[wwPDB] PDBアーカイブとともに統合的ハイブリッド法(IHM)で決定された構造を提供します

統合的構造決定法とハイブリッド構造決定法(IHM)によって決定された構造は、PDBアーカイブで実験構造と一緒に利用できるようになりました。 これらの構造はPDB-Devシステムに登録され、処理されます。 各IHM構造にはPDB IDが発行され、PDBx/mmCIFファイルの_database_2カテゴリーに記載されます。 "integrative "メソッドに関する情報は、_struct.pdbx_structure_determination_methodology に記述されます。 IHM構造と関連データは、 files.wwpdb.org/pub/pdb_ihm/や、 PDBjのfiles.pdbj.org/pub/pdb_ihm/からご利用頂けます。

現在、JSON形式の一覧ファイル、PDF形式の検証レポート（要約版および完全版）、PDBx/mmCIF形式のモデル構造ファイルが提供されています。

• /pdb_ihm/holdings/ (現在アーカイブで保有するファイル一覧、 公開済みエントリーの最終更新日一覧、未公開エントリーの一覧)
• /pdb_ihm/data/entries/hash/{PDB_id}/validation_reports/ (要約版及び完全版の検証レポートを含む)
• /pdb_ihm/data/entries/hash/{PDB_id}/structures/ (最新バージョンのモデル構造ファイル)
• 例えば、https://files.wwpdb.org/pub/pdb_ihm/data/entries/zz/8zz1/structures/8zz1.cif.gz

データは将来、ユーザの要望に基づいて拡張される可能性があります。 近い将来、IHMデータはwwPDB DOIページやwwPDBパートナーのウェブサイトからも入手できるようになる予定です。

ご質問やコメントなどは、 deposit-help@mail.wwpdb.org又は pdb-dev@mail.wwpdb.orgまで、英語でお寄せください。

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