Search by PDB author

BtuB3G3 bound to cyanocobalamin with disordered EL8
分子名称:	CYANOCOBALAMIN, Putative surface layer protein, TonB-dependent receptor
著者	Silale, A, Abellon-Ruiz, J, van den Berg, B.
登録日	2023-06-05
公開日	2023-08-16
最終更新日	2023-09-20
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (2.75 Å)
主引用文献	BtuB TonB-dependent transporters and BtuG surface lipoproteins form stable complexes for vitamin B 12 uptake in gut Bacteroides. Nat Commun, 14, 2023

8P98

BtuB3G3 bound to cyanocobalamin with ordered EL8
分子名称:	CYANOCOBALAMIN, Putative surface layer protein, Vitamin B12 transporter BtuB
著者	Silale, A, Abellon-Ruiz, J, van den Berg, B.
登録日	2023-06-05
公開日	2023-08-16
最終更新日	2023-09-20
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (2.97 Å)
主引用文献	BtuB TonB-dependent transporters and BtuG surface lipoproteins form stable complexes for vitamin B 12 uptake in gut Bacteroides. Nat Commun, 14, 2023

5AEX

Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Mep2
分子名称:	AMMONIUM TRANSPORTER MEP2, PHOSPHATE ION
著者	Rutherford, J.C, Chembath, A, van den Berg, B.
登録日	2015-01-12
公開日	2016-01-20
最終更新日	2024-01-10
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (3.2 Å)
主引用文献	Structural Basis for Mep2 Ammonium Transceptor Activation by Phosphorylation. Nat.Commun., 7, 2016

5AID

Crystal structure of the Mep2 mutant delta442 from Candida albicans
分子名称:	MEP2
著者	van den Berg, B, Chembath, A, Rutherford, J.
登録日	2015-02-12
公開日	2016-03-02
最終更新日	2024-01-10
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (3.4 Å)
主引用文献	Structural Basis for Mep2 Ammonium Transceptor Activation by Phosphorylation. Nat.Commun., 7, 2016

5AEZ

Crystal structure of Candida albicans Mep2
分子名称:	MEP2, nonyl beta-D-glucopyranoside
著者	Rutherford, J.C, Chembath, A, van den Berg, B.
登録日	2015-01-12
公開日	2016-01-20
最終更新日	2024-01-10
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (1.47 Å)
主引用文献	Structural Basis for Mep2 Ammonium Transceptor Activation by Phosphorylation. Nat.Commun., 7, 2016

5AH3

Crystal structure of the Mep2 mutant R452D,S453D from Candida albicans
分子名称:	DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE, MEP2
著者	van den Berg, B, Chembath, A, Rutherford, J.
登録日	2015-02-04
公開日	2016-03-02
最終更新日	2024-01-10
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å)
主引用文献	Structural Basis for Mep2 Ammonium Transceptor Activation by Phosphorylation. Nat.Commun., 7, 2016

5AF1

Crystal structure of Candida albicans Mep2
分子名称:	MEP2
著者	Rutherford, J.C, Chembath, A, van den Berg, B.
登録日	2015-01-14
公開日	2016-01-27
最終更新日	2024-01-10
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (1.639 Å)
主引用文献	Structural Basis for Mep2 Ammonium Transceptor Activation by Phosphorylation. Nat.Commun., 7, 2016

6SML

Structure of the RagAB peptide importer in the 'open-open' state
分子名称:	(1R,4S,6R)-6-({[2-(ACETYLAMINO)-2-DEOXY-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]OXY}METHYL)-4-HYDROXY-1-{[(15-METHYLHEXADECANOYL)OXY]METHYL}-4-OXIDO-7-OXO-3,5-DIOXA-8-AZA-4-PHOSPHAHEPTACOS-1-YL 15-METHYLHEXADECANOATE, GLY-THR-GLY-GLY-SER-THR-GLY-THR-THR-SER-ALA-GLY, Lipoprotein RagB, ...
著者	White, J.B.R, Ranson, N.A, van den Berg, B.
登録日	2019-08-22
公開日	2020-05-20
最終更新日	2020-08-05
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (3.4 Å)
主引用文献	Structural and functional insights into oligopeptide acquisition by the RagAB transporter from Porphyromonas gingivalis. Nat Microbiol, 5, 2020

