7XDJ

Crystal structure of actinomycin D-echinomycin-d(AGCGCGT/ACGAGCT) complex

7XDJ の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb7xdj/pdb
• 関連するBIRD辞書のPRD_ID: PRD_000001 PRD_000491
• 分子名称: DNA (5'-D(P*AP*GP*CP*GP*CP*GP*T)-3'), DNA (5'-D(P*AP*CP*GP*AP*GP*CP*(BRU))-3'), DSN-ALA-N2C-MVA-DSN-ALA-NCY-MVA, ... (8 entities in total)
• 機能のキーワード: g:a mismatch, single-strand dna twist, mismatch binding antibiotic, dna, dna-antibiotic complex, dna/antibiotic
• 由来する生物種: Streptomyces; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 16
• 化学式量合計: 27149.21

構造登録者

Chien, C.M.,Satange, R.B.,Hou, M.H. (登録日: 2022-03-27, 公開日: 2022-12-14, 最終更新日: 2023-11-29)

• 主引用文献: Satange, R.,Kao, S.H.,Chien, C.M.,Chou, S.H.,Lin, C.C.,Neidle, S.,Hou, M.H.; Staggered intercalation of DNA duplexes with base-pair modulation by two distinct drug molecules induces asymmetric backbone twisting and structure polymorphism.; Nucleic Acids Res., 50:8867-8881, 2022; PubMed: 35871296; DOI: 10.1093/nar/gkac629

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.435 Å)