| [wwPDB] 国際結晶学連合会議(IUCr, 8月21日-28日）で、発表を行います。 ... -044 （ホール MR 2.02）: Structural databases as teaching tools - Part A (macromolecules) 議長：Joel Sussman (Weizmann Institute)、Christine Zardecki (RCSB PDB) 10 ... |
| 詳細検索 ... 範囲（単位はオングストローム(Å)）を指定します。 由来する生物 ... |
| 第56回日本生物物理学会年会にて、PDBjランチョンセミナーを開催します ... 大学 津島キャンパス D会場（A棟3階 A36） [交通アクセス] 講演 ... |
| Spanner: SpannerもAlphaFoldなど同じように配列から構造を予測しますが、どのように違うのですか？ ... が、どのように違うのですか？ A) SpannerとAlphaFoldとの違いは、「templateを必要 ... |
| 著者名（citation_author）に「Ito, N.」と「Phillips, S.E.V.」の両方を含むエントリーのPDBIDを得る ... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid%0AFROM+brief_summary+b+%0AWHERE+'{"Ito ... |
| 高分子鎖の中にD体アミノ酸でできたポリペプチド（polypeptide(D)）だけを含むエントリーのPDBIDを得る ... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid%0AFROM+brief_summary+%0AWHERE+('{1}'+こ ... |
| 廃止または他のIDに置き換えられたエントリーのリスト - FAQ Q) 廃止または他のIDに置き換えられたエントリーのリストはありますか? A) PDBjのFTPサイトで配布しています。 詳しくはPDBj FTPサイトの詳細もご覧ください。 [質問一覧に戻る] |
| X線/中性子線ハイブリッド法の構造の登録について、構造因子ファイルの登録方法を教えてください。- FAQ ... 登録方法を教えてください。 A) 構造因子ファイルは以下の ... |
| PDBjのロゴデータはどこにありますか - FAQ ... ゴデータはどこにありますか？ A) こちらにあります。 PDBjに関す ... |
| jV のインストールの問題 -FAQ ... 示で問題が発生しています。 A) インストール・閲覧のトラブル ... |
| PDBデータ公開のタイミング、wwPDB各拠点での公開データについて - FAQ ... ングは異なるのでしょうか？ A) 世界協定時（UTC）の毎週水曜日 ... |
| 2-2) data processing（データ処理）に使用されたソフトウェアを選ぶ際、プルダウンリストの中に使用したソフトウェア名がありません。どうやって情報を入力できますか？ - wwPDB D&A FAQ - コミュニケーションページを使用して、足りない情報を入力してください。 担当のアノテータが、どのように進めればよいかを案内します。 また、登録構造のアノテーション処理中に、ソフトウェア情報をプルダウンリストに追加します。 [質問一覧に戻る] |
| PDBjViewerの問題 -FAQ Q) PDBjViewerを使用していますが、表示に問題があります。 A) PDBjViewerは、現在 jV と名前を変えています。 jVのダウンロードページ から最新版をインストールして下さい。 [質問一覧に戻る] |
| PDBアーカイブのX線結晶構造に対して、wwPDBの検証レポートが更新され、ご利用頂けるようになりました。 ... 、 また、wwPDB登録・アノテーション（D&A）システムの開発を進め、 登録 ... |
| 3-1) 精密化プログラムのログファイルからデータを取得して、完全なPDBxフォーマットのファイルを生成する方法を教えてください。 - wwPDB D&A FAQ - pdb_extractを使って、精密化した座標ファイル、実験データファイル（例：構造因子）、精密化プログラムのログファイル、登録者情報のテンプレートファイル（もしあれば） から、データを”採取する”ことができます。 pdb_extractを使うと、生成した座標や実験データファイルをPDBx/mmCIFフォーマットで生成できるので、そのまま検証や登録に使用することができます。 [質問一覧に戻る] |
| EM Data Bankのデータ利用について -FAQ ... 元はどうすればよいですか？ A) EM Data Bankのデータは、無料で自由 ... |
| jV アプレット版の問題 -FAQ ... ーが発生して表示できません。 A) JRE6 Update15(1.6.0_15), JRE6 Update16(1.6.0_16 ... |
| データ登録 ... 登録 wPDB 登録・アノテーション（D&A）システム は、wwPDBが開発した、新 ... |
| ニュース (2016年5月26日) ... 学データセンター（英)) "The Cambridge Structural Database（CSD）‐ a vital resource for structural chemistry and biology" （ケンブリッ ... |
| IP/ホスト名によるアクセス -FAQ ... クセスできなくなりました。 A) 2012年のミラーサイトの設置以 ... |
| PDBのXML Schema -FAQ Q) PDBのXML文書に対するXML Schemaはどこにありますか？ A) PDBML、PDBMLaddに対するXML Schemaは下記をご覧ください。 - PDBML - PDBMLadd [質問一覧に戻る] |
| 3-4) 構造因子ファイルをmmCIFフォーマットに変換する方法を教えてください。 - wwPDB D&A FAQ - SF-tool (sf-tool.wwpdb.org)を使って、構造因子ファイルをmmCIFフォーマットに変換することができます。 [質問一覧に戻る] |
| PDBのXMLフォーマットやサービスについて -FAQ ... いて、参考文献がありますか？ A) XMLフォーマットについては下 ... |
| RasMacで認識できない -FAQ ... イルがRasMacで認識できません。 A) RasMacのバグだと思われます。 対 ... |
| PDBデータ・画像等の引用についての問合わせ先 - FAQ ... 合わせる必要がありますか？ A) 2003年よりPDBjは、 RCSB PDB 、 PDBe との３ ... |
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件を2025-04-23に公開中