6FOK

Copper transporter OprC
分子名称:	(HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE, COPPER (II) ION, Putative copper transport outer membrane porin OprC
著者	Bhamidimarri, S.P, van den Berg, B.
登録日	2018-02-07
公開日	2019-03-13
最終更新日	2021-12-01
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (1.97 Å)
主引用文献	Acquisition of ionic copper by the bacterial outer membrane protein OprC through a novel binding site. Plos Biol., 19, 2021

6YTC

Solution NMR structure of the isolated NTE domain of BT1762-63 levan transporter
分子名称:	TonB-dependent receptor
著者	Rath, P, Mazur, A, Hiller, S.
登録日	2020-04-24
公開日	2020-07-08
最終更新日	2023-06-14
実験手法	SOLUTION NMR
主引用文献	Insights into SusCD-mediated glycan import by a prominent gut symbiont. Nat Commun, 12, 2021

7ACV

SLPL/HID (LMW SLP complex with HMW SLP interacting domain - HID) from C. difficile (R7404 strain)
分子名称:	HID - interacting domain of SLP HMW, LMW SLP
著者	Barwinska-Sendra, A, Lanzoni-Mangutchi, P, Salgado, P.S.
登録日	2020-09-11
公開日	2022-03-09
最終更新日	2024-01-31
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å)
主引用文献	Structure and assembly of the S-layer in C. difficile. Nat Commun, 13, 2022

7ACZ

RdeltaD2 H/L (LMW SLP/HMW SLP) complex from C. difficile SlpA (R20291 strain)
分子名称:	SLPH (HMW SLP), SLPL deltaD2 (LMW SLP D2 truncation),SLPL deltaD2 (LMW SLP D2 truncation)
著者	Lanzoni-Mangutchi, P, Barwinska-Sendra, A, Salgado, P.S.
登録日	2020-09-11
公開日	2022-03-09
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (3.5 Å)
主引用文献	Structure and assembly of the S-layer in C. difficile. Nat Commun, 13, 2022

7ACY

H/L (SLPH/SLPL) complex from C. difficile (CD630 strain)
分子名称:	S-layer protein, SULFATE ION
著者	Lanzoni-Mangutchi, P, Barwinska-Sendra, A, Salgado, P.S.
登録日	2020-09-11
公開日	2022-03-09
最終更新日	2024-01-31
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (2.55 Å)
主引用文献	Structure and assembly of the S-layer in C. difficile. Nat Commun, 13, 2022

6ZLU

Closed-closed state of the Bt1762-Bt1763 levan transport system
分子名称:	SusC homolog, SusD homolog
著者	White, J.B.R, van den Berg, B, Ranson, N.A.
登録日	2020-07-01
公開日	2020-11-11
最終更新日	2021-01-20
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (4.2 Å)
主引用文献	Insights into SusCD-mediated glycan import by a prominent gut symbiont. Nat Commun, 12, 2021

6ZM1

Open-closed state of the Bt1762-Bt1763 levan transport system
分子名称:	SusC homolog, SusD homolog
著者	White, J.B.R, van den Berg, B, Ranson, N.A.
登録日	2020-07-01
公開日	2020-11-11
最終更新日	2021-01-20
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (4.7 Å)
主引用文献	Insights into SusCD-mediated glycan import by a prominent gut symbiont. Nat Commun, 12, 2021

6ZLT

Open-open state of the Bt1762-Bt1763 levan transport system
分子名称:	SusC homolog, SusD homolog
著者	White, J.B.R, van den Berg, B, Ranson, N.A.
登録日	2020-07-01
公開日	2020-11-11
最終更新日	2021-01-20
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (3.9 Å)
主引用文献	Insights into SusCD-mediated glycan import by a prominent gut symbiont. Nat Commun, 12, 2021

8AA4

SusC components of the dextran utilisation system (utilisome)
分子名称:	SusC homolog
著者	White, J.B.R, Silale, A, Ranson, N.A, van den Berg, B.
登録日	2022-06-29
公開日	2023-06-07
最終更新日	2023-06-21
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (3.1 Å)
主引用文献	Outer membrane utilisomes mediate glycan uptake in gut Bacteroidetes. Nature, 618, 2023

