[wwPDB] 化学のためのオープンソース・ツールに関するワークショップ

王立化学会の化学情報・計算機応用グループは、 化学のためのオープンソース・ツールに関するワークショップシリーズの一環として、PDB50を記念して2つの無料オンラインイベントを開催します。

50年目の蛋白質構造データバンク(PDB): PDBデータの利用と理解、評価

１日目: 2021年11月16日（火）3-5pm GMT（日本時間：11月17日午前0時～11月17日午前2時）

• History of the Protein Data Bank (PDB) and the Worldwide PDB（PDBとwwPDBの歴史）
  Stephen K. Burley, RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB)
• PDBx/mmCIF Data Standard and PDB Data Deposition with OneDep（PDBx/mmCIFデータ規格とOneDepを利用したPDBデータ登録）
  Ezra Peisach, Jasmine Young, RCSB PDB
• Small Molecules in the PDB（PDBにおける低分子化合物）
  Chenghua Shao, RCSB PDB
• OneDep Tutorial（OneDepチュートリアル）
  Jasmine Young, Ezra Peisach, RCSB PDB

２日目: 2021年11月18日（木）3-5pm GMT（日本時間：11月19日午前0時～11月19日午前2時）

• wwPDB Validation: Assessing the Quality of PDB structures（wwPDBの検証：PDB構造の品質評価）
  John Berrisford, Protein Data Bank in Europe (PDBe)
• How to Interpret the Quality of a PDB Structure using the wwPDB validation report（wwPDB検証レポートを使ってPDB構造の品質を評価する方法）
  David Armstrong, John Berrisford, Jack Turner, PDBe
• 3D Visualization of PDB Data with the Mol* viewer（Mol*ビューアを使ったPDBデータの３次元構造可視化）
  James Tolchard, PDBe
• Impact of AI and Future of PDB Data: Next Generation PDB Archive（AIの影響とPDBデータの将来：次世代PDBアーカイブ）
  Sameer Velankar (PDBe)
• Round Table Discussion（座談会）
  Sameer Velankar (PDBe), Stephen K. Burley (RCSB PDB)

ワークショップへのご参加後、以下のことが可能になります。

• 生体高分子構造を登録する際、適切にwwPDB OneDepシステムにアクセスし、使用することができます。
• PDBでは低分子データがどのように表現されているか、またアクセス方法を理解できます。
• wwPDBの検証レポートから、PDB構造の品質と正確さを評価できます。
• Mol*分子ビューアを使ってPDB構造を可視化する方法を理解できます。
• 次世代PDBアーカイブの構築に向けたwwPDBの計画を評価することができます。

化学のためのオープンソース・ツールワークショップへご参加をご希望の方は、こちらからお申込みください。

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