ニュース (2012年09月20日)

ftp / rsyncの URL を以下の通り変更しました。但し従来のURLも当面はご利用になれます。

• pdb.protein.osaka-u.ac.jp → ftp.pdbj.org
• snapshots.pdbj.org → snapshots.pdbj.org

ftp コマンドにより、PDBjの匿名 FTP サーバへ接続できます。

ftp ftp.pdbj.org 

FTP を使用して、様々な PDB データ、又はEMDB データを取得するURLは下記の通りです。 PDBアーカイブのページ もご覧ください。

• PDBx（mmCIF）形式:

   ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/data/structures/divided/mmCIF/ 
  

• PDBML形式（all: 全ての情報）:

   ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/data/structures/divided/XML/ 
  

• PDBML形式（no-atom: ヘッダのみ）:

   ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/data/structures/divided/XML-noatom/ 
  

• PDBML形式（ext-atom: 座標情報のみ）:

   ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/data/structures/divided/XML-extatom/ 
  

• PDB 形式:

   ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/data/structures/divided/pdb/ 
  

• EMDB データ:

   ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures