NMR統合データ ... イルとしてNMRの実験データをPDB FTPアーカイブ上に配置します ... |
[wwPDB] IUCrでポスター賞授与 ... です。 wwPDB財団への寄付により、 PDBの50年にわたる開放性、協調 ... |
エンティティ(鎖)の名称に「phospholipase C」を含む構造のPDBIDと鎖ID(auth_asym_id、label_asym_id)、エンティティID、エンティティ名を得る ... ~* '.*phospholipase C.*') SELECT t1.pdbid, t1.entity_id, array_agg(DISTINCT e2.pdb_strand_id) auth_asym_ids, array_agg(DISTINCT e2.asym_id) label ... |
PDBj Mine:ローカルインストール ... ます。 内容は以下の通りです。 - PDBデータ: https://data.pdbj.org/pdbjplus/mine2/dump/pdbj.mine2.dump ... |
9/10(火)、第8回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2019)にてランチョンセミナーを開催します ... 端 猛(大阪大学蛋白質研究所) - 「PDB検証レポートを利用したPDBj検 ... |
entity.typeでは各エンティティー(分子種)ごとにpolymer/non-polymerなどの分子タイプが規程されていますが、その判断基準はどのようになっているでしょうか? - FAQ ... を行っています。ただし、古いPDBエントリーの中にはこの基準 ... |
[wwPDB] 公開前のデータ差し替えに関するOneDepの改善、プライバシー・ポリシーの更新 ... ョン(V3.0)のOneDepでは、公開前に、PDBやEMDBエントリーのデータを差し ... |
[wwPDB] OneDepからの登録時に、研究者ID番号(ORCiD)が必須になりました ... した。 この変更によって、wwPDBが、PDBエントリーを登録者に正しく ... |
[wwPDB] 3月15日までにPDB50のアブストラクトを投稿してください wwPDBは2021年を通してPDBアーカイブの50周年の記念行 ... |
ニュース (2012年10月04日) ... ます。 例: - http://pdbj.org/rdf/1GOF → http://rdf.wwpdb.org/pdb/1GOF - http://pdbj.org/chem_comp/ATP → http://rdf.wwpdb.org/cc ... |
ニュース (2007年04月25日) wwPDB (www.wwpdb.org)は、協力してPDBアーカイブデータの修正をするプロジェクトを行ってきましたが、このほど新たなデータセットを作成しテスト公開をすることになりました。 |
BINDS-PDBj合同講習会「NMRによる構造計算入門」 ... を対象に、立体構造データベースPDB、NMRのデータベースBMRBの概説、 NMRの ... |
1/10(金)、韓国生体分子科学連合学会にて、ランチョンセミナーを開催します ... PDBx/mmCIF format files for crystallographic depositions to the Protein Data Bank (PDB) 伊藤暢聡(東京医科歯科大学) |
Spanner ... 完成すると、ログファイルとPDB形式の結果ファイルが電子 ... |
ジカウイルス - ペーパーモデル ... きます。 関連情報 - Learning Resources: Zika Virus…RCSB PDBの教育コンテンツサイト「PDB101 ... |
[wwPDB] OneDepから登録する際に、コンタクトオーサー(連絡先)情報で、ORCIDの入力が必須になります ... です。 この変更によって、wwPDBが、PDBエントリーを登録者に正しく ... |
3-3) 解析した構造を評価するために、OneDep検証サービスのパッケージは利用できますか? - validation FAQ - ... not been made available for distribution as it includes a lot of PDB-specific code that makes difficult to use elsewhere. Instead a publically accessible ... |
PDBjのMine2 関係データベース(RDB)に、 PDBeとUniProtが開発した SIFTS データが統合されました。 ... より、ユーザは、SQL検索を使って、PDBアーカイブ中のタンパク質配 ... |
[wwPDB] 計算構造モデルに対する拡張 ModelCIF ... する 蛋白質構造データバンク(PDB)コアアーカイブを支えるデータ ... |
PDBj Mine ... ス - PDBj Mine PDBj Mine はPDBjで開発した、PDBエントリーの検索サービスです ... |
[wwPDB] PDBアーカイブにおけるFTPファイル転送プロトコルの廃止について ファイルをダウンロードする際に使用されるFTPプロトコルは、HTTP/Sに取って代わられ、年々利用者が減っています。 HTTP/Sには、速度、ステートレス、セキュリティ(HTTPS)、より良いサポートなど、多くの利点があります。 重要なのは、過去2~3年の間に、主要なウェブブラウザ(ChromeとFirefox)がFTPプロトコルのサポートを終了したことで、 一般のユーザーにとっては、FTPプロトコルが事実上廃止されたのです。 インターネット上のファイルダウンロードの大部分がHTTP/Sに移行したこと ... |
IP/ホスト名によるアクセス -FAQ ... ください。 (ホスト名) PDBj FTPサーバ(PDB Archive含む): ftp.pdbj.org [質問一覧に戻 ... |
構造ビューアでスケールを表示 - 万見(JSmol) ... く 任意の構造を読み込む(例:PDB-1crn) 4. コンソールを開く 分子表 ... |
ニュース (2008年04月02日) David S. Goodsell博士が、RCSB-PDBのWeb pageに毎月掲載しており ... |
eF-surf eF-surf は PDBフォーマットファイルにある ... |