PDBjサービスへのPDBx/mmCIF辞書更新による影響について
2017年7月12日に、FTPのPDBエントリーは全て、PDBx/mmCIF辞書の新しいバージョン V5
(http://mmcif.wwpdb.org/dictionaries/mmcif_pdbx_v50.dic/Index/)に準拠したファイルへと更新されます
(PDBj ニュース)。
この更新によって、以下のPDBj サービスに影響があります。
Mine 2 RDB | 全てのエントリーが更新されるため、毎週の差分(デルタファイル)は膨大な量になります。そのため、7月12日には、差分ファイルは提供されません。 前の週からの差分ファイルも、FTPには含められません。 差分ファイルが再びFTPに出てくるのは、翌週(19日)からとなります。 RDBをローカルインストールしている利用者は、 RDBヘルプページに従って、 現在のRDBの内容を消去し、完全なダンプファイルをダウンロードして、データベースにロードしてください。 |
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Legacy PDBj Mine | PDBx/mmCIF辞書のバージョン4(v4) から バージョン5 (v5) へのデータ移行に伴い、 Legacy PDBj Mineのサービスは 2017/7/12をもって更新を終了いたします。今後は、v5 dataに対応しましたPDBj Mine をご利用ください。 Legacy PDBj Mineのサイトは、2017年8月末をもって終了致します。 |
作成日: 2017-06-21 (最終更新日: more than 1 year ago)