[wwPDB] 非標準座標系で登録された結晶構造の改善
2022年12月から2023年9月までの間に、非標準の座標系または空間群設定でPDBに登録された合計 268の構造エントリーが再度バージョン化を行い公開されました。 今回の更新は、 最新のグラフィックスおよび精密化ソフトウェアを用いて、モデルの視覚化および登録された実験データに対する検証を改善するために行われました。
再バージョンされた各エントリーは、原子のx,y,z座標が標準結晶学フレームに変換されています。 非結晶対称行列が存在する場合は、更新された座標で動作するように変換されています。
座標変換は、REMARKまたはSCALEレコードから、あるいは一次引用文献に掲載されている変換から抽出されました。
変換された構造座標は全て、結晶充填の完全性と、利用できる場合には、登録された構造因子データとの照合について 注意深くチェックされています。
登録されたオリジナルの座標やマトリックスは、 PDBのバージョン管理されたアーカイブで、 以前のメジャーバージョンとしてご利用頂けます。
COOTを用いて可視化した2Fo-Fcマップと座標フレーム変換したミオグロビン1MBO座標
[ wwPDB News ]
作成日: 2023-10-11