| [wwPDB] PDBが標準的なクリエイティブ・コモンズ・オープンソース・ライセンスを採用 ... 全世界 (CC0 1.0)パブリック・ドメイン提供 ... ースライセンスである CC0 1.0 全世界 (CC0 1.0)パブリック・ドメイ ... |
| 対象を限定する（WHERE） ... す。 演算子 内容 例 結果 + 和 1 + 2 3 - 差 3 - 2 1 * 積 2 * 3 6 / 商（整数の割 ... 列を返す。開始位置は先頭が1。文字数の指定を省略すると ... Primate | Hominidae | Gorilla | gorilla | ニシゴリラ SELECT substr(Family,1,5) AS Family_first5 FROM Mammalia WHERE Order='Primate' ↓ Family_first5 -------------- Homin ... |
| テーブルの結合（JOIN） ... ができます。 SELECT テーブル名1.カラム名1, テーブル名2.カラム名2 ... FROM テーブル名1 JOIN テーブル名2 ON テーブル名 ... 1.カラム名3=テーブル名2.カラ ... |
| ニュース (2014年5月2日) ... Protein Structures (eProtS)で紹介されています。 1. J. C. Kendrew, R. E. Dickerson, B. E. Strandberg, et al. ( ... . S. Mathews. (1996) Refinement and structural analysis of bovine cytochrome b5 at 1.5 A resolution. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 52: 65-76. 12 ... |
| Spanner ... 明が記載されます。 - 利用方法 - 1. 鋳型構造の指定 2. 鋳型と構 ... . ジョブ名の指定（任意） 7. 実行 - 1. 鋳型構造の指定 - 2. 鋳型と構 ... - 動作原理 - 参照文献 利用方法 1. 鋳型構造の指定 2. 鋳型と構 ... えではなく、既定のマージンは1に設定されています。 代表的 ... |
| [wwPDB] PDBアーカイブとEMDBアーカイブのスナップショットを公開しました 2021年1月5日現在のPDBアーカイブ (wwPDB: ... ://snapshots.pdbj.org）に追加しました。 2005年1月以来、毎年、スナップショッ ... ます。 ディレクトリ 20210105は、2021年1月5日時点での173,005件の実 ... は、822 GBとなっています。 2021年1月4日現在のEMDBアーカイブ(ftp ... |
| 7-5) 電子密度マップ係数をMTZフォーマットへ変換する方法を教えてください。 - validation FAQ - ... とができます。 #!/usr/bin/env sh FILE1=$1 FILE2=$2 OUTPUT_FILE=$3 if [ -z "$FILE1 ... FILE1.cif IN_FILE2.cif OUT_FILE.mtz" exit 1 fi FILE1_MTZ=$FILE1.mtz FILE2_MTZ=$FILE2.mtz ... FILE1.cif IN_FILE2.cif OUT_FILE.mtz" exit 1 fi FILE1_MTZ=$FILE1.mtz FILE2_MTZ=$FILE2.mtz ... |
| ASH ... 博幸によって作られました[1]。 比較アルゴリズムの中心は ... 要を記すだけにとどめます。 1. NER （Number of Equivalent Residues、等価残基数）：空間 ... ワイズアライメント計算を１秒以内に行うことができま ... の解が得られます。 [参考文献] 1. Toh, H. (1997) Introduction of a distance cut-off into structural alignment ... |
| 12月7（土）－10日（火）に香港で開催される第12回アジア結晶学会にて、口頭発表およびポスター発表を行います。 ... :50-11:15 会場： Lecture Theatre J (MS-1) 発表番号： O1-1 (ASCA130144) 演者： 栗栖源嗣、中川敦 ... :50-11:15 - 会場： Lecture Theatre J (MS-1) - 発表番号： O1-1 (ASCA130144) - 演者： 栗栖源嗣、中川敦 ... |
| 2013年8月23日（金）、大阪中之島にてPDBj 講習会を開催します。 講習会の要旨を掲載しました。 ... ください。 講習会プログラム 1. 9:30～ 受付開始 2. 10:00 - 11:10 「 ... 情報工学センター） 講演資料 (pdf 1.4MB) データ： align_example.txt 1UJY.pdb 3ODU.pdb CCBP2- ... CKRall1128v2.CardC CCBP2-CKRall1128v2.aln 5. 講演資料 (pdf 1.4MB) 6. データ： align_example.txt 1UJY.pdb 3ODU.pdb CCBP2 ... |
| 構造の登録者、ならびに雑誌編集者や論文査読者を支援するため、wwPDBでは新たなX線構造検証レポートを発行します ... 言が取り入れられています [1,2]。 このレポートは、元々2014年公開 ... ったため、先行して2013年8月1日から、PDBe、PDBj、RCSB PDBで登録され ... タスクフォース（wwPDB X-ray Validation Task Force）[1,2]の勧告に従い準備が進め ... @mail.wwpdb.orgまでお送りください。 [1] Read RJ, Adams PD, Arendall WB, III, Brunger AT, Emsley P, Joosten ... |
