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CRNPRED

... 蛋白質構造の高精度予測) Kinjo, A. R.; Nishikawa, K. BMC Bioinformatics 7 :401 (2006) [Primary reference] 2. Predicting ... 毎コンタクトオーダの予測) Kinjo, A. R.; Nishikawa, K. BIOPHYSICS 1 :67-74 (2005) [Basic methodology] 3. Recoverable ...

EDM viewer

... な値であり、約0.4〜0.45電子/Å^3の電子密度に相当します ...

2021年11月24日(水)オンラインにて「PDBアジア地区50周年記念シンポジウム」を開催します

... ンター、上海科学技術大学、中国) 「A new era in structural biology: the impact of structure prediction using AI ...

[wwPDB] IUCrでポスター賞授与

... ), Minyoung Kim (1,2), Qingqiu Huang (3), Aaron D. Finke (3), Daniel A. Keedy (1,4) 1) Structural Biology Initiative, CUNY Advanced Science Research Center ...

今月の分子の文章や画像を転載するにはどうすればいいですか? - FAQ

... にはどうすればいいですか? A 図についてはクレジットを ...

[wwPDB] 化学のためのオープンソース・ツールに関するワークショップ

... , Protein Data Bank in Europe (PDBe) - How to Interpret the Quality of a PDB Structure using the wwPDB validation report(wwPDB検証レポ ...

FAQ

... んで良いのかわかりません。 A) 下記から該当の実験手法に ...

GIRAF: 検索結果一覧ページの中身が空 -FAQ

... 果一覧ページの中身が空です。 A) GIRAFでは検索処理を行う際、PDB ...

[wwPDB] PDBアーカイブとEMDBアーカイブのスナップショットを公開しました

... サイト https://s3snapshots.rcsb.org/、 snapshots.rcsb.org (rsync -rlpy -a -v --delete snapshots.rcsb.org:: .) 及び ftp://snapshots.pdbj.org に ...

wwPDB 新登録・編集システム -よくあるご質問(FAQ)-

... ンド情報を入力しましたが、”a ligand mismatch requires attention(リガンドのミスマ ...

1-1) PDBへ生データを登録できますか?- wwPDB D&A FAQ -

登録者は登録構造の生データを登録し、wwPDB OneDepシステムから構造を登録する際に、“Related Entries(関連エントリー)”に対応するDOIを記載することが推奨されます。 以下のキュレーション付きアーカイブへ登録してください。 - X線結晶構造 - ProteinDiffraction.org - https://proteindiffraction.org - SBGrid - https://sbgrid.org - CXIDB - http://www.cxidb. ...

PDB形式変換不可かどうかの識別 - FAQ

... どこに記載されていますか? A) PDBx/mmCIFまたはPDBMLで、pdbx_database_status.pdb_format ...

NMR統合データ

... 方、NEF (NMR exchange format; Gutmanas et al. (2015) NMR Exchange Format: a unified and open standard for representation of NMR restraint data Nature Structural ...

[wwPDB] PDB50会議のポスター賞受賞者

... : Nicholas Mamisashvili, Shelter Island High School, Molecular Dynamics Simulation of 6PEY.pdb a Novel Mutation in the Enzyme Methylenetetrahydrofolate Reductase - 大学生最優 ...

6月22日(木)、 第17回日本蛋白質科学会年会 にて、ランチョンセミナーを開催します。

... Bekker(大阪大学蛋白質研究所) "Molmil: A versatile WebGL based molecular viewer" (モル見る:WebGLを使 ...

分解能が2.0Åより高いエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid%2C+ls_d_res_high+AS ...

高分子鎖の中にD体とL体両方のポリペプチド鎖を含むエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+WHERE+'{1%2C2 ...

wwPDB/RDF

... _struct_asym rdf:resource="https://rdf.wwpdb.org/pdb/1GOF/struct_asym/A"/>

アミノ酸配列でPDBエントリーを検索 - FAQ

... のはどうすればよいですか? A) PDBjページトップにある検索ボ ...

高分子鎖の中にD体ポリペプチド(polypeptide(D))を含むエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+WHERE+'{1}'+こ ...

9月27日 (水)、第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2017)にて、ランチョンセミナーを開催します

... 道大学情報科学研究科棟2F A会場 席数 80席 <演者・演題> - 栗栖 ...

文献著者名に「Ito, N.」を含むエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query= SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+b+WHERE+'{"Ito ...

検索サービス

... .org/cc (chem_comp/RDF) SeSAW SeSAW ( Se quence-Derived S tructural A lignment W eights)は、蛋白質に含まれる ...

PDBID 1iqq と 1ioo の実験手法(exptl/method)、単位格子の3辺の長さと角度、P値(密度値、exptl_crystal/density_percent_sol の値)を得る

... 索はこちら SELECT exptl.pdbid, exptl.method, cell.length_a, cell.length_b, cell.length_c, exptl_crystal.density_percent_sol FROM ...

PDBjの新しいツールと活動を紹介した論文が、Protein Scienceから公開されました。

... functions in Data-out activities at Protein Data Bank Japan (PDBj) Kinjo, A.R., Bekker, G.-J., Wako, H., Endo, S., Tsuchiya, Y., Sato, H ...

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件を2025-07-09に公開中

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