次世代ツールの稼働開始と10万件への道のり

今日PDBに登録される構造の多くでは、アーカイブ中で最も適した表現を行うために、データ収集やアノテーションの際、特別なツールと処理が必要とされます。 巨大構造や錯体化学、複数の実験手法の使用がもたらす課題に応えるため、wwPDBは新しい登録・編集システムを稼働させ始めています。 PDBの各拠点は、新登録・編集システムのおかげで、今後数十年にわたって進化し続ける研究者の要望に対応できるでしょう。

1月末に新システムの使用を開始して以来、すでに30ヵ国から750件以上のX線結晶構造が新システムを使用して登録されました。

登録者にとっては、新登録システムで新しく追加、又は、改良された特徴には、次のようなものが含まれます： （wwPDBのX線検証作業チーム（X-ray Validation Task Force）の推奨に従った）検証レポートがX線結晶構造に対して生成されること、 リガンド情報の考察機能の改善、登録前と登録後に座標や実験データを差し替える機能、 登録者とwwPDB アノテーター間のコミュニケーション手続きが改善されたこと、登録前にPDBx/mmCIFファイルをプレビューやダウンロードで確認できる機能など。

データの利用者にとっては、新編集システムでは、データ処理の効率性と一貫性が大きく改善されています。

wwPDBの登録拠点で使用されている 現行の登録・編集システムは全て、新しいシステムに置き換わる予定です。