8AA2

Inactive levan utilisation machinery (utilisome) in the presence of levan fructo-oligosaccharides DP 15-25
分子名称:	DUF4960 domain-containing protein, Glycoside hydrolase family 32, MAGNESIUM ION, ...
著者	White, J.B.R, Silale, A, Ranson, N.A, van den Berg, B.
登録日	2022-06-29
公開日	2023-06-07
最終更新日	2023-06-21
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (3.1 Å)
主引用文献	Outer membrane utilisomes mediate glycan uptake in gut Bacteroidetes. Nature, 618, 2023

8AA3

Core SusCD transporter units from the inactive levan utilisome in the presence of levan fructo-oligosaccharides DP 15-25
分子名称:	MAGNESIUM ION, SusC homolog, SusD homolog, ...
著者	White, J.B.R, Silale, A, Ranson, N.A, van den Berg, B.
登録日	2022-06-29
公開日	2023-06-07
最終更新日	2023-06-21
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (2.7 Å)
主引用文献	Outer membrane utilisomes mediate glycan uptake in gut Bacteroidetes. Nature, 618, 2023

8AA1

Core SusCD transporter units from the levan utilisome with levan fructo-oligosaccharides DP 8-12
分子名称:	MAGNESIUM ION, SusC homolog, SusD homolog, ...
著者	White, J.B.R, Silale, A, Ranson, N.A, van den Berg, B.
登録日	2022-06-29
公開日	2023-06-07
最終更新日	2023-06-21
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (2.9 Å)
主引用文献	Outer membrane utilisomes mediate glycan uptake in gut Bacteroidetes. Nature, 618, 2023

8A9Y

Substrate-free levan utilisation machinery (utilisome)
分子名称:	DUF4960 domain-containing protein, Glycoside hydrolase family 32, MAGNESIUM ION, ...
著者	White, J.B.R, Silale, A, Ranson, N.A, van den Berg, B.
登録日	2022-06-29
公開日	2023-06-07
最終更新日	2023-06-21
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (3.5 Å)
主引用文献	Outer membrane utilisomes mediate glycan uptake in gut Bacteroidetes. Nature, 618, 2023

8AA0

Levan utilisation machinery (utilisome) with levan fructo-oligosaccharides DP 8-12
分子名称:	DUF4960 domain-containing protein, Glycoside hydrolase family 32, MAGNESIUM ION, ...
著者	White, J.B.R, Silale, A, Ranson, N.A, van den Berg, B.
登録日	2022-06-29
公開日	2023-06-07
最終更新日	2023-06-21
実験手法	ELECTRON MICROSCOPY (3.2 Å)
主引用文献	Outer membrane utilisomes mediate glycan uptake in gut Bacteroidetes. Nature, 618, 2023

7OZC

Sulfated host glycan recognition by carbohydrate sulfatases of the human gut microbiota (BT3109_S1_15)
分子名称:	6-O-sulfo-beta-D-galactopyranose, Arylsulfatase A, CALCIUM ION
著者	Cartmell, A.
登録日	2021-06-27
公開日	2022-06-29
最終更新日	2024-01-31
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (1.75 Å)
主引用文献	Sulfated glycan recognition by carbohydrate sulfatases of the human gut microbiota. Nat.Chem.Biol., 18, 2022

7OZ9

Sulfated host glycan recognition by carbohydrate sulfatases of the human gut microbiota (BT3057-S1_16)
分子名称:	2-acetamido-2-deoxy-4-O-sulfo-alpha-D-galactopyranose, 2-acetamido-2-deoxy-4-O-sulfo-beta-D-galactopyranose, CALCIUM ION, ...
著者	Cartmell, A.
登録日	2021-06-27
公開日	2022-06-29
最終更新日	2024-01-31
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (1.907 Å)
主引用文献	Sulfated glycan recognition by carbohydrate sulfatases of the human gut microbiota. Nat.Chem.Biol., 18, 2022

7OZA

Sulfated host glycan recognition by carbohydrate sulfatases of the human gut microbiota (BT3796_S1_16)
分子名称:	2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, 4-O-sulfo-beta-D-galactopyranose, CALCIUM ION, ...
著者	Cartmell, A.
登録日	2021-06-27
公開日	2022-06-29
最終更新日	2024-01-31
実験手法	X-RAY DIFFRACTION (1.5 Å)
主引用文献	Sulfated glycan recognition by carbohydrate sulfatases of the human gut microbiota. Nat.Chem.Biol., 18, 2022

<2 3 4 5 6 7 8910 11 12 >

全ヒット件数:	284
表示件数:	25
表示順	関連性が高い順