| [wwPDB] 将来的には、CCDやPDB IDが拡張されたPDBエントリーは、PDBx/mmCIFフォーマットでのみ提供する予定です ... _2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB pdb_00099xyz pdb_00099xyz 10.2210/pdb_00099xyz/pdb |
| [wwPDB] 拡張PDB IDフォーマット(pdb_00001abc)に関するリソースをご利用ください ... 改訂しました（例えば、"1abc "は "pdb_00001abc "になります）。 これにより、公 ... ロードしてください。 wwPDB recently announced that PDB three-character Chemical Component IDs have been consumed. Five-character alphanumeric ... IDs are now issued by the OneDep system. wwPDBは最近、PDBの3文字の化合物IDが消費 ... |
| [wwPDB] バージョン化と改訂履歴を導入した新しいPDBアーカイブの管理法について ... .cif.gz →../pdb_versioned/data/entries/ab/pdb_00001abc/pdb_00001abc/pdb_00001abc_xyz_v1-2.cif.gz ../pdb_versioned/views/all/coordinates/mmcif/ab/pdb_00001abc/pdb_00001abc/pdb_00001abc_xyz ... |
| ニュース (2004年07月30日) PDBデータ検索サービス(xPSSS)で、過去に登録されたTheoretical modelsの検索とダウンロードができるように改良いたしました。 |
| ニュース (2011年08月18日) PDB/RDFサービス を始めました。詳細は ヘルプページ をご覧ください。 |
| ニュース (2010年12月22日) PDBで公開済みのエントリー数が、 7万件を超えました 。（ wwPDBニュース... ） |
| ニュース (2011年04月13日) PDBアーカイブの バージョン4.0 が、2011年の夏に公開されます。( wwPDBニュース... ) |
| ニュース (2009年05月27日) PDB登録 の主要ページに日本語版を追加しました。 |
| ニュース (2004年06月23日) PDBデータ検索サービス(xPSSS)の検索結果にある Functional Details Page で、正しい鎖の名前が示されるように改良いたしました。 |
| 4-3) 同じエントリーに対して、昨年から、パーセンタイル順位が変わったのはなぜですか？ - validation FAQ - PDBアーカイブのエントリーの増加 ... |
| ペーパーモデル PDBに登録されている分子の構 ... |
| ニュース (2007年08月01日) PDBアーカイブデータの修正が完了し、2007年8月1日から ftp://ftp.wwpdb.org/ および、PDBj ftp ミラーサイトftp://pdb.protein.osaka-u.ac.jp/v3/から、ご利用いただけます。 |
| データ登録 PDBへの登録 wPDB 登録・アノテーショ ... ンパク質などの構造情報をPDBとBMRBに登録するツールです。 URL ... |
| 3-1) 精密化プログラムのログファイルからデータを取得して、完全なPDBxフォーマットのファイルを生成する方法を教えてください。 - wwPDB D&A FAQ - pdb_extractを使って、精密化した座標 ... を”採取する”ことができます。 pdb_extractを使うと、生成した座標や ... |
| ニュース (2015年4月12日) PDBのアーカイブデータの公開処理 ... いる蛋白質構造データバンク（PDB）のアーカイブデータの公開処理 ... |
| ニュース (2008年12月08日) ... ージョン3.15が公開されます PDBアーカイブの新しく標準化さ ... 前に公開されたファイルはPDBフォーマット バージョン3.15と ... |
| ニュース (2008年09月16日) PDBフォーマットガイド バージョン ... 力してきました。その成果が、PDBファイルのフォーマットをよ ... り完全に説明するPDBフォーマットガイド バージョン ... |
| ニュース (2008年11月25日) PDBフォーマットガイド バージョン ... 公開/更新される全てのPDBエントリーは、PDBフォーマットガイド バ ... |
| ニュース (2009年03月18日) PDBアーカイブ バージョン3.15が公 ... と拡張がされたバージョンのPDBアーカイブが ftp://ftp.protein.osaka-u.ac.jp ... 前に公開されたファイルはPDBフォーマット バージョン3.15準 ... す。手順は PDBjウェブサイトの “ PDB Archive/Snapshot Archive ” または、 http://www.wwpdb.org/downloads.html ... |
| ニュース (2016年10月15日) PDBの電子顕微鏡エントリーの改 ... ェクト ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26578576)は、PDBアーカイブ中で、電子顕微鏡と ... いディレクトリ(ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/test_data/EM/)に配置され、 改良データ ... れる予定です。 2017年に、現在のPDBアーカイブにあるファイルは ... |
| ニュース (2009年02月13日) PDBアーカイブバージョン3.15が、2009 ... 化し拡張されたバージョンのPDBアーカイブを ftp://ftp.protein.osaka-u.ac.jp ... 前に公開されたファイルは、PDBフォーマット バージョン3.15に ... 降に公開されたファイルは、PDBフォーマット バージョン3.20に ... す。手順は PDBjウェブサイトの PDB Archive/Snapshot Archive または、 http://www.wwpdb.org/downloads.html ... |
| 日本で解析された最初のCOVID-19関連エントリーが公開されました PDBデータが医薬品開発を加速す ... な研究が進められています。 PDBは地域分担で運営されてい ... 編集された後に世界共通のPDBアーカイブへ登録されます。 COVID ... ンプロテアーゼの構造でした（PDB ID: 6lu7）。 その後，沢山のCOVID-19関連 ... たずに公開されました（右図，PDB ID: 7dmu）。 新型コロナウイルス（SARS ... |
| ニュース (2012年10月19日) PDBの新しい辞書（BIRD）が、2012年12月 ... サイトで公開されます。 wwPDBは、PDBアーカイブ中の、ペプチド様の ... 情報などが含まれています。PDBエントリにペプチド様の抗 ... ・コビルカ氏に贈られました。 PDBには多くのGPCRが登録されて ... 造についての詳細は、 PDBe や RCSB PDB の記事もご覧ください。 PDBj で ... |
| クイックリンク ... 変換不可エントリー PDB形式変換不可エントリーは、 ... いくつかの理由によりPDBフォーマットの制限を超える ... ため、通常のPDBフォーマットでは表現できな ... いエントリーです。 PDBフォーマットの制限を超える ... ープIDと、各グループに所属するPDBエントリーを確認することが ... できます。 URL: https://pdbj.org/list-pdb-groups 化合物一覧 化合物一覧は ... 供します。 登録されている全PDB IDリストもこちらで入手で ... |
| ニュース (2014年3月19日) ... 造についての検証レポートが、PDBアーカイブで公開されていま ... 。 各エントリーのファイル群は、PDB IDの２文字（2文字目と3文 ... います。 例えば、1ABCのレポートは、/pdb/validation_reports/ab/1abc/というディレクト ... す画像（SVG） (例：1abc_multipercentile_validation.svg.gz) - 診断 PDBアーカイブからのデータのダウ ... 、容易に解釈することができ、PDBデータの利用者は、アーカイブ中 ... |
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件を2025-07-02に公開中
