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CRNPRED

... 蛋白質構造の高精度予測) Kinjo, A. R.; Nishikawa, K. BMC Bioinformatics 7 :401 (2006) [Primary reference] 2. Predicting ... 毎コンタクトオーダの予測) Kinjo, A. R.; Nishikawa, K. BIOPHYSICS 1 :67-74 (2005) [Basic methodology] 3. Recoverable ...

[wwPDB] IUCrでポスター賞授与

... ), Minyoung Kim (1,2), Qingqiu Huang (3), Aaron D. Finke (3), Daniel A. Keedy (1,4) 1) Structural Biology Initiative, CUNY Advanced Science Research Center ...

EDM viewer

... な値であり、約0.4〜0.45電子/Å^3の電子密度に相当します ...

2021年11月24日(水)オンラインにて「PDBアジア地区50周年記念シンポジウム」を開催します

... ンター、上海科学技術大学、中国) 「A new era in structural biology: the impact of structure prediction using AI ...

[wwPDB] 化学のためのオープンソース・ツールに関するワークショップ

... , Protein Data Bank in Europe (PDBe) - How to Interpret the Quality of a PDB Structure using the wwPDB validation report(wwPDB検証レポ ...

GIRAF: 検索結果一覧ページの中身が空 -FAQ

... 果一覧ページの中身が空です。 A) GIRAFでは検索処理を行う際、PDB ...

[wwPDB] PDBアーカイブとEMDBアーカイブのスナップショットを公開しました

... サイト https://s3snapshots.rcsb.org/、 snapshots.rcsb.org (rsync -rlpy -a -v --delete snapshots.rcsb.org:: .) 及び ftp://snapshots.pdbj.org に ...

wwPDB 新登録・編集システム -よくあるご質問(FAQ)-

... ンド情報を入力しましたが、”a ligand mismatch requires attention(リガンドのミスマ ...

[wwPDB] PDBアーカイブから、NMR実験データを統合フォーマットで提供します

... 方、NEF (NMR exchange format; Gutmanas et al. (2015) NMR Exchange Format: a unified and open standard for representation of NMR restraint data Nature Structural ...

entity.typeでは各エンティティー(分子種)ごとにpolymer/non-polymerなどの分子タイプが規程されていますが、その判断基準はどのようになっているでしょうか? - FAQ

... うになっているでしょうか? A) 現在、ペプチド鎖の場合は3 ...

FAQ

... んで良いのかわかりません。 A) 下記から該当の実験手法に ...

1-1) PDBへ生データを登録できますか?- wwPDB D&A FAQ -

登録者は登録構造の生データを登録し、wwPDB OneDepシステムから構造を登録する際に、“Related Entries(関連エントリー)”に対応するDOIを記載することが推奨されます。 以下のキュレーション付きアーカイブへ登録してください。 - X線結晶構造 - ProteinDiffraction.org - https://proteindiffraction.org - SBGrid - https://sbgrid.org - CXIDB - http://www.cxidb. ...

PDB形式変換不可かどうかの識別 - FAQ

... どこに記載されていますか? A) PDBx/mmCIFまたはPDBMLで、pdbx_database_status.pdb_format ...

NMR統合データ

... 方、NEF (NMR exchange format; Gutmanas et al. (2015) NMR Exchange Format: a unified and open standard for representation of NMR restraint data Nature Structural ...

[wwPDB] PDB50会議のポスター賞受賞者

... : Nicholas Mamisashvili, Shelter Island High School, Molecular Dynamics Simulation of 6PEY.pdb a Novel Mutation in the Enzyme Methylenetetrahydrofolate Reductase - 大学生最優 ...

6月22日(木)、 第17回日本蛋白質科学会年会 にて、ランチョンセミナーを開催します。

... Bekker(大阪大学蛋白質研究所) "Molmil: A versatile WebGL based molecular viewer" (モル見る:WebGLを使 ...

分解能が2.0Åより高いエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid%2C+ls_d_res_high+AS ...

高分子鎖の中にD体とL体両方のポリペプチド鎖を含むエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+WHERE+'{1%2C2 ...

アミノ酸配列でPDBエントリーを検索 - FAQ

... のはどうすればよいですか? A) PDBjページトップにある検索ボ ...

wwPDB/RDF

... _struct_asym rdf:resource="https://rdf.wwpdb.org/pdb/1GOF/struct_asym/A"/>

高分子鎖の中にD体ポリペプチド(polypeptide(D))を含むエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+WHERE+'{1}'+こ ...

9月27日 (水)、第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2017)にて、ランチョンセミナーを開催します

... 道大学情報科学研究科棟2F A会場 席数 80席 <演者・演題> - 栗栖 ...

検索サービス

... .org/cc (chem_comp/RDF) SeSAW SeSAW ( Se quence-Derived S tructural A lignment W eights)は、蛋白質に含まれる ...

PDBjの新しいツールと活動を紹介した論文が、Protein Scienceから公開されました。

... functions in Data-out activities at Protein Data Bank Japan (PDBj) Kinjo, A.R., Bekker, G.-J., Wako, H., Endo, S., Tsuchiya, Y., Sato, H ...

文献著者名に「Ito, N.」を含むエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query= SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+b+WHERE+'{"Ito ...

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件を2025-04-09に公開中

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