PDB: 446 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

---

8GXC	Crystal structure of NAD+ -II riboswitch in complex with NMN 分子名称: 61-mer RNA, BETA-NICOTINAMIDE RIBOSE MONOPHOSPHATE, MAGNESIUM ION, ... 著者 Xu, X.C, Ren, A.M. 登録日 2022-09-19 公開日 2023-01-18 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structure-based investigations of the NAD+-II riboswitch. Nucleic Acids Res., 51, 2023
7ELR	Crystal structure of xanthine riboswitch with xanthine 分子名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, MAGNESIUM ION, NMT1 (46-MER), ... 著者 Xu, X.C, Ren, A.M. 登録日 2021-04-12 公開日 2021-06-30 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.66 Å) 主引用文献 Insights into xanthine riboswitch structure and metal ion-mediated ligand recognition. Nucleic Acids Res., 49, 2021
7ELS	Crystal structure of xanthine riboswitch with 8-azaxanthine 分子名称: 8-AZAXANTHINE, GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, MAGNESIUM ION, ... 著者 Xu, X.C, Ren, A.M. 登録日 2021-04-12 公開日 2021-06-30 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 Insights into xanthine riboswitch structure and metal ion-mediated ligand recognition. Nucleic Acids Res., 49, 2021
7ELQ	Crystal structure of xanthine riboswitch with xanthine, manganese saok 分子名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, MAGNESIUM ION, MANGANESE (II) ION, ... 著者 Xu, X.C, Ren, A.M. 登録日 2021-04-12 公開日 2021-06-30 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Insights into xanthine riboswitch structure and metal ion-mediated ligand recognition. Nucleic Acids Res., 49, 2021
7ELP	Crystal structure of xanthine riboswitch with xanthine, iridium hexammine soak 分子名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, IRIDIUM ION, MAGNESIUM ION, ... 著者 Xu, X.C, Ren, A.M. 登録日 2021-04-12 公開日 2021-06-30 最終更新日 2024-05-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.79 Å) 主引用文献 Insights into xanthine riboswitch structure and metal ion-mediated ligand recognition. Nucleic Acids Res., 49, 2021
5NZ3	The structure of the thermobifida fusca guanidine III riboswitch with methylguanidine 分子名称: 1-METHYLGUANIDINE, MAGNESIUM ION, RNA (41-MER), ... 著者 Huang, L, Wang, J, Lilley, D.M.J. 登録日 2017-05-12 公開日 2017-10-18 最終更新日 2024-05-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.059 Å) 主引用文献 Structure of the Guanidine III Riboswitch. Cell Chem Biol, 24, 2017
5NY8	The structure of the thermobifida fusca guanidine III riboswitch with aminoguanidine 分子名称: AMINOGUANIDINE, MAGNESIUM ION, RNA (41-MER), ... 著者 Huang, L, Wang, J, Lilley, D.M.J. 登録日 2017-05-11 公開日 2017-10-18 最終更新日 2024-05-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.04 Å) 主引用文献 Structure of the Guanidine III Riboswitch. Cell Chem Biol, 24, 2017
5NZ6	The structure of the thermobifida fusca guanidine III riboswitch with guanidine in space group P3212. 分子名称: GUANIDINE, RNA (41-MER) 著者 Huang, L, Wang, J, Lilley, D.M.J. 登録日 2017-05-12 公開日 2017-10-18 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.94 Å) 主引用文献 Structure of the Guanidine III Riboswitch. Cell Chem Biol, 24, 2017
5O62	The structure of the thermobifida fusca guanidine III riboswitch with 1-Ethylguanidine. 分子名称: MAGNESIUM ION, N-ETHYLGUANIDINE, RNA (41-MER) 著者 Huang, L, Wang, J, Lilley, D.M.J. 登録日 2017-06-04 公開日 2017-10-18 最終更新日 2024-05-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.119 Å) 主引用文献 Structure of the Guanidine III Riboswitch. Cell Chem Biol, 24, 2017
5O69	The structure of the thermobifida fusca guanidine III riboswitch with agmatine. 分子名称: AGMATINE, MAGNESIUM ION, RNA (37-MER), ... 著者 Huang, L, Wang, J, Lilley, D.M.J. 登録日 2017-06-06 公開日 2017-10-18 最終更新日 2024-05-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.319 Å) 主引用文献 Structure of the Guanidine III Riboswitch. Cell Chem Biol, 24, 2017
7D7W	Crystal Structure of the Domain1 of NAD+ Riboswitch with nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) 分子名称: 18GAAA (52-MER), GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, MAGNESIUM ION, ... 著者 Chen, H, Ren, A.M. 登録日 2020-10-06 公開日 2020-11-25 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.391 Å) 主引用文献 Structural distinctions between NAD+ riboswitch domains 1 and 2 determine differential folding and ligand binding. Nucleic Acids Res., 48, 2020
7D7X	Crystal Structure of the Domain1 of NAD+ Riboswitch with adenosine diphosphate (ADP) 分子名称: 18GAAA(52-MER), ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE, GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, ... 著者 Chen, H, Ren, A.M. 登録日 2020-10-06 公開日 2020-11-25 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.631 Å) 主引用文献 Structural distinctions between NAD+ riboswitch domains 1 and 2 determine differential folding and ligand binding. Nucleic Acids Res., 48, 2020
7D82	Crystal Structure of the Domain2 of NAD+ Riboswitch with nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+), soaked in Mn2+ 分子名称: 832GAAA (50-MER), MAGNESIUM ION, MANGANESE (II) ION, ... 著者 Chen, H, Ren, A.M. 登録日 2020-10-06 公開日 2020-11-25 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.489 Å) 主引用文献 Structural distinctions between NAD+ riboswitch domains 1 and 2 determine differential folding and ligand binding. Nucleic Acids Res., 48, 2020
7D81	Crystal Structure of the Domain2 of NAD+ Riboswitch with nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) 分子名称: 832GAAA (50-MER), MAGNESIUM ION, NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE 著者 Chen, H, Ren, A.M. 登録日 2020-10-06 公開日 2020-11-25 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Structural distinctions between NAD+ riboswitch domains 1 and 2 determine differential folding and ligand binding. Nucleic Acids Res., 48, 2020
7D7Y	Crystal Structure of the Domain1 of NAD+ Riboswitch with adenosine triphosphate (ATP) 分子名称: 18GAAA (52-MER), ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, ... 著者 Chen, H, Ren, A.M. 登録日 2020-10-06 公開日 2020-11-25 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structural distinctions between NAD+ riboswitch domains 1 and 2 determine differential folding and ligand binding. Nucleic Acids Res., 48, 2020
7D7V	Crystal Structure of the Domain1 of NAD+ Riboswitch with nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) and U1A protein 分子名称: 17delU1A (58-MER), GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, MAGNESIUM ION, ... 著者 Chen, H, Ren, A.M. 登録日 2020-10-06 公開日 2020-11-25 最終更新日 2024-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structural distinctions between NAD+ riboswitch domains 1 and 2 determine differential folding and ligand binding. Nucleic Acids Res., 48, 2020
7D7Z	Crystal Structure of the Domain1 of NAD+ Riboswitch with nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+), soaked in Mn2+ 分子名称: 18GAAA(52-MER), GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, MAGNESIUM ION, ... 著者 Chen, H, Ren, A.M. 登録日 2020-10-06 公開日 2020-11-25 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Structural distinctions between NAD+ riboswitch domains 1 and 2 determine differential folding and ligand binding. Nucleic Acids Res., 48, 2020