| 事例紹介(1uan) ... 造ゲノミクス （SG）対象の１つです[1]。 構造が解明された当初は ... 要ページ（summary page）が表示されます。 １ページ戻り、2ixdA のアライメント ... が分かりましたか？ [参考文献] 1. Handa N, Terada T, Kamewari Y, Hamana H, Tame JR, Park SY ... |
| [wwPDB] wwPDBは設立20周年を迎えます ... )、核磁気共鳴(NMR)、電子顕微鏡(3DEM; 1,2)の実験手法で決定された ... (2)、 最も利用しやすいCreative Commons CC0 1.0 Universal License のライセンスの下で ... きることを保証しています。 - (1) Helen M. Berman, Kim Henrick, Haruki Nakamura. (2003) Announcing the worldwide Protein ... |
| GIRAF ... ）の指定方法は２つあります。 1. PDB IDによる指定 2. PDBフォーマ ... が表示されます。 結果ページは１週間後に削除されます。 表に ... ージが表示されます。 [参照文献] 1. Similarity search for local protein structures at atomic resolution by exploiting a ... |
| 第23回日本蛋白質科学会年会にてランチョンセミナーを開催します ... 名古屋市熱田区熱田西町1-1 Google Map） 1号館 3F D会場 定員 80名 参 ... |
| BINDS-PDBj講習会「PDBから見てわかるタンパク質の最新研究」(開催:2021-09-30) ... X, Linux版があります。最新版は1.15です。非商用目的での使用 ... ことを確認した。そこで、APETx1の1残基変異体15種を調製し、パ ... を行ったところ、ヘリックス1～2ターン分S4を細胞内側にシ ... |
| [wwPDB] PDBアーカイブとEMDBアーカイブのスナップショットを公開しました ... to ftp://snapshots.wwpdb.org and ftp://snapshots.pdbj.org. 2022年1月3日現在のPDBアーカイブ (wwPDB ... ます。 ディレクトリ 20220103は、2022年1月3日時点での185,541件の実 ... は、923 GBとなっています。 2022年1月3日現在のEMDBアーカイブ(ftp ... |
| [wwPDB] PDBアーカイブとEMDBアーカイブのスナップショットを公開しました ... PDB Core Archive as of January 2, 2023 is available. 2023年1月2日現在のPDBアーカイブ (ftp ... ます。 ディレクトリ 20230102は、2023年1月2日時点での199,755件の実 ... は、1086 GBとなっています。 2023年1月2日現在のEMDBアーカイブ(ftp ... |
| 第24回日本蛋白質科学会年会にてランチョンセミナーを開催します ... ー（札幌市⽩⽯区東札幌6条1丁目1-1 GoogleMap） E会場（部屋番号108） 参加 ... |
| [wwPDB] wwPDB NMR距離制限の改善により、標準的なNMR-STARおよびNEFフォーマットに準拠します ... では、PDBエントリーのNMRデータを1つのNMR-STAR/NEFファイルに統合 ... 項目、すなわち 「_Gen_dist_constraint.Auth_seq_ID_1」は、mmCIFの同等のデータ項目「_atom_site ... た化学シフトと距離制限を 1つのデータファイルに統合し ... |
| 文字列位置検出（STRPOS） ... の文字列関数）。 例：列「カラム名1」の値と、その中で「検索文字列 ... るかを得る SELECT カラム名1, STRPOS( カラム名1, 検索文字列) from テーブル ... |
| 利用規約 ... 由にご利用いただけます（CC0 1.0 全世界 パブリック・ドメイ ... 由にご利用いただけます（CC0 1.0 全世界 パブリック・ドメイ ... り記事によって異なります。 - 1番～300番（2000年～2024年）：David S. Goodsell and RCSB ... |
| 7/10（火）AJACS筑波4にてPDBjからも講演を行います ... 研究機構 千現地区研究本館1階第2会議室（茨城県つくば ... 市千現1-2-1）アクセス Google Map 参加費 無料 ... |
| 部分一致（LIKE） ... ます（参考：PostgreSQL 9.5.4文書 - 9.7.1. LIKE）。 LIKE のパターン指定において ... 0文字以上の文字（列） _ 任意の1文字 例えば、パターン「123%」は123、1234 ... い場合はILIKEを使います。 【書式1】大文字小文字を区別する SELECT ... |
| wwPDBの構造検証サーバが、新しくなりました。 ... た構造に対しても、初期の（preliminary*1）検証レポートを生成できるよ ... うになりました。 *1 validation FAQ) 検証レポートには、どんな ... 種類がありますか？ |
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件を2025-06-25に公開中
