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4J2B	RB69 DNA Polymerase L415G Ternary Complex 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*GP*CP*GP*GP*AP*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*T)-3'), ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2013-02-04 公開日 2014-02-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.04 Å) 主引用文献 Alteration in the cavity size adjacent to the active site of RB69 DNA polymerase changes its conformational dynamics. Nucleic Acids Res., 41, 2013
4FJL	RB69 DNA polymerase ternary complex with dGTP/dA 分子名称: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.87 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FLY	Pyrococcus abyssi B family DNA polymerase bound to a dsDNA, in edition mode 分子名称: 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, DNA polymerase 1, MAGNESIUM ION, ... 著者 Gouge, J, Delarue, M. 登録日 2012-06-15 公開日 2012-08-29 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Molecular Recognition of Canonical and Deaminated Bases by P. abyssi Family B DNA Polymerase. J.Mol.Biol., 423, 2012
4FJI	RB69 DNA polymerase ternary complex with dcTP/dC 分子名称: 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FJ9	RB69 DNA polymerase ternary complex with dTTP/dT 分子名称: CALCIUM ION, DNA polymerase, DNA primer, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.97 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FJX	RB69 DNA polymerase ternary complex with dATP/dG 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-12 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.11 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FLX	Pyrococcus abyssi B family DNA polymerase bound to a dsDNA, in edition mode 分子名称: 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, DNA polymerase 1, GLYCEROL, ... 著者 Gouge, J, Delarue, M. 登録日 2012-06-15 公開日 2012-08-29 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Molecular Recognition of Canonical and Deaminated Bases by P. abyssi Family B DNA Polymerase. J.Mol.Biol., 423, 2012
4FJG	RB69 DNA polymerase ternary complex with dATP/dC 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.02 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FK0	RB69 DNA polymerase ternary complex with dCTP/dG 分子名称: 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-12 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.18 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FJH	RB69 DNA polymerase ternary complex with dGTP/dC 分子名称: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.11 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FLW	Pyrococcus abyssi B family DNA polymerase bound to a dsDNA, in edition mode 分子名称: 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, DNA polymerase 1, GLYCEROL, ... 著者 Gouge, J, Delarue, M. 登録日 2012-06-15 公開日 2012-08-29 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.15 Å) 主引用文献 Molecular Recognition of Canonical and Deaminated Bases by P. abyssi Family B DNA Polymerase. J.Mol.Biol., 423, 2012
4FJJ	RB69 DNA polymerase ternary complex with dTTP/dC 分子名称: CALCIUM ION, DNA polymerase, DNA primer, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.99 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FJ7	RB69 DNA polymerase ternary complex with dGTP/dT 分子名称: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FK4	RB69 DNA polymerase ternary complex with dGTP/dG 分子名称: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-12 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FM2	Pyrococcus abyssi B family DNA polymerase (triple mutant) bound to a dsDNA, in edition mode 分子名称: DNA polymerase 1, GLYCEROL, MAGNESIUM ION, ... 著者 Gouge, J, Delarue, M. 登録日 2012-06-15 公開日 2012-08-29 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Molecular Recognition of Canonical and Deaminated Bases by P. abyssi Family B DNA Polymerase. J.Mol.Biol., 423, 2012
4FLT	Pyrococcus abyssi B family DNA polymerase bound to a dsDNA, in edition mode 分子名称: 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, DNA polymerase 1, GLYCEROL, ... 著者 Gouge, J, Delarue, M. 登録日 2012-06-15 公開日 2012-08-29 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Molecular Recognition of Canonical and Deaminated Bases by P. abyssi Family B DNA Polymerase. J.Mol.Biol., 423, 2012
4FM1	Pyrococcus abyssi B family DNA polymerase bound to a dsDNA, in edition mode 分子名称: 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, DNA polymerase 1, GLYCEROL, ... 著者 Gouge, J, Delarue, M. 登録日 2012-06-15 公開日 2012-08-29 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 Molecular Recognition of Canonical and Deaminated Bases by P. abyssi Family B DNA Polymerase. J.Mol.Biol., 423, 2012
4FJ8	RB69 DNA polymerase ternary complex with dCTP/dT 分子名称: 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.19 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4J2D	RB69 DNA Polymerase L415K Ternary Complex 分子名称: CALCIUM ION, DNA (5'-D(*GP*CP*GP*GP*AP*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*CP*GP*AP*GP*TP*AP*AP*GP*CP*AP*GP*TP*CP*CP*GP*CP*G)-3'), ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2013-02-04 公開日 2014-02-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.76 Å) 主引用文献 Role of L415 in the Replication of RB69 DNA Polymerase To be Published
4J2E	RB69 DNA Polymerase L415M Ternary Complex 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*GP*CP*GP*GP*AP*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*G)-3'), ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2013-02-04 公開日 2014-02-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.02 Å) 主引用文献 Alteration in the cavity size adjacent to the active site of RB69 DNA polymerase changes its conformational dynamics. Nucleic Acids Res., 41, 2013
4J2A	RB69 DNA Polymerase L415A Ternary Complex 分子名称: CALCIUM ION, DNA (5'-D(*GP*CP*GP*GP*AP*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*C)-3'), DNA (5'-D(*TP*CP*GP*AP*GP*TP*AP*AP*GP*CP*AP*GP*TP*CP*CP*GP*CP*G)-3'), ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2013-02-04 公開日 2014-02-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Alteration in the cavity size adjacent to the active site of RB69 DNA polymerase changes its conformational dynamics. Nucleic Acids Res., 41, 2013
4K8Z	KOD Polymerase in binary complex with dsDNA 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, COBALT HEXAMMINE(III), DNA (5'-D(*AP*AP*AP*TP*TP*CP*GP*CP*AP*GP*TP*TP*CP*GP*CP*G)-3'), ... 著者 Bergen, K, Betz, K, Welte, W, Diederichs, K, Marx, A. 登録日 2013-04-19 公開日 2013-06-26 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.29 Å) 主引用文献 Structures of KOD and 9N DNA Polymerases Complexed with Primer Template Duplex Chembiochem, 14, 2013
4KHW	Ternary complex of RB69 mutant L415F with ribonucleotide at -2 position 分子名称: CALCIUM ION, DNA (5'-D(*GP*CP*GP*GP*AP*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*CP*C)-3'), DNA polymerase, ... 著者 Clausen, A.R, Pedersen, L.C. 登録日 2013-05-01 公開日 2013-10-09 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.371 Å) 主引用文献 Structure-function analysis of ribonucleotide bypass by B family DNA replicases. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
4KI6	Ternary complex of rb69 mutant l415f with ribonucleotides at -1 and -2 position 分子名称: CALCIUM ION, DNA (5'-D(*GP*CP*GP*GP*AP*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*CP*C)-3'), DNA polymerase, ... 著者 Clausen, A.R, Pedersen, L.C. 登録日 2013-05-01 公開日 2013-10-09 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.55 Å) 主引用文献 Structure-function analysis of ribonucleotide bypass by B family DNA replicases. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
4M3W	RB69 DNA polymerase ternary complex with dT/dG at position n-4 of primer/template duplex 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Konigsberg, W.H. 登録日 2013-08-06 公開日 2014-02-12 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Mispairs with Watson-Crick base-pair geometry observed in ternary complexes of an RB69 DNA polymerase variant. Protein Sci., 23, 2014

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