3D0X	Crystal Structure of the unbound lysine riboswitch 分子名称: RNA (161-MER) 著者 Batey, R.T, Garst, A.D, Heroux, A, Rambo, R.P. 登録日 2008-05-02 公開日 2008-07-01 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.95 Å) 主引用文献 Crystal structure of the lysine riboswitch regulatory mRNA element. J.Biol.Chem., 283, 2008
4W92	Crystal structure of Bacillus subtilis cyclic-di-AMP riboswitch ydaO 分子名称: (2R,3R,3aS,5R,7aR,9R,10R,10aS,12R,14aR)-2,9-bis(6-amino-9H-purin-9-yl)octahydro-2H,7H-difuro[3,2-d:3',2'-j][1,3,7,9,2,8 ]tetraoxadiphosphacyclododecine-3,5,10,12-tetrol 5,12-dioxide, 1,2-ETHANEDIOL, C-di-AMP ribsoswitch, ... 著者 Jones, C.P, Ferre-D'Amare, A.R. 登録日 2014-08-26 公開日 2014-10-22 最終更新日 2023-12-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.209 Å) 主引用文献 Crystal structure of a c-di-AMP riboswitch reveals an internally pseudo-dimeric RNA. Embo J., 33, 2014
8I3Z	Crystal structure of NAD-II riboswitch (two strands) with NMN at 1.67 angstrom 分子名称: BETA-NICOTINAMIDE RIBOSE MONOPHOSPHATE, RNA (31-MER), RNA (5'-R(*AP*GP*AP*GP*CP*GP*UP*UP*GP*CP*GP*UP*CP*CP*GP*AP*AP*AP*GP*UP*(CBV)P*GP*CP*C)-3'), ... 著者 Peng, X, Lilley, D.M.J, Huang, L. 登録日 2023-01-18 公開日 2023-03-22 最終更新日 2024-05-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.67 Å) 主引用文献 Crystal structures of the NAD+-II riboswitch reveal two distinct ligand-binding pockets. Nucleic Acids Res., 51, 2023
6FZ0	Crystal structure of the metY SAM V riboswitch 分子名称: MAGNESIUM ION, S-ADENOSYLMETHIONINE, SODIUM ION, ... 著者 Huang, L, Lilley, D.M.J. 登録日 2018-03-13 公開日 2018-07-04 最終更新日 2024-05-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.499 Å) 主引用文献 Structure and ligand binding of the SAM-V riboswitch. Nucleic Acids Res., 46, 2018
6HBX	The structure of the G. violaceus guanidine II riboswitch P2 stem-loop with ethylguanidine 分子名称: N-ETHYLGUANIDINE, RNA (5'-R(*GP*GP*UP*GP*GP*GP*GP*AP*CP*GP*AP*CP*CP*CP*CP*AP*(CBV)P*C)-3'), SODIUM ION, ... 著者 Huang, L, Lilley, D.M.J. 登録日 2018-08-13 公開日 2019-02-20 最終更新日 2024-05-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.54 Å) 主引用文献 Structure-guided design of a high-affinity ligand for a riboswitch. Rna, 25, 2019
6HBT	The structure of the G. violaceus guanidine II riboswitch P2 stem-loop with arcaine 分子名称: 1-(4-carbamimidamidobutyl)guanidine, RNA (5'-R(*GP*GP*UP*GP*GP*GP*GP*AP*CP*GP*AP*CP*CP*CP*CP*AP*(CBV)P*C)-3'), SULFATE ION 著者 Huang, L, Lilley, D.M.J. 登録日 2018-08-13 公開日 2019-02-20 最終更新日 2024-05-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.66 Å) 主引用文献 Structure-guided design of a high-affinity ligand for a riboswitch. Rna, 25, 2019
6HC5	The structure of the G. violaceus guanidine II riboswitch P2 stem-loop with audouine 分子名称: 1-(5-carbamimidamidopentyl)guanidine, RNA (5'-R(*GP*GP*UP*GP*GP*GP*GP*AP*CP*GP*AP*CP*CP*CP*CP*AP*(CBV)P*C)-3'), SODIUM ION, ... 著者 Huang, L, Lilley, D.M.J. 登録日 2018-08-14 公開日 2019-02-20 最終更新日 2024-05-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.413 Å) 主引用文献 Structure-guided design of a high-affinity ligand for a riboswitch. Rna, 25, 2019
5VJB	Guanidine-II riboswitch P2 hairpin dimer with 5-bromoU substitution from Pseudomonas aeruginosa 分子名称: GUANIDINE, MAGNESIUM ION, RNA (5'-R(*GP*CP*GP*GP*GP*GP*AP*CP*GP*AP*CP*CP*CP*(5BU)P*GP*C)-3'), ... 著者 Reiss, C.W, Strobel, S.A. 登録日 2017-04-19 公開日 2017-06-28 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Structural basis for ligand binding to the guanidine-II riboswitch. RNA, 23, 2017

<12345678910111213141516>