PDBjウェブサーバの移行に伴いPDBjウェブサービスがリニューアルされます

2021年5月27日に、PDBjウェブサービスは新しいサーバに移行します。 移行後は、見かけの変更や広範囲に渡り機能拡張されるものなど、多くのサービスがリニューアルされます。 リニューアルされるサービス一覧は以下の通りです。

• PDB詳細検索とMineトップページのクイック検索の統合
• mmCIFデータや我々独自のpdbjplusデータを抽出するのにこれまであまり馴染みのなかったSQL検索をもっと簡単にご利用していただけるようにように、グラフィックインターフェースのSQL検索である新しいPDBj RDB検索サービスがご利用いただけるようになります。
• CIF-QueryとXML-Queryサービスは廃止されますが、その機能は私たちの検索サービスの中の"結果をダウンロード"機能に統合されます。"結果をダウンロード"機能では、RDBの中から検索HITしたどんなカテゴリ/アイテムもmmCIFやmmJSON, JSONファイルなどお好みのフォーマットを指定して抽出することができます。
• 新しく整備したPDBjデータアーカイブを下記のサイトからもご利用いただけます。https://data.pdbjpw1.pdbj.org/ (PDBj FTPアーカイブサイトもこれまで通りご利用いただけます） 　
　
• PDBMLplusフォーマットの提供は廃止予定です。代わりにmmJSONフォーマットが下記データアーカイブサイトからご利用頂けます。https://data.pdbjpw1.pdbj.org/pdbjplus/data/cc/mmjson-plus/ このmmJSONフォーマットファイルは、新PDBj Mineの各PDBエントリーページからもダウンロード頂けます。 　
• Sequence Navigator/Sequence Neighborインターフェースもリニューアルされ、superposition機能は従来のPDBフォーマットファイルを使ったサーバサイドからではなく、mmJSONファイルを使ったMolmilによりクライアントサイドで提供されるようになります。 　
• PDBj MineのPDBエントリーページのMolmilインターフェース (AU/BU) もニューアルされます。 　
• 電子密度マップサービスのMolmilインターフェースもリニューアルされます。 　
• eF-siteサービスのMolmilインターフェースもリニューアルされます。
• Promode Elasticサービスのインターフェースもリニューアルされます。 　
• PDBj RESTサービスもリニューアルされます。
• PDBjによる付加データがさらにpdbjplusデータ(アーカイブやファイル）に追加されます。 　
• これまでのMine RDBの週次差分ファイルの提供は廃止され、代わりに PDBjの更新サービスに置き換わります。 　

PDBjウェブサーバ移行によるサービスリニューアルについて、何かご質問等ございましたら、PDBjお問い合わせページからお問い合わせください。