8E33

E. coli 50S ribosome bound to compound streptogramin analog SAB001

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8E33 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb8e33/pdb
• EMDBエントリー: 27852 27854 27855 27857 27858
• 分子名称: 23S ribosomal RNA, 50S ribosomal protein L34, N-{(4R,6R,9S,10R,13S,15aS,17R,20R,22S,24aS)-22-benzyl-6-[2-(4-{[(3R,4R,5E,10E,12E,14S,16R,23S,26aR)-16-fluoro-14-hydroxy-12-methyl-1,7,22-trioxo-3-(propan-2-yl)-4,7,8,9,14,15,16,17,24,25,26,26a-dodecahydro-1H,3H,22H-21,18-(azeno)pyrrolo[2,1-c][1,8,4,19]dioxadiazacyclotetracosin-4-yl]methyl}-1H-1,2,3-triazol-1-yl)ethyl]-17-hydroxy-10,23-dimethyl-5,8,12,15,21,24-hexaoxo-13-phenyldocosahydro-12H-pyrido[2,1-f]pyrrolo[2,1-l][1,4,7,10,13,16]oxapentaazacyclononadecin-9-yl}-3-hydroxypyridine-2-carboxamide, ... (12 entities in total)
• 機能のキーワード: e. coli ribosome, streptogramin a, streptogramin b, antibiotics, ribosome-antibiotic complex, ribosome/antibiotic
• 由来する生物種: Escherichia coli; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 10
• 化学式量合計: 1110500.37

構造登録者

Pellegrino, J.,Lee, D.J.,Fraser, J.S.,Seiple, I.B. (登録日: 2022-08-16, 公開日: 2023-06-28, 最終更新日: 2025-03-19)

• 主引用文献: Takahashi, Y.,Pellegrino, J.,Lee, D.J.,Fraser, J.S.,Seiple, I.B.; Potential for clicked streptogramin analogs; To Be Published,

実験手法

ELECTRON MICROSCOPY (2.23 Å)