9B70

Cryo-EM structure of MraY in complex with analogue 2

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9B70 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb9b70/pdb
• EMDBエントリー: 44293
• 分子名称: Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase, MraYAA nanobody, (2~{S},3~{S})-3-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(aminomethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]oxy-2-[[3-[[[(2~{S})-6-azanyl-2-(hexadecanoylamino)hexanoyl]amino]methyl]phenyl]methylamino]-3-[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]propanoic acid, ... (4 entities in total)
• 機能のキーワード: inhibitor, antibiotics, transferase
• 由来する生物種: Aquifex aeolicus VF5; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 4
• 化学式量合計: 113892.92

構造登録者

Hao, A.,Lee, S.-Y. (登録日: 2024-03-26, 公開日: 2024-06-26)

• 主引用文献: Yamamoto, K.,Sato, T.,Hao, A.,Asao, K.,Kaguchi, R.,Kusaka, S.,Ruddarraju, R.R.,Kazamori, D.,Seo, K.,Takahashi, S.,Horiuchi, M.,Yokota, S.I.,Lee, S.Y.,Ichikawa, S.; Development of a natural product optimization strategy for inhibitors against MraY, a promising antibacterial target.; Nat Commun, 15:5085-5085, 2024; PubMed: 38877016; DOI: 10.1038/s41467-024-49484-7

実験手法

ELECTRON MICROSCOPY (2.88 Å)