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X線結晶構造に対して、wwPDBの新しい登録システムが公開されました。

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X線結晶構造に対して、wwPDBの新しい登録システムが公開されました。

New wwPDB Deposition System Now Available for X-ray Structures

X線結晶構造解析で求めた構造に対して、新しい登録システムが利用できるようになりました。 (新登録システム:http://deposit.wwpdb.org/deposition

新システムは、今後10年にわたって進化していく研究者の要望(巨大構造や錯体化学、複数の実験手法の使用などのサポートを含む)に見合うよう、開発されました。wwPDBの登録拠点で現在使用されている、全ての登録・編集システムは、新システムに置き換わり、効率や一貫性が改善されます。

新登録システムで新しく追加、又は、改良された特徴には、次のようなものが含まれます: wwPDBのX線検証作業チーム(X-ray Validation Task Force)の推奨に従った検証レポートがX線結晶構造に対して生成されること、 リガンド情報の考察機能の改善、登録前と登録後に座標や実験データを差し替える機能、 登録者とwwPDB アノテーター間のコミュニケーション手続きが改善されたこと、登録前にPDBx/mmCIFファイルをプレビューやダウンロードで確認できる機能など。

登録者は、2014年の間は、新システムを使うことも、旧登録ツール(ADIT、AutoDep)を使うこともできます。 新システムへの移行期の後は、旧ツールは登録途中のセッションを完了させるためにのみ利用可能となります。

移行をスムーズに進めるため、新システムを使った登録・編集処理は、これから数か月に渡って、徐々に増加させる予定です。 その後、NMRや電子顕微鏡(3DEM)構造についても、新システムを使った登録が開始される予定です。

新システムについては、 システム概要 をご覧ください。 最新情報は、wwPDBサイト(http://wwpdb.org/system_info.html)でご確認ください。 また、オンラインセミナーによる新システムの実演を近日中にアナウンスでお知らせする予定です。

[ wwPDBニュース ]


作成日: 2014-01-28 (最終更新日: more than 1 year ago)2014-01-28

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