[wwPDB] 初期モデルの収集を強化しました
この度、新しい PDBx/mmCIF カテゴリ、_pdbx_initial_refinement_model を導入し、 X 線、電子顕微鏡、NMR 法の初期モデルに関する情報収集を改善しました。
これにより、実験的に得られたモデルと計算で得られたモデルが区別されます。 初期モデルが得られたリソースの出どころ(例えば、PDB、AlphaFoldDB、RoseTTAFoldなど)と そのアクセッションコード又は識別子が公開されている場合は、その情報を取得できます。
詳細な定義については、 pdbx_initial_refinement_modelをご覧ください。 以下はその例です。
_pdbx_initial_refinement_model.id 1 _pdbx_initial_refinement_model.entity_id_list 1 _pdbx_initial_refinement_model.type 'experimental model' _pdbx_initial_refinement_model.source_name PDB _pdbx_initial_refinement_model.accession_code 3LTQ
wwPDBは、すべてのPDBユーザーとソフトウェア開発者がコードを見直し、 将来のアプリケーションに対してはこの定義を採用することをお勧めします。
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作成日: 2024-03-11