[wwPDB] EMDBアーカイブの電子顕微鏡メタデータをPDBx/mmCIFファイル形式で配布します

電子顕微鏡データバンク(EMDB)は、2023年10月初旬より、 電子顕微鏡(EM)のメタデータを、これまでのXML形式に加えて、PDBx/mmCIFファイル形式でも配布します。 PDBx/mmCIFファイルがアーカイブに追加されることで、EMDBとPDB（EM実験データと３次元構造）のメタデータの提供方法が 同等になると同時に、2つのアーカイブ間の一貫性と相互運用性が向上します。 2023年10月以前に公開されたEMDBエントリーには、PDBx/mmCIFファイルが後日追加されます。 PDBx/mmCIFのカテゴリーとEMメタデータファイルの項目の説明は、PDBx/mmCIF辞書を参照してください (https://mmcif.wwpdb.org/dictionaries/mmcif_pdbx_v50.dic/Groups/em_group.html)。 EMDB IDがEMD-xxxxxのEMDBエントリーの場合、PDBx/mmCIFファイル名はemd-xxxxx.cif.gzとなり、 以下の各wwPDBアーカイブリポジトリにおいて、metadataという名前でそのエントリーのサブフォルダーに格納されます (EMD-xxxxx/metadata)：

• EMDB: https://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/emdb/structures/
• wwPDB: https://files.wwpdb.org/pub/emdb/structures/
• RCSB PDB (US): https://files.rcsb.org/pub/emdb/structures/
• PDBe (UK): https://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/emdb/structures/
• PDBj (Japan): https://files.pdbj.org/pub/emdb/structures/

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