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ニュース (2012年05月01日) 2012年4月30日をもちまして、xPSSSサービスおよびSOAPサービスを終了させていただきました。今後は PDBj Mine および PDBj Mine RESTサービス を利用ください。 2012年4月30日(月・祝)に行われました大阪大学いちょう祭における PDBj のイベント内容 を掲載しています。ご興味のある方は是非ご覧ください。 |
BMRB登録・編集に関するお問い合わせ お問い合わせ内容は、wwPDBの他の拠点と共有しています。お問い合わせは必ず英語でお願い致します。 登録全般に関するお問い合わせ NMR実験データのBMRB登録・編集、およびADIT-NMRの登録サイトに関する一般的なご意見ご質問を以下のフォームにて受け付けております。 登録方法に関するご質問は、まず日本語チュートリアルやADIT-NMRの入力支援情報にお目を通した上でお問い合わせください。 ADIT-NMRの入力項目ではデータ記入ができない、記述方法が不明であるといった技術的・学術的内容に関するお ... |
新しいユーザのためのガイド |
ニュース (2012年03月26日) jVの最新版(jV4.2)がリリースされました。 eF-siteで配布されるPyMOL用ポリゴンファイル(CGOファイル)の読み込み機能が加わり、 コマンド「load polygon_cgo」が追加されました。 詳細は リリースノート をご覧ください。 |
ニュース (2012年03月16日) アーカイブの増加 2012年3月13日付の更新により、80,041件の構造データが公開されています。 2010年12月に公開データ数は70,000件に達した後、2011年には8865件の構造データが登録・編集され、8107件が公開されました。 wwPDBの登録数とダウンロード数の統計は定期的に更新されています。 会議報告 PDB40シンポジウムの報告書が掲載されました。 The Protein Data Bank at 40: Reflecting on the Past to Prepare ... |
ニュース (2012年03月07日) 2012年3月7日に、EMデータバンク(EMDB) がPDBアーカイブに追加されました。今後は PDBj の ftp サイト( ftp://pdb.protein.osaka-u.ac.jp/pub/emdb )からお使い頂けます。 過去のニュース もご覧ください。 |
ニュース (2012年03月05日) 2012年3月2日に行われました「統合データベース講習会」における 講習内容 を掲載しています。ご興味のある方は是非ご覧下さい。 |
ニュース (2012年02月08日) 2012年2月7日に行われました「H23年度大阪大学蛋白研セミナー PDBj 講習会」における 講習内容 を掲載しています。ご興味のある方は是非ご覧下さい。 |
ニュース (2011年12月20日) EMデータバンクがPDBアーカイブに追加されます 三次元電子顕微鏡法によって決定したマップの一次アーカイブ、EMデータバンク(EMDB)が、2012年3月7日にPDBアーカイブに追加されます。 EMDBの wwPDB への統合によって、3DEMの結果は全て、一つのアーカイブに追加されます。 wwPDBは、様々な実験手法を網羅するようなCommon DepositionAnnotation Toolの開発を進めており、EMDBの統合は、DA Toolの開発において重要なステップとなります。 ... |
ニュース (2011年12月05日) 2011年11月25日に行われました2011年日本結晶学会年会におけるランチョンセミナーの 発表内容 を掲載しています。ご興味のある方は是非ご覧下さい。 |
ニュース (2011年09月20日) 2011年9月16日に行われました第49回日本生物物理学会におけるランチョンセミナーの 発表内容 を掲載しています。来年以降に実施予定の新PDBフォーマットや、PDB/RDFについて紹介しておりますので、ご興味のある方は是非ご覧下さい。 |
ニュース (2011年08月18日) PDB/RDFサービス を始めました。詳細は ヘルプページ をご覧ください。 |
ニュース (2011年07月13日) 新しいPDBMLplusスキーマ(pdbMLplus_v40.xsd) を公開しました。詳細は ヘルプページ をご覧下さい。 PDBML (ver 4.0)をパースできるjVの最新版(jV4.0)がリリースされました。jV 4.0 より以前の版では、PDBML (ver 4.0)をパースできないことがありますので、ご注意ください。最新版は こちら からダウンロードしてお使い下さい。 wwPDBは、PDB Exchange Dictionaryのバージョン4.0に準拠した新しいバージョンのファイ ... |