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[wwPDB] 特定のEMエントリー登録時にハーフマップが必須になります

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2022年2月25日より、単粒子、単粒子ベースのヘリカル、およびサブトモグラムの平均化再構成法によるエントリーについて、 ハーフマップをEMデータバンク(EMDB)に登録することが必須になります。 この変更はwwPDB EMDBコアアーカイブに対する長年の要望に応えたものであり、 2020年のwwPDB単粒子クライオ電子顕微鏡データ管理ワークショップ(準備中の論文)からの提言でもあります。 このワークショップで得られたいくつかの提言は、すでにwwPDB OneDepシステムに実装されています。 これには、wwPDB検証レポートの改善や、 登録インターフェイスを介したメタデータの取り込みの強化などが含まれます。

必須のハーフマップは、フィルタなし、マスクなし、シャープニングなしで、一次マップと重なり合うよう同じ座標空間と方向に配置されている必要があります。 ハーフマップの利用は、wwPDBの検証レポートに反映されているように、EM構造の検証の向上に貢献します。

wwPDBは、対象となる様式のクライオ電子顕微鏡処理ソフトウェアの開発者に対して、 (まだサポートされていない場合は)このようなハーフマップの出力をサポートするよう強く求めています。

このポリシーの変更についてご質問などございましたら、info@wwpdb.orgまで英語でお問い合わせください。

[ wwPDB News ]


作成日: 2021-12-15

220113

件を2024-05-22に公開中

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