| 実験手法 ... する数値で指定して下さい。 1. X線回折（X-RAY DIFFRACTION） 2. 中性子回 ... |
| バージョン化されたPDBエントリー ... 合、メジャーバージョンの数字が1増加します。 その他の変更は ... |
| [wwPDB] 結晶構造のPDBへの登録において、本日からPDBx/mmCIFフォーマットファイルが必須になりました 本日2019年7月1日より、結晶構造解析法によ ... |
| jV: 精密な画像の保存 -FAQ ... です。この例の場合、元の絵の1.3倍に拡大されます。 この後 ... |
| ニュース (2017年4月20日) ... 阪府吹田市山田丘3-2） 本館１階講堂横のセミナー室 [Map] [Google Map ... |
| 6-1) リガンド分子の幾何構造は、PDBではどのように検証されますか？ - validation FAQ - wwPDBの検証レポートでは、低分子有機物構造を集めたケンブリッジ構造データベース（CSD）に対して、 CCDC Mogulプログラムを使って、リガンドの幾何構造の検証を行います。 リガンド内の結合長、結合角、ねじれ角、リング各々に対して、Mogulは特徴を含む構造を同定し、観測された値に対する分布をつくります。 Engh & Huberは、CSDが、天然アミノ酸に対して幾何学情報のよい情報源となることを示しました。 Mogulは、リガンドに対して、よく似たアプローチをとっています。 リガンド内の結合長、結 ... |
| PDBjのウェブインターフェースについて ... れかの対応をご検討下さい。 1. ご利用のウェブブラウザの ... |
| Chain IDの付け方の規則について -FAQ ... 来は、PDBフォーマットの制限内（１文字）でChain IDを記述する必要 ... |
| NMRと電子顕微鏡法によって決定された構造に対して、新しい検証レポートが公開されます。 ... るために作られました。 2016年1月から、 NMRと電子顕微鏡法に ... |
| 10月28日（月）に、京都国際会館にて開催される第51回日本生物物理学会年会にて、ランチョンセミナーを実施いたします。 ... －13：20 - 会場（部屋名）： C 会場（Room C-1） - 席数： 100席 - 演者・演題： Activities of PDBj and ... |
| PDBアーカイブファイルのPDBx/mmCIF辞書のバージョンが、V4からV5へ更新されます。 ... 頂けます (https://www.wwpdb.org/documentation/remediation)。 2016年1月からは、OneDepシステム (http://wwpdb.org ... |
| 9-1) 登録後の問合わせ方法を教えてください。- wwPDB D&A FAQ - 登録について質問がある場合は、自身の登録セッションにログインし、コミュニケーションページから、wwPDBアノテーションスタッフとやりとりできます。 コミュニケーションページは、登録ツールの最下部にあります。 [質問一覧に戻る] |
| ニュース (2015年2月14日) ... PDB、PDBe、PDBjの間で同期された、週１回のスケジュールで、PDBアーカイ ... |
| 理論モデル（Theoretical Models） 理論モデル（Theoretical Models） 2002年7月1日から、PDBは、理論モデルによ ... |
| wwPDBのOneDepシステムに関する論文が公開されました。 ... もに、原子座標の登録過程の１つの窓口を提供するという ... |
| 8-1) 座標や実験データを差し替える方法を教えてください。- wwPDB D&A FAQ - アップロードしたファイルは、登録前（４文字のPDB IDが発行される前）でも登録後（PDB IDが発行され、PDBアノテーションスタッフが登録構造を処理中又は処理した後）でも、差替えることができます。 登録前の差し替え: 座標ファイルの差し替えは、"Replacement upload（差し替えアップロード）"ページを利用して、登録前のいつでも行うことができます。 新しい座標ファイルをアップロードし、データの種別を選択してください。 ファイル一覧で、新しい座標ファイルを選択して、以前にアップロー ... |
| ニュース（2015年10月6日） ... ） 席数 100席 <講習会プログラム> 1. 「PDBjとwwPDBの活動について」 講師 ... |
| 11月9日（土）・10日（日）に、東京お台場にて開催される サイエンスアゴラ に出展します。 ... :00‐17:00 - 会場： 日本科学未来館1階A会場 ブースNo. Aa-041 〒135-0064 東 ... |
| ニュース (2014年12月3日) ... 、署名を更新しています。4.4.1の署名に用いている証明書 ... |
| ニュース（2015年10月15日） ... ンセミナーを開催いたします。 (1) Gert-Jan BEKKER（大阪大学蛋白質研究 ... |
| 3-1) 精密化プログラムのログファイルからデータを取得して、完全なPDBxフォーマットのファイルを生成する方法を教えてください。 - wwPDB D&A FAQ - pdb_extractを使って、精密化した座標ファイル、実験データファイル（例：構造因子）、精密化プログラムのログファイル、登録者情報のテンプレートファイル（もしあれば） から、データを”採取する”ことができます。 pdb_extractを使うと、生成した座標や実験データファイルをPDBx/mmCIFフォーマットで生成できるので、そのまま検証や登録に使用することができます。 [質問一覧に戻る] |
| 構造因子 ... れた構造因子データ 2008年2月1日より、Ｘ線結晶解析による ... |
| PDB ID ... られます。最初の文字は必ず1から9までの数字で、残りの ... |
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件を2025-06-25に公開中
