9AT7
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a 2,2-difluoro-5-methylbenzo[1,3]dioxole 2-pyrrolidone inhibitor
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9AT7 の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb9at7/pdb |
分子名称 | 3C-like proteinase nsp5, (1R,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(2,2-difluoro-2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid, (1S,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(2,2-difluoro-2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid, ... (5 entities in total) |
機能のキーワード | protease, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, sars-cov-2 3cl protease inhibitors, covid-19, viral protein, hydrolase-inhibitor complex, hydrolase/inhibitor |
由来する生物種 | Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 |
タンパク質・核酸の鎖数 | 2 |
化学式量合計 | 70688.11 |
構造登録者 | Lovell, S.,Cooper, A.,Battaile, K.P.,Dampalla, C.S.,Groutas, W.C. (登録日: 2024-02-26, 公開日: 2024-07-10, 最終更新日: 2024-08-07) |
主引用文献 | Dampalla, C.S.,Kim, Y.,Zabiegala, A.,Howard, D.J.,Nguyen, H.N.,Madden, T.K.,Thurman, H.A.,Cooper, A.,Liu, L.,Battaile, K.P.,Lovell, S.,Chang, K.O.,Groutas, W.C. Structure-Guided Design of Potent Coronavirus Inhibitors with a 2-Pyrrolidone Scaffold: Biochemical, Crystallographic, and Virological Studies. J.Med.Chem., 67:11937-11956, 2024 Cited by PubMed: 38953866DOI: 10.1021/acs.jmedchem.4c00551 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) |
構造検証レポート
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