7E9E
Crystal structure of a class I PreQ1 riboswitch aptamer (ab13-14) complexed with a cognate ligand-derived photoaffinity probe
7E9E の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb7e9e/pdb |
分子名称 | 33-mer RNA, 2-azanyl-5-[[2-(3-but-3-ynyl-1,2-diazirin-3-yl)ethylamino]methyl]-1,7-dihydropyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-one, SULFATE ION, ... (5 entities in total) |
機能のキーワード | preq1 riboswitch, cognate ligand-derived photoaffinity probe, rna |
由来する生物種 | Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis |
タンパク質・核酸の鎖数 | 1 |
化学式量合計 | 10897.57 |
構造登録者 | |
主引用文献 | Balaratnam, S.,Rhodes, C.,Bume, D.D.,Connelly, C.,Lai, C.C.,Kelley, J.A.,Yazdani, K.,Homan, P.J.,Incarnato, D.,Numata, T.,Schneekloth Jr., J.S. A chemical probe based on the PreQ 1 metabolite enables transcriptome-wide mapping of binding sites. Nat Commun, 12:5856-5856, 2021 Cited by PubMed: 34615874DOI: 10.1038/s41467-021-25973-x 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.57 Å) |
構造検証レポート
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