8TDT
Sequence specific (AATT) orientation of DAPI molecules at a unique minor groove binding site (position2) within a self-assembled 3D DNA lattice (4x6)
8TDT の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb8tdt/pdb |
分子名称 | DNA (5'-D(*GP*AP*GP*CP*AP*GP*AP*CP*CP*TP*GP*AP*CP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*A)-3'), DNA (5'-D(P*CP*CP*GP*TP*CP*A)-3'), DNA (5'-D(*TP*CP*TP*AP*AP*TP*TP*T)-3'), ... (8 entities in total) |
機能のキーワード | self-assembly, dna nanotechnology, dna scaffold, crystal lattice, dna, minor groove binders, netropsin, dapi, hoechst, impypy, polyamide, host-guest |
由来する生物種 | synthetic construct 詳細 |
タンパク質・核酸の鎖数 | 4 |
化学式量合計 | 13669.33 |
構造登録者 | |
主引用文献 | Simmons, C.R.,Buchberger, A.,Henry, S.J.W.,Novacek, A.,Fahmi, N.E.,MacCulloch, T.,Stephanopoulos, N.,Yan, H. Site-Specific Arrangement and Structure Determination of Minor Groove Binding Molecules in Self-Assembled Three-Dimensional DNA Crystals. J.Am.Chem.Soc., 145:26075-26085, 2023 Cited by PubMed: 37987645DOI: 10.1021/jacs.3c07802 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (3.007 Å) |
構造検証レポート
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