PDBj FTPサイト(PDBアーカイブ)に、HTTPでもアクセスできるようになりました。 ... 提供してきましたが、 新たにhttp(Hyper Text Transfer Protocol)でのサービスも開始 ... 。 ftpやrsyncが利用できない方も、httpですべてのPDBアーカイブデータ ... ができるようになりました。 - http://ftp.pdbj.org/(現行のPDBアーカイブ ... ) - http://ftp-versioned.pdbj.org/(PDBバージョニングアー ... |
OneDep登録サイト は、セキュリティ機能を強化するため、HTTPSによる通信に移行しました。 httpでアクセスした場合は、自動的にhttpsにリダイレクトされます。 OneDep登録サイトは、セキュリティ機能を強化するため、HTTPSによる通信に移行しました。 httpでアクセスした場合は、自動的にhttpsにリダイレクトされます。 |
wwPDBの新登録システムが、PDBjサイトから直接ご利用頂けるようになりました ( http://deposit-pdbj.wwpdb.org/deposition )。 wwPDBの新登録システムが、PDBjサイトから直接ご利用頂けるようになりました (http://deposit-pdbj.wwpdb.org/deposition)。 データ登録のご案内もご覧ください。 |
PDBjの新しいツールと活動を紹介した論文が、Protein Scienceから公開されました。 http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/pro.3273/full New tools and ... |
BMRB http://bmrbdep.pdbj.org/index.html BMRB(Biological Magnetic Resonance Data Bank、生 ... |
wwPDB/RDF ... href="https://rdf.wwpdb.org/pdb-rdf.xsl"?> |
検索サービス ... BMRB のデータを検索します。 URL: http://bmrb.pdbj.org/search/ Sequence Navigator Sequence ... を検索するツールです。 URL: http://pdbj.org/seqnavix/ Structure Navigator Structure ... も合わせてご覧下さい。 URL: http://pdbj.org/sesaw/ Ligand Binding Sites (GIRAF ... |
wwPDBは設立10周年を迎えました ... : 4101-4110 2009 |
サービス&ソフトウェア ... サービスを公開しています。 URL: http://pdbj.org/gmfit/ |
Protein Globe ... る場合 - 海と陸の色変更 URL: http://pdbj.org/globe/globe.cgi [概要] 1 ... は次の例のようになります。 http://pdbj.org/globe/globe.cgi?pdbid=1ashchain=Adomain=1 ... を変更することができます。 http://pdbj.org/globe/globe.cgi?s=num 9. ... とでリンクが作成できます。 http://pdbj.org/globe/globe.cgi?pdbid=1ashchain= ... |
[wwPDB] PDBアーカイブにおけるFTPファイル転送プロトコルの廃止について ... 使用されるFTPプロトコルは、HTTP/Sに取って代わられ、年々利用 ... 者が減っています。 HTTP/Sには、速度、ステートレス、セキ ... イルダウンロードの大部分がHTTP/Sに移行したことを考慮し ... 名をサポートしています。 - http://files.wwpdb.org (HTTP/S用) - http://rsync.wwpdb.org (RSYNC用) - ftp.wwpdb.org (FTP ... 予定です。すでにこのDNS名はHTTP/Sトラフィックを受け付け ... |
[wwPDB] PDBアーカイブにおけるFTPファイル転送プロトコルの廃止について ... 使用されるFTPプロトコルは、HTTP/Sに取って代わられ、年々 ... 利用者が減っています。 HTTP/Sには、速度、ステートレス、セ ... る予定です。 これまでwwPDBは、HTTP/SやRSYNCとともにFTPをサポート ... ロトコルは徐々に廃止され、HTTP/HTTPSプロトコルに移行して ... DNS名を導入しました。 - files.wwpdb.org (HTTP/S用) - ftp.wwpdb.org (FTP用) 2024年11月 ... 2023年9月以降は、このDNS名はHTTP/Sトラフィックを受け付 ... |
教材 ... することもできます。 URL: http://pdbj.org/eprots/index_ja.cgi 今 ... ドすることができます。 URL: http://pdbj.org/info/previous-workshop PDBjゲー ... 経衰弱ゲームです。 URL: http://pdbj.org/pelmanismGame スネークゲーム ... ムオーバーになります。 URL: http://pdbj.org/aminoSnakeGame ペーパーモデル ... |
過去の講習会・イベント ... Convention Center Jeju, Korea)) - プログラム: http://www.appa2014.or.kr/program.html - 講演 日時 ... 2.4MB) ] |
