CRNPRED ... 蛋白質構造の高精度予測) Kinjo, A. R.; Nishikawa, K. BMC Bioinformatics 7 :401 (2006) [Primary reference] 2. Predicting ... 毎コンタクトオーダの予測) Kinjo, A. R.; Nishikawa, K. BIOPHYSICS 1 :67-74 (2005) [Basic methodology] 3. Recoverable ... |
[wwPDB] IUCrでポスター賞授与 ... ), Minyoung Kim (1,2), Qingqiu Huang (3), Aaron D. Finke (3), Daniel A. Keedy (1,4) 1) Structural Biology Initiative, CUNY Advanced Science Research Center ... |
EDM viewer ... な値であり、約0.4〜0.45電子/Å^3の電子密度に相当します ... |
2021年11月24日(水)オンラインにて「PDBアジア地区50周年記念シンポジウム」を開催します ... ンター、上海科学技術大学、中国) 「A new era in structural biology: the impact of structure prediction using AI ... |
[wwPDB] 化学のためのオープンソース・ツールに関するワークショップ ... , Protein Data Bank in Europe (PDBe) - How to Interpret the Quality of a PDB Structure using the wwPDB validation report(wwPDB検証レポ ... |
GIRAF: 検索結果一覧ページの中身が空 -FAQ ... 果一覧ページの中身が空です。 A) GIRAFでは検索処理を行う際、PDB ... |
[wwPDB] PDBアーカイブとEMDBアーカイブのスナップショットを公開しました ... サイト https://s3snapshots.rcsb.org/、 snapshots.rcsb.org (rsync -rlpy -a -v --delete snapshots.rcsb.org:: .) 及び ftp://snapshots.pdbj.org に ... |
wwPDB 新登録・編集システム -よくあるご質問(FAQ)- ... ンド情報を入力しましたが、”a ligand mismatch requires attention(リガンドのミスマ ... |
[wwPDB] PDBアーカイブから、NMR実験データを統合フォーマットで提供します ... 方、NEF (NMR exchange format; Gutmanas et al. (2015) NMR Exchange Format: a unified and open standard for representation of NMR restraint data Nature Structural ... |
entity.typeでは各エンティティー(分子種)ごとにpolymer/non-polymerなどの分子タイプが規程されていますが、その判断基準はどのようになっているでしょうか? - FAQ ... うになっているでしょうか? A) 現在、ペプチド鎖の場合は3 ... |
FAQ ... んで良いのかわかりません。 A) 下記から該当の実験手法に ... |
1-1) PDBへ生データを登録できますか?- wwPDB D&A FAQ - 登録者は登録構造の生データを登録し、wwPDB OneDepシステムから構造を登録する際に、“Related Entries(関連エントリー)”に対応するDOIを記載することが推奨されます。 以下のキュレーション付きアーカイブへ登録してください。 - X線結晶構造 - ProteinDiffraction.org - https://proteindiffraction.org - SBGrid - https://sbgrid.org - CXIDB - http://www.cxidb. ... |
PDB形式変換不可かどうかの識別 - FAQ ... どこに記載されていますか? A) PDBx/mmCIFまたはPDBMLで、pdbx_database_status.pdb_format ... |
NMR統合データ ... 方、NEF (NMR exchange format; Gutmanas et al. (2015) NMR Exchange Format: a unified and open standard for representation of NMR restraint data Nature Structural ... |
[wwPDB] PDB50会議のポスター賞受賞者 ... : Nicholas Mamisashvili, Shelter Island High School, Molecular Dynamics Simulation of 6PEY.pdb a Novel Mutation in the Enzyme Methylenetetrahydrofolate Reductase - 大学生最優 ... |
6月22日(木)、 第17回日本蛋白質科学会年会 にて、ランチョンセミナーを開催します。 ... Bekker(大阪大学蛋白質研究所) "Molmil: A versatile WebGL based molecular viewer" (モル見る:WebGLを使 ... |
分解能が2.0Åより高いエントリーのPDBIDを得る ... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid%2C+ls_d_res_high+AS ... |
高分子鎖の中にD体とL体両方のポリペプチド鎖を含むエントリーのPDBIDを得る ... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+WHERE+'{1%2C2 ... |
アミノ酸配列でPDBエントリーを検索 - FAQ ... のはどうすればよいですか? A) PDBjページトップにある検索ボ ... |
wwPDB/RDF ... _struct_asym rdf:resource="https://rdf.wwpdb.org/pdb/1GOF/struct_asym/A"/> |
高分子鎖の中にD体ポリペプチド(polypeptide(D))を含むエントリーのPDBIDを得る ... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+WHERE+'{1}'+こ ... |
9月27日 (水)、第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2017)にて、ランチョンセミナーを開催します ... 道大学情報科学研究科棟2F A会場 席数 80席 <演者・演題> - 栗栖 ... |
検索サービス ... .org/cc (chem_comp/RDF) SeSAW SeSAW ( Se quence-Derived S tructural A lignment W eights)は、蛋白質に含まれる ... |
PDBjの新しいツールと活動を紹介した論文が、Protein Scienceから公開されました。 ... functions in Data-out activities at Protein Data Bank Japan (PDBj) Kinjo, A.R., Bekker, G.-J., Wako, H., Endo, S., Tsuchiya, Y., Sato, H ... |
文献著者名に「Ito, N.」を含むエントリーのPDBIDを得る ... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query= SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+b+WHERE+'{"Ito ... |