERRRAFKRSQKKHKKKHLKHENANDETTAVEDEDDDLDEDDVNADDDDFMHSETREKELESIDVLLEQTTGGNNKDLKNTMQYLTNFSRFRDQETVGAVIQLLKSTGLHPFEVAQLGSLACDTADEAKTLIPSLNNKISDDELERILKELSNLETLY
>Entity 5 MDQENERNISRLWRAFRTVKEMVKDRGYFITQEEVELPLEDFKAKYCDSMGRPQRKMMSFQANPTEESISKFPDMGSLWVEFCDEPSVGVKTMKTFVIHIQEKNFQTGIFVYQNNITPSAMKLVPSIPPATIETFNEAALVVNITHHELVPKHIRLSSDEKRELLKRYRLKESQLPRIQRADPVALYLGLKRGEVVKIIRKSETSGRYASYRICM
>Entity 6 MSDYEEAFNDGNENFEDFDVEHFSDEETYEEKPQFKDGETTDANGKTIVTGGNGPEDFQQHEQIRRKTLKEKAIPKDQRATTPYMTKYERARILGTRALQISMNAPVFVDLEGETDPLRIAMKELAEKKIPLVIRRYLPDGSFEDWSVEELIVDL
>Entity 7 MFFIKDLSLNITLHPSFFGPRMKQYLKTKLLEEVEGSCTGKFGYILCVLDYDNIDIQRGRILPTDGSAEFNVKYRAVVFKPFKGEVVDGTVVSCSQHGFEVQVGPMKVFVTKHLMPQDLTFNAGSNPPSYQSSEDVITIKSRIRVKIEGCISQVSSIHAIGSIKEDYLGAI
>Entity 8 MSNTLFDDIFQVSEVDPGRYNKVCRIEAASTTQDQCKLTLDINVELFPVAAQDSLTVTIASSLNLEDTPANDSSATRSWRPPQAGDRSLADDYDYVMYGTAYKFEEVSKDLIAVYYSFGGLLMRLEGNYRNLNNLKQENAYLLIRR
>Entity 9 MTTFRFCRDCNNMLYPREDKENNRLLFECRTCSYVEEAGSPLVYRHELITNIGETAGVVQDIGSDPTLPRSDRECPKCHSRENVFFQSQQRRKDTSMVLFFVCLSCSHIFTSDQKNKRTQFS
>Entity 10 MIVPVRCFSCGKVVGDKWESYLNLLQEDELDEGTALSRLGLKRYCCRRMILTHVDLIEKFLRYNPLEKRD
>Entity 11 MNAPDRFELFLLGEGESKLKIDPDTKAPNAVVITFEKEDHTLGNLIRAELLNDRKVLFAAYKVEHPFFARFKLRIQTTEGYDPKDALKNACNSIINKLGALKTNFETEWNLQTLAADDAF
>Entity 12 MSREGFQIPTNLDAAAAGTSQARTATLKYICAECSSKLSLSRTDAVRCKDCGHRILLKARTKRLVQFEAR
>Entity 13 AUCGAGAGGG
>Entity 14 (DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DA)
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PDBID: | 8u9x | ステータス: | HPUB -- 編集処理完了、論文の公開まで公開待ち | タイトル: | STRUCTURAL BASIS OF TRANSCRIPTION: RNA POLYMERASE II SUBSTRATE BINDING AND METAL COORDINATION AT 3.0 A OF T834P MUTANT USING A FREE-ELECTRON LASER | 登録者: | Arjunan, P., Calero, G., Kaplan, C.D. | 登録日: | 2023-09-20 |
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PDBID: | 4bxy | ステータス: | WDRN -- 公開前に廃棄されたエントリー | タイトル: | elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex | 登録者: | Kinkelin, K., Wozniak, G.G., Rothbart, S.B., Lidschreiber, M., Strahl, B.D., Cramer, P. | 登録日: | 2013-07-16 |
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PDBID: | 3j0n | ステータス: | WDRN -- 公開前に廃棄されたエントリー | タイトル: | Orientation 2 of RNA polymerase II within the human Mediator-pol II-TFIIF assembly in the absence of activator | 登録者: | Bernecky, C., Taatjes, D.J. | 登録日: | 2011-10-05 |
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PDBID: | 3j0m | ステータス: | WDRN -- 公開前に廃棄されたエントリー | タイトル: | Orientation 1 of RNA polymerase II within the human Mediator-pol II-TFIIF assembly in the absence of activator | 登録者: | Bernecky, C., Taatjes, D.J. | 登録日: | 2011-10-05 |
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PDBID: | 2c33 | ステータス: | WDRN -- 公開前に廃棄されたエントリー | タイトル: | Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II | 登録者: | Meka, H., Werner, F., Cordell, S.C., Onesti, S., Brick, P. | 登録日: | 2005-10-04 |
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