PDBのエントリー数が10万件を突破しました ... Research Collaboratory for Structural Bioinformatics Protein Data Bank (RCSB-PDB; http://rcsb.org)と、NMR実験データを専門に ... EBIにあるthe Protein Data Bank in Europe (PDBe; http://pdbe.org)、日本では大阪大学蛋白 ... 所にあるthe Protein Data Bank Japan (PDBj; http://pdbj.org)によって、wwPDB が構成され ... |
CRNPRED ... 送信 - 結果の取り出し [URL] http://pdbj.org/crnpred/ [CRNPREDとは?] CRNPRED(ク ... curl -F "fasta=@hoge.seq" -F "method=lin" "http://www.pdbj.org/crnpred/" > myquery.xml 上記例では、配 ... curl プログラムを使います。 curl "http://www.pdbj.org/crnpred/?jobid=DC.1244676954.282566" > ... |
PDBデータの書式 ... イトに記されています(英語)。 - http://www.wwpdb.org/documentation/format33/v3.3.html ... エントリー 1GOF のRDFデータは http://rdf.wwpdb.org/pdb/1GOF からア ... クセスできます。 - http://rdf.wwpdb.org/pdb... wwPDB/RDFデータの ... も読みやすい)インタフェース - http://rdf.wwpdb.org/schema/pdbx-v50.owl... PDB ... |
ニュース (2012年10月04日) ... わります。 例: - http://pdbj.org/rdf/1GOF → http://rdf.wwpdb.org/pdb/1GOF - http://pdbj.org/chem_comp/ATP → http://rdf.wwpdb.org/cc/ATP |
wwPDBの登録、検証、アノテーション処理に対するサポートが改善されました。 ... ナーの登録サイト(http://deposit.wwpdb.org(RCSB PDB)、 http://deposit-pdbe.wwpdb.org(PDBe)、http://deposit-pdbj.wwpdb.org(PDBj) )のい ... 計値は、wwPDBサイトの統計ページ(http://wwpdb.org/stats/deposition)でご覧頂けます。 ご ... |
jV ... オリジナルマニュアル(英語) : http://ef-site.hgc.jp/eF-site/jV/jV_manual.html 日本 ... 語翻訳+事例等追加版 : http://pdbj.org/jv/manual/index_ja.html 英語版ヘル ... プページ: http://ef-site.hgc.jp/wiki/jV/index.php 詳しくは ... |
機能情報のページについて ... PROSITEからの機能情報 Scan Prosite ( http://www.expasy.org/tools/scanprosite/ ) ... CSA (Catalytic Site Atlas) データベース ( http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CSA/ ) ... たCATRES (Catalytic Residue Dataset)データベース ( http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CATRES/ ... |
PDBj データサイト・FTPサイトの詳細 ... す。PDBMLの定義内容については http://pdbml.rcsb.org/ や PDBML Schema pdbx-v40.xsd / pdbx-v42.xsd ... ットの定義内容については http://mmcif.pdbj.org/ をご覧下さい。 例:PDBID 100d ... ォーマットの書式については http://www.wwpdb.org/documentation/format33/v3.3.html をご覧下 ... |
立体構造予測 ... を行うウェブサービスです。 URL: http://pdbj.org/crnpred/ [Spanner] Spanner (スパナー)は既知の ... 予測するプログラムです。 URL: http://pdbj.org/spanner/ [SFAS] SFAS (Sequence to Function Annotation Server)はア ... 選択肢は増える予定です。 URL: http://pdbj.org/sfas/ |
ジカウイルスの構造が公開されました。 ... ご利用頂けます。 RCSB PDB (http://rcsb.org), PDBe (http://pdbe.org), PDBj (http://pdbj.org). 対応する電子密 ... |
PDBj Mineの概要ページへのリンクURL -FAQ ... ょうか? A) 下記の例のように、http://pdbj.org/pdb/の後ろにpdb idを指定 ... ) - 一般的なURL(言語は自動判別) http://pdbj.org/pdb/1nih - 日本語ページ ... |