PDBj FTP Archiveの整備について
現在、PDBjでは、FTPアーカイブサービスとして、ftp.pdbj.org および ftp-versioned.pdbj.org に加え、5/27にリニューアルされたPDBj Mineサービスとともに公開されました、data.pdbjpw1.pdbj.org を合わせた3つのアーカイブサイトを運営しております。
PDBjでは、これらのアーカイブサイトを以下のように整理し、9/1から整備したものに切り替えます。
(1) ftp.pdbj.org | wwPDB共通のアーカイブ pub (pdb/emdb) のみを保持 (wwPDB, rcsbのFTPサイトと同様) |
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(2) ftp-versioned.pdbj.org | これまで通り、versioning化されたPDBアーカイブのみを保持 |
(3) data.pdbjpw1.pdbj.org | (1) (2) を含み、かつ PDBjで生成している付加データ群、PDBjで開発した2次データベース群の各データを保持 |
現在、(1)の ftp.pdbj.org から "pub (pdb/emdb) " 以外のデータをdownloadしてご利用されている方々は、data.pdbjpw1.pdbj.org のご利用への移行対応をお願いいたします。
"ftp.pdbj.org/pub(pdb/emdb)" をご利用の方には変更ありませんので影響はございません。
PDBjの新しいアーカイブサイトの詳細につきましては、PDBjデータサイト・FTPサイトの詳細 のヘルプページもご覧ください。
また、9/1の切り替えに伴い、ftp.pdbj.orgから公開しておりました、PDBMLadd (PDBjによる付加情報XMLファイル群) の提供は終了します。
今後は、既に"data.pdbjpw1.pdbj.org"から公開しております、より使いやすいフォーマット群 (JSONファイルなど)をぜひお試し頂き、PDBj付加データ等のご利用は、PDBjの新データアーカイブサイトに切り替えをお願いいたします。
PDBj FTPサイトのデータ整備についてのご質問等ございましたら、PDBjお問い合わせページからお願いします。