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8SY9

X-ray crystal structure of UDP-2,3-diacetamido-2,3-dideoxy-glucuronic acid-2-epimerase from Thermus thermophilus strain HB27, D98N variant in the presence of UDP-2,3-diacetamido-2,3-dideoxy-glucuronic acid, UDP-N-acetylglucosamine and UDP at pH 7

8SY9 の概要
エントリーDOI10.2210/pdb8sy9/pdb
関連するPDBエントリー8SXV 8SXW 8SXY 8SY0
分子名称UDP-2,3-diacetamido-2,3-dideoxy-glucuronic acid-2-epimerase, (2~{S},3~{S},4~{R},5~{R},6~{R})-4,5-diacetamido-6-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxane-2-carboxylic acid, URIDINE-5'-DIPHOSPHATE, ... (5 entities in total)
機能のキーワードlipopolysaccharide, o-antigen, 2-epimerase, isomerase
由来する生物種Thermus thermophilus HB27
タンパク質・核酸の鎖数2
化学式量合計86324.47
構造登録者
Thoden, J.B.,Holden, H.M. (登録日: 2023-05-25, 公開日: 2023-09-13, 最終更新日: 2023-10-18)
主引用文献Thoden, J.B.,McKnight, J.O.,Kroft, C.W.,Jast, J.D.T.,Holden, H.M.
Structural analysis of a bacterial UDP-sugar 2-epimerase reveals the active site architecture before and after catalysis.
J.Biol.Chem., 299:105200-105200, 2023
Cited by
PubMed: 37660908
DOI: 10.1016/j.jbc.2023.105200
主引用文献が同じPDBエントリー
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å)
構造検証レポート
Validation report summary of 8sy9
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221051

件を2024-06-12に公開中

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