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[wwPDB] 化学のためのオープンソース・ツールに関するワークショップ

... , Protein Data Bank in Europe (PDBe) - How to Interpret the Quality of a PDB Structure using the wwPDB validation report(wwPDB検証レポ ...

特定種のポリマーを含むエントリーを検索 - FAQ

... にはどうすればいいですか? A) 詳細条件検索でポリマーの種 ...

教材

... HM, Burley SK (2015) The RCSB PDB “Molecule of the Month”: Inspiring a Molecular View of Biology. PLoS Biol 13(5): e1002140. doi:10.1371 ...

[wwPDB] PDBのエントリー数が15万件を突破しました

... , 2017) - How community has shaped the Protein Data Bank (Structure, 2013) - Creating a Community Resource for Protein Science (Protein Science, 2012) 全文献リ ...

PDB形式変換不可かどうかの識別 - FAQ

... どこに記載されていますか? A) PDBx/mmCIFまたはPDBMLで、pdbx_database_status.pdb_format ...

FAQ

... んで良いのかわかりません。 A) 下記から該当の実験手法に ...

X線/中性子線ハイブリッド法の構造の登録について、構造因子ファイルの登録方法を教えてください。- FAQ

... 登録方法を教えてください。 A) 構造因子ファイルは以下の ...

高分子鎖の中にD体ポリペプチド(polypeptide(D))を含むエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+WHERE+'{1}'+こ ...

EDM viewer

... な値であり、約0.4〜0.45電子/Å^3の電子密度に相当します ...

[wwPDB] IUCrでポスター賞授与

... ), Minyoung Kim (1,2), Qingqiu Huang (3), Aaron D. Finke (3), Daniel A. Keedy (1,4) 1) Structural Biology Initiative, CUNY Advanced Science Research Center ...

Spanner: SpannerもAlphaFoldなど同じように配列から構造を予測しますが、どのように違うのですか?

... が、どのように違うのですか? A) SpannerとAlphaFoldとの違いは、「templateを必要 ...

[wwPDB] PDB50会議のポスター賞受賞者

... : Nicholas Mamisashvili, Shelter Island High School, Molecular Dynamics Simulation of 6PEY.pdb a Novel Mutation in the Enzyme Methylenetetrahydrofolate Reductase - 大学生最優 ...

2021年11月24日(水)オンラインにて「PDBアジア地区50周年記念シンポジウム」を開催します

... ンター、上海科学技術大学、中国) 「A new era in structural biology: the impact of structure prediction using AI ...

PDBID 1iqq と 1ioo の実験手法(exptl/method)、単位格子の3辺の長さと角度、P値(密度値、exptl_crystal/density_percent_sol の値)を得る

... 索はこちら SELECT exptl.pdbid, exptl.method, cell.length_a, cell.length_b, cell.length_c, exptl_crystal.density_percent_sol FROM ...

PDBjの新しいツールと活動を紹介した論文が、Protein Scienceから公開されました。

... functions in Data-out activities at Protein Data Bank Japan (PDBj) Kinjo, A.R., Bekker, G.-J., Wako, H., Endo, S., Tsuchiya, Y., Sato, H ...

11月30日(水)〜12月2日(金)に、パシフィコ横浜で開催される 第39回 日本分子生物学会年会 にブース出展します。

... 場:パシフィコ横浜 展示ホール A・B・C 特別企画バイオデータヘ ...

高分子鎖の中にD体とL体両方のポリペプチド鎖を含むエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+WHERE+'{1%2C2 ...

分解能が2.0Åより高いエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query=SELECT+pdbid%2C+ls_d_res_high+AS ...

フォーマット変換: ファイルフォーマットをPDBフォーマット - PDBx/mmCIF の間で変換するサービスはありますか - FAQ

... 換するサービスはありますか A)フォーマット変換のウェブサ ...

第56回日本生物物理学会年会にて、PDBjランチョンセミナーを開催します

... 大学 津島キャンパス D会場(A棟3階 A36) [交通アクセス] 講演 ...

11/11(日)、日本結晶学会 2018年度年会および総会にて、ランチョンセミナーを開催します

... 工業大学 大岡山キャンパス A会場 西9号館 3階 W933教室 <演 ...

アミノ酸配列でPDBエントリーを検索 - FAQ

... のはどうすればよいですか? A) PDBjページトップにある検索ボ ...

文献著者名に「Ito, N.」を含むエントリーのPDBIDを得る

... エントリーのPDBIDを得る 検索は<a href="/mine/sql?query= SELECT+pdbid+FROM+brief_summary+b+WHERE+'{"Ito ...

1-10) 構造予測コンテストの登録であることを指定する方法を教えてください。 - wwPDB D&A FAQ -

「Release Status(公開条件)」ページで、「Y(はい)」を選択して、登録構造が予測ターゲットであることを指定してください。 既存構造に対する配列の一致度合いが50%以下であるか、さもなければ、予測対象として興味深いと考える場合は、CASPなど適切な開発方法を選択してください。 [質問一覧に戻る]

PDBjのロゴデータはどこにありますか - FAQ

... ゴデータはどこにありますか? A) こちらにあります。 PDBjに関す ...

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件を2024-06-26に公開